RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622834.4

ITGBL1-207, Transcript of integrin subunit beta like 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ITGBL1, Length 2,369 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGBL1-207ENST00000622834 ARAP1Q96P48 1450 aa23.04■■□□□ 1.28
ITGBL1-207ENST00000622834 CUL7Q14999 1698 aa23.04■■□□□ 1.28
ITGBL1-207ENST00000622834 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
ITGBL1-207ENST00000622834 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
ITGBL1-207ENST00000622834 PBRM1Q86U86 1689 aa23■■□□□ 1.27
ITGBL1-207ENST00000622834 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23■■□□□ 1.27
ITGBL1-207ENST00000622834 P3H3Q8IVL6 736 aa22.97■■□□□ 1.27
ITGBL1-207ENST00000622834 IFT140Q96RY7 1462 aa22.93■■□□□ 1.26
ITGBL1-207ENST00000622834 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.92■■□□□ 1.26
ITGBL1-207ENST00000622834 APLP2Q06481 763 aa22.9■■□□□ 1.26
ITGBL1-207ENST00000622834 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
ITGBL1-207ENST00000622834 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
ITGBL1-207ENST00000622834 GRIN2BQ13224 1484 aa22.84■■□□□ 1.25
ITGBL1-207ENST00000622834 BCL11AQ9H165 835 aa22.83■■□□□ 1.24
ITGBL1-207ENST00000622834 ADAMTS12P58397 1594 aa22.82■■□□□ 1.24
ITGBL1-207ENST00000622834 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.81■■□□□ 1.24
ITGBL1-207ENST00000622834 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.79■■□□□ 1.24
ITGBL1-207ENST00000622834 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
ITGBL1-207ENST00000622834 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.78■■□□□ 1.24
ITGBL1-207ENST00000622834 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
ITGBL1-207ENST00000622834 FBLN2P98095 1184 aa22.7■■□□□ 1.22
ITGBL1-207ENST00000622834 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
ITGBL1-207ENST00000622834 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.67■■□□□ 1.22
ITGBL1-207ENST00000622834 SAMD9Q5K651 1589 aa22.63■■□□□ 1.21
ITGBL1-207ENST00000622834 IQGAP2Q13576 1575 aa22.63■■□□□ 1.21
ITGBL1-207ENST00000622834 GRIN2AQ12879 1464 aa22.62■■□□□ 1.21
ITGBL1-207ENST00000622834 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
ITGBL1-207ENST00000622834 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
ITGBL1-207ENST00000622834 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
ITGBL1-207ENST00000622834 TIAM1Q13009 1591 aa22.59■■□□□ 1.21
ITGBL1-207ENST00000622834 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
ITGBL1-207ENST00000622834 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.58■■□□□ 1.21
ITGBL1-207ENST00000622834 SYNJ2O15056 1496 aa22.54■■□□□ 1.2
ITGBL1-207ENST00000622834 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
ITGBL1-207ENST00000622834 CEP170Q5SW79 1584 aa22.52■■□□□ 1.2
ITGBL1-207ENST00000622834 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.52■■□□□ 1.2
ITGBL1-207ENST00000622834 FMN1Q68DA7 1419 aa22.52■■□□□ 1.2
ITGBL1-207ENST00000622834 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.51■■□□□ 1.19
ITGBL1-207ENST00000622834 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.51■■□□□ 1.19
ITGBL1-207ENST00000622834 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.5■■□□□ 1.19
ITGBL1-207ENST00000622834 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.49■■□□□ 1.19
ITGBL1-207ENST00000622834 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.49■■□□□ 1.19
ITGBL1-207ENST00000622834 ARID3CA6NKF2 412 aa22.48■■□□□ 1.19
ITGBL1-207ENST00000622834 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.45■■□□□ 1.18
ITGBL1-207ENST00000622834 MAP3K1Q13233 1512 aa22.45■■□□□ 1.18
ITGBL1-207ENST00000622834 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.44■■□□□ 1.18
ITGBL1-207ENST00000622834 DISP1Q96F81 1524 aa22.42■■□□□ 1.18
ITGBL1-207ENST00000622834 ITGAEP38570 1179 aa22.4■■□□□ 1.18
ITGBL1-207ENST00000622834 KIAA0556O60303 1618 aa22.4■■□□□ 1.18
ITGBL1-207ENST00000622834 CHD1O14646 1710 aa22.4■■□□□ 1.18
