RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623103.1

C9orf62-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 62, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf62, Length 1,924 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62-201ENST00000623103 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.95■■□□□ 1.74
C9orf62-201ENST00000623103 PBRM1Q86U86 1689 aa25.94■■□□□ 1.74
C9orf62-201ENST00000623103 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
C9orf62-201ENST00000623103 GRIN2BQ13224 1484 aa25.94■■□□□ 1.74
C9orf62-201ENST00000623103 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
C9orf62-201ENST00000623103 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.86■■□□□ 1.73
C9orf62-201ENST00000623103 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.84■■□□□ 1.73
C9orf62-201ENST00000623103 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
C9orf62-201ENST00000623103 ADAMTS12P58397 1594 aa25.81■■□□□ 1.72
C9orf62-201ENST00000623103 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.75■■□□□ 1.71
C9orf62-201ENST00000623103 SYNJ2O15056 1496 aa25.72■■□□□ 1.71
C9orf62-201ENST00000623103 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.71■■□□□ 1.71
C9orf62-201ENST00000623103 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
C9orf62-201ENST00000623103 MAP3K1Q13233 1512 aa25.68■■□□□ 1.7
C9orf62-201ENST00000623103 TIAM1Q13009 1591 aa25.67■■□□□ 1.7
C9orf62-201ENST00000623103 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
C9orf62-201ENST00000623103 GRIN2AQ12879 1464 aa25.64■■□□□ 1.7
C9orf62-201ENST00000623103 CHD1O14646 1710 aa25.63■■□□□ 1.69
C9orf62-201ENST00000623103 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.63■■□□□ 1.69
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C9orf62-201ENST00000623103 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
C9orf62-201ENST00000623103 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
C9orf62-201ENST00000623103 NUP160Q12769 1436 aa25.55■■□□□ 1.68
C9orf62-201ENST00000623103 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.54■■□□□ 1.68
C9orf62-201ENST00000623103 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.53■■□□□ 1.68
C9orf62-201ENST00000623103 FBLN2P98095 1184 aa25.53■■□□□ 1.68
C9orf62-201ENST00000623103 CEP170Q5SW79 1584 aa25.53■■□□□ 1.68
C9orf62-201ENST00000623103 P3H3Q8IVL6 736 aa25.51■■□□□ 1.67
C9orf62-201ENST00000623103 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.51■■□□□ 1.67
C9orf62-201ENST00000623103 SAMD9Q5K651 1589 aa25.51■■□□□ 1.67
C9orf62-201ENST00000623103 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.48■■□□□ 1.67
C9orf62-201ENST00000623103 FMN1Q68DA7 1419 aa25.46■■□□□ 1.67
C9orf62-201ENST00000623103 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.46■■□□□ 1.67
C9orf62-201ENST00000623103 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.42■■□□□ 1.66
C9orf62-201ENST00000623103 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.4■■□□□ 1.66
C9orf62-201ENST00000623103 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
C9orf62-201ENST00000623103 OSCARQ8IYS5 282 aa25.35■■□□□ 1.65
C9orf62-201ENST00000623103 IQGAP2Q13576 1575 aa25.35■■□□□ 1.65
C9orf62-201ENST00000623103 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
C9orf62-201ENST00000623103 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.31■■□□□ 1.64
C9orf62-201ENST00000623103 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.29■■□□□ 1.64
C9orf62-201ENST00000623103 SHROOM2Q13796 1616 aa25.29■■□□□ 1.64
C9orf62-201ENST00000623103 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.28■■□□□ 1.64
C9orf62-201ENST00000623103 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
C9orf62-201ENST00000623103 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.25■■□□□ 1.63
C9orf62-201ENST00000623103 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
C9orf62-201ENST00000623103 ITGAEP38570 1179 aa25.22■■□□□ 1.63
C9orf62-201ENST00000623103 JPH4Q96JJ6 628 aa25.22■■□□□ 1.63
C9orf62-201ENST00000623103 HECW1Q76N89 1606 aa25.19■■□□□ 1.62
C9orf62-201ENST00000623103 DISP1Q96F81 1524 aa25.19■■□□□ 1.62
C9orf62-201ENST00000623103 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.19■■□□□ 1.62
C9orf62-201ENST00000623103 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
C9orf62-201ENST00000623103 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.17■■□□□ 1.62
C9orf62-201ENST00000623103 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.17■■□□□ 1.62
C9orf62-201ENST00000623103 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.16■■□□□ 1.62
C9orf62-201ENST00000623103 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
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C9orf62-201ENST00000623103 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
C9orf62-201ENST00000623103 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.1■■□□□ 1.61
C9orf62-201ENST00000623103 KIAA0556O60303 1618 aa25.1■■□□□ 1.61
C9orf62-201ENST00000623103 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.09■■□□□ 1.61
C9orf62-201ENST00000623103 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.09■■□□□ 1.61
C9orf62-201ENST00000623103 NCOA2Q15596 1464 aa25.06■■□□□ 1.6
C9orf62-201ENST00000623103 ARHGEF11O15085 1522 aa25.04■■□□□ 1.6
C9orf62-201ENST00000623103 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.01■■□□□ 1.59
C9orf62-201ENST00000623103 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
C9orf62-201ENST00000623103 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25■■□□□ 1.59
C9orf62-201ENST00000623103 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.99■■□□□ 1.59
C9orf62-201ENST00000623103 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
C9orf62-201ENST00000623103 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.97■■□□□ 1.59
C9orf62-201ENST00000623103 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.97■■□□□ 1.59
C9orf62-201ENST00000623103 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.97■■□□□ 1.59
C9orf62-201ENST00000623103 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.96■■□□□ 1.59
C9orf62-201ENST00000623103 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
C9orf62-201ENST00000623103 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
C9orf62-201ENST00000623103 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
C9orf62-201ENST00000623103 MAPKBP1O60336 1514 aa24.94■■□□□ 1.58
C9orf62-201ENST00000623103 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.93■■□□□ 1.58
C9orf62-201ENST00000623103 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.92■■□□□ 1.58
C9orf62-201ENST00000623103 PTPRGP23470 1445 aa24.87■■□□□ 1.57
C9orf62-201ENST00000623103 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
C9orf62-201ENST00000623103 HFM1A2PYH4 1435 aa24.83■■□□□ 1.57
C9orf62-201ENST00000623103 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.82■■□□□ 1.56
C9orf62-201ENST00000623103 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
C9orf62-201ENST00000623103 NEUROD1Q13562 356 aa24.82■■□□□ 1.56
C9orf62-201ENST00000623103 ABCA8O94911 1581 aa24.81■■□□□ 1.56
C9orf62-201ENST00000623103 PTPRKQ15262 1439 aa24.79■■□□□ 1.56
C9orf62-201ENST00000623103 MIA2Q96PC5 1412 aa24.79■■□□□ 1.56
C9orf62-201ENST00000623103 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.77■■□□□ 1.56
C9orf62-201ENST00000623103 ARID3CA6NKF2 412 aa24.76■■□□□ 1.55
C9orf62-201ENST00000623103 UACAQ9BZF9 1416 aa24.75■■□□□ 1.55
C9orf62-201ENST00000623103 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
C9orf62-201ENST00000623103 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.73■■□□□ 1.55
C9orf62-201ENST00000623103 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.73■■□□□ 1.55
C9orf62-201ENST00000623103 NAIPQ13075 1403 aa24.72■■□□□ 1.55
C9orf62-201ENST00000623103 ABCC2Q92887 1545 aa24.72■■□□□ 1.55
C9orf62-201ENST00000623103 MIER1Q8N108 512 aa24.72■■□□□ 1.55
C9orf62-201ENST00000623103 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.7■■□□□ 1.54
C9orf62-201ENST00000623103 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.69■■□□□ 1.54
C9orf62-201ENST00000623103 AKNAQ7Z591 1439 aa24.68■■□□□ 1.54
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