RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623103.1

C9orf62-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 62, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf62, Length 1,924 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62-201ENST00000623103 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.95■■■■□ 3.51
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C9orf62-201ENST00000623103 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.16■■■□□ 2.58
C9orf62-201ENST00000623103 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.7■■■□□ 2.5
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C9orf62-201ENST00000623103 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.51■■■□□ 2.48
C9orf62-201ENST00000623103 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.45■■■□□ 2.47
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C9orf62-201ENST00000623103 SCRIBQ14160 1630 aa29.75■■■□□ 2.35
C9orf62-201ENST00000623103 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.75■■■□□ 2.35
C9orf62-201ENST00000623103 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.53■■■□□ 2.32
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C9orf62-201ENST00000623103 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.82■■■□□ 2.2
C9orf62-201ENST00000623103 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.78■■■□□ 2.2
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C9orf62-201ENST00000623103 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.58■■■□□ 2.17
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C9orf62-201ENST00000623103 SMARCA4P51532 1647 aa28.54■■■□□ 2.16
C9orf62-201ENST00000623103 WIZO95785 1651 aa28.46■■■□□ 2.15
C9orf62-201ENST00000623103 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.35■■■□□ 2.13
C9orf62-201ENST00000623103 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.31■■■□□ 2.12
C9orf62-201ENST00000623103 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.29■■■□□ 2.12
C9orf62-201ENST00000623103 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.25■■■□□ 2.11
C9orf62-201ENST00000623103 SMARCA2P51531 1590 aa28.17■■■□□ 2.1
C9orf62-201ENST00000623103 NCAPD3P42695 1498 aa28.14■■■□□ 2.1
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C9orf62-201ENST00000623103 TRIM41Q8WV44 630 aa27.98■■■□□ 2.07
C9orf62-201ENST00000623103 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
C9orf62-201ENST00000623103 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.82■■■□□ 2.04
C9orf62-201ENST00000623103 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.79■■■□□ 2.04
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C9orf62-201ENST00000623103 ABCC8Q09428 1581 aa27.53■■■□□ 2
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C9orf62-201ENST00000623103 CFTRP13569 1480 aa27.32■■□□□ 1.96
C9orf62-201ENST00000623103 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.32■■□□□ 1.96
C9orf62-201ENST00000623103 NESP48681 1621 aa27.31■■□□□ 1.96
C9orf62-201ENST00000623103 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.24■■□□□ 1.95
C9orf62-201ENST00000623103 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.21■■□□□ 1.95
C9orf62-201ENST00000623103 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.19■■□□□ 1.94
C9orf62-201ENST00000623103 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
C9orf62-201ENST00000623103 EEA1Q15075 1411 aa27.15■■□□□ 1.94
C9orf62-201ENST00000623103 SYNJ1O43426 1573 aa27.11■■□□□ 1.93
C9orf62-201ENST00000623103 PRDM2Q13029 1718 aa27.1■■□□□ 1.93
C9orf62-201ENST00000623103 SOGA1O94964 1423 aa27.08■■□□□ 1.93
C9orf62-201ENST00000623103 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.99■■□□□ 1.91
C9orf62-201ENST00000623103 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.99■■□□□ 1.91
C9orf62-201ENST00000623103 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.97■■□□□ 1.91
C9orf62-201ENST00000623103 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.95■■□□□ 1.9
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C9orf62-201ENST00000623103 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.92■■□□□ 1.9
C9orf62-201ENST00000623103 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.92■■□□□ 1.9
C9orf62-201ENST00000623103 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.87■■□□□ 1.89
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C9orf62-201ENST00000623103 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.83■■□□□ 1.89
C9orf62-201ENST00000623103 ERCC6Q03468 1493 aa26.82■■□□□ 1.88
C9orf62-201ENST00000623103 KIF21BO75037 1637 aa26.82■■□□□ 1.88
C9orf62-201ENST00000623103 CEP162Q5TB80 1403 aa26.8■■□□□ 1.88
C9orf62-201ENST00000623103 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
C9orf62-201ENST00000623103 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
C9orf62-201ENST00000623103 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.73■■□□□ 1.87
C9orf62-201ENST00000623103 CUX1P39880 1505 aa26.72■■□□□ 1.87
C9orf62-201ENST00000623103 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
C9orf62-201ENST00000623103 WDR62O43379 1518 aa26.67■■□□□ 1.86
C9orf62-201ENST00000623103 TOPBP1Q92547 1522 aa26.66■■□□□ 1.86
C9orf62-201ENST00000623103 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.65■■□□□ 1.86
C9orf62-201ENST00000623103 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
C9orf62-201ENST00000623103 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
C9orf62-201ENST00000623103 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.51■■□□□ 1.83
C9orf62-201ENST00000623103 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.49■■□□□ 1.83
C9orf62-201ENST00000623103 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
C9orf62-201ENST00000623103 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.49■■□□□ 1.83
C9orf62-201ENST00000623103 CUX2O14529 1486 aa26.47■■□□□ 1.83
C9orf62-201ENST00000623103 KIF27Q86VH2 1401 aa26.46■■□□□ 1.83
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C9orf62-201ENST00000623103 PRXQ9BXM0 1461 aa26.41■■□□□ 1.82
C9orf62-201ENST00000623103 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.37■■□□□ 1.81
C9orf62-201ENST00000623103 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
C9orf62-201ENST00000623103 IFT140Q96RY7 1462 aa26.28■■□□□ 1.8
C9orf62-201ENST00000623103 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.28■■□□□ 1.8
C9orf62-201ENST00000623103 WDR97A6NE52 1622 aa26.28■■□□□ 1.8
C9orf62-201ENST00000623103 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.27■■□□□ 1.8
C9orf62-201ENST00000623103 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
C9orf62-201ENST00000623103 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
C9orf62-201ENST00000623103 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
C9orf62-201ENST00000623103 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
C9orf62-201ENST00000623103 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.13■■□□□ 1.77
C9orf62-201ENST00000623103 APLP2Q06481 763 aa26.11■■□□□ 1.77
C9orf62-201ENST00000623103 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.11■■□□□ 1.77
C9orf62-201ENST00000623103 IGF1RP08069 1367 aa26.1■■□□□ 1.77
C9orf62-201ENST00000623103 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
C9orf62-201ENST00000623103 ARAP1Q96P48 1450 aa26.08■■□□□ 1.77
C9orf62-201ENST00000623103 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.04■■□□□ 1.76
C9orf62-201ENST00000623103 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.02■■□□□ 1.76
C9orf62-201ENST00000623103 CUL7Q14999 1698 aa25.97■■□□□ 1.75
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