ITGBL1-207ENST00000622834 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.39■■□□□ 1.17
ITGBL1-207ENST00000622834 NUP160Q12769 1436 aa22.37■■□□□ 1.17
ITGBL1-207ENST00000622834 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
ITGBL1-207ENST00000622834 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
ITGBL1-207ENST00000622834 JPH4Q96JJ6 628 aa22.34■■□□□ 1.17
ITGBL1-207ENST00000622834 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.34■■□□□ 1.17
ITGBL1-207ENST00000622834 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
ITGBL1-207ENST00000622834 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.33■■□□□ 1.16
ITGBL1-207ENST00000622834 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
ITGBL1-207ENST00000622834 HECW1Q76N89 1606 aa22.29■■□□□ 1.16
ITGBL1-207ENST00000622834 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
ITGBL1-207ENST00000622834 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.29■■□□□ 1.16
ITGBL1-207ENST00000622834 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
ITGBL1-207ENST00000622834 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
ITGBL1-207ENST00000622834 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.23■■□□□ 1.15
ITGBL1-207ENST00000622834 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.21■■□□□ 1.15
ITGBL1-207ENST00000622834 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.21■■□□□ 1.15
ITGBL1-207ENST00000622834 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.21■■□□□ 1.15
ITGBL1-207ENST00000622834 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
ITGBL1-207ENST00000622834 NCOA2Q15596 1464 aa22.2■■□□□ 1.14
ITGBL1-207ENST00000622834 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.19■■□□□ 1.14
ITGBL1-207ENST00000622834 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
ITGBL1-207ENST00000622834 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
ITGBL1-207ENST00000622834 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.17■■□□□ 1.14
ITGBL1-207ENST00000622834 MIER1Q8N108 512 aa22.14■■□□□ 1.14
ITGBL1-207ENST00000622834 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
ITGBL1-207ENST00000622834 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.13■■□□□ 1.13
ITGBL1-207ENST00000622834 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.11■■□□□ 1.13
ITGBL1-207ENST00000622834 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.08■■□□□ 1.13
ITGBL1-207ENST00000622834 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.06■■□□□ 1.12
ITGBL1-207ENST00000622834 ARHGEF11O15085 1522 aa22.05■■□□□ 1.12
ITGBL1-207ENST00000622834 SHROOM2Q13796 1616 aa22.04■■□□□ 1.12
ITGBL1-207ENST00000622834 PTPRGP23470 1445 aa22.03■■□□□ 1.12
ITGBL1-207ENST00000622834 ABCA8O94911 1581 aa22.02■■□□□ 1.12
ITGBL1-207ENST00000622834 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.02■■□□□ 1.12
ITGBL1-207ENST00000622834 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.02■■□□□ 1.12
ITGBL1-207ENST00000622834 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
ITGBL1-207ENST00000622834 PTPRKQ15262 1439 aa21.99■■□□□ 1.11
ITGBL1-207ENST00000622834 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.98■■□□□ 1.11
ITGBL1-207ENST00000622834 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
ITGBL1-207ENST00000622834 KIF14Q15058 1648 aa21.97■■□□□ 1.11
ITGBL1-207ENST00000622834 ATP10BO94823 1461 aa21.96■■□□□ 1.11
ITGBL1-207ENST00000622834 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.95■■□□□ 1.1
ITGBL1-207ENST00000622834 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.94■■□□□ 1.1
ITGBL1-207ENST00000622834 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.94■■□□□ 1.1
ITGBL1-207ENST00000622834 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
ITGBL1-207ENST00000622834 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
ITGBL1-207ENST00000622834 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.89■■□□□ 1.09
ITGBL1-207ENST00000622834 UACAQ9BZF9 1416 aa21.87■■□□□ 1.09
ITGBL1-207ENST00000622834 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms