RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617904.4

TRAPPC3-210, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-210ENST00000617904 JPH4Q96JJ6 628 aa27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC3-210ENST00000617904 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC3-210ENST00000617904 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC3-210ENST00000617904 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC3-210ENST00000617904 IGF1RP08069 1367 aa26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC3-210ENST00000617904 KIF27Q86VH2 1401 aa26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC3-210ENST00000617904 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.89■■□□□ 1.89
TRAPPC3-210ENST00000617904 CUL7Q14999 1698 aa26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC3-210ENST00000617904 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC3-210ENST00000617904 GOLGA3Q08378 1498 aa26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC3-210ENST00000617904 KIF21BO75037 1637 aa26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC3-210ENST00000617904 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC3-210ENST00000617904 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC3-210ENST00000617904 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC3-210ENST00000617904 MAPKBP1O60336 1514 aa26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC3-210ENST00000617904 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC3-210ENST00000617904 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC3-210ENST00000617904 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC3-210ENST00000617904 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC3-210ENST00000617904 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC3-210ENST00000617904 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.7■■□□□ 1.87
TRAPPC3-210ENST00000617904 DIP2BQ9P265 1576 aa26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC3-210ENST00000617904 PTPRGP23470 1445 aa26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC3-210ENST00000617904 PRXQ9BXM0 1461 aa26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC3-210ENST00000617904 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC3-210ENST00000617904 IQGAP2Q13576 1575 aa26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC3-210ENST00000617904 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC3-210ENST00000617904 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC3-210ENST00000617904 ABCC2Q92887 1545 aa26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC3-210ENST00000617904 DISP1Q96F81 1524 aa26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC3-210ENST00000617904 CEP162Q5TB80 1403 aa26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC3-210ENST00000617904 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC3-210ENST00000617904 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.45■■□□□ 1.83
TRAPPC3-210ENST00000617904 TSPOAP1O95153 1857 aa26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC3-210ENST00000617904 UACAQ9BZF9 1416 aa26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC3-210ENST00000617904 ASXL2Q76L83 1435 aa26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC3-210ENST00000617904 KDM6BO15054 1643 aa26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC3-210ENST00000617904 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC3-210ENST00000617904 KIAA0556O60303 1618 aa26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC3-210ENST00000617904 GLI2P10070 1586 aa26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC3-210ENST00000617904 CLIP1P30622 1438 aa26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC3-210ENST00000617904 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC3-210ENST00000617904 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC3-210ENST00000617904 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC3-210ENST00000617904 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC3-210ENST00000617904 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC3-210ENST00000617904 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC3-210ENST00000617904 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC3-210ENST00000617904 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC3-210ENST00000617904 ABCA8O94911 1581 aa26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC3-210ENST00000617904 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC3-210ENST00000617904 APLP2Q06481 763 aa26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC3-210ENST00000617904 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC3-210ENST00000617904 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC3-210ENST00000617904 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC3-210ENST00000617904 KCNH8Q96L42 1107 aa26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC3-210ENST00000617904 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26■■□□□ 1.75
TRAPPC3-210ENST00000617904 CD109Q6YHK3 1445 aa26■■□□□ 1.75
TRAPPC3-210ENST00000617904 P3H3Q8IVL6 736 aa26■■□□□ 1.75
TRAPPC3-210ENST00000617904 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC3-210ENST00000617904 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC3-210ENST00000617904 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC3-210ENST00000617904 ADGRL1O94910 1474 aa25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC3-210ENST00000617904 ATP10BO94823 1461 aa25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC3-210ENST00000617904 SAMD9Q5K651 1589 aa25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC3-210ENST00000617904 ARID3CA6NKF2 412 aa25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC3-210ENST00000617904 FMN1Q68DA7 1419 aa25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC3-210ENST00000617904 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC3-210ENST00000617904 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC3-210ENST00000617904 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC3-210ENST00000617904 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC3-210ENST00000617904 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC3-210ENST00000617904 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC3-210ENST00000617904 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC3-210ENST00000617904 MAP3K1Q13233 1512 aa25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC3-210ENST00000617904 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC3-210ENST00000617904 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC3-210ENST00000617904 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC3-210ENST00000617904 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC3-210ENST00000617904 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC3-210ENST00000617904 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC3-210ENST00000617904 NEO1Q92859 1461 aa25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC3-210ENST00000617904 RAPGEF3O95398 923 aa25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC3-210ENST00000617904 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC3-210ENST00000617904 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC3-210ENST00000617904 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC3-210ENST00000617904 TIAM1Q13009 1591 aa25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC3-210ENST00000617904 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.58■■□□□ 1.69
TRAPPC3-210ENST00000617904 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC3-210ENST00000617904 HECW1Q76N89 1606 aa25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC3-210ENST00000617904 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC3-210ENST00000617904 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC3-210ENST00000617904 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC3-210ENST00000617904 AKNAQ7Z591 1439 aa25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC3-210ENST00000617904 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC3-210ENST00000617904 FANCAO15360 1455 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC3-210ENST00000617904 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC3-210ENST00000617904 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC3-210ENST00000617904 RICTORQ6R327 1708 aa25.47■■□□□ 1.67
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