RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615330.4

RASGEF1C-207, Transcript of RasGEF domain family member 1C, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RASGEF1C, Length 2,268 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1C-207ENST00000615330 P3H3Q8IVL6 736 aa43.42■■■■■ 4.54
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RASGEF1C-207ENST00000615330 ADAMTS12P58397 1594 aa43.34■■■■■ 4.53
RASGEF1C-207ENST00000615330 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.33■■■■■ 4.53
RASGEF1C-207ENST00000615330 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.3■■■■■ 4.52
RASGEF1C-207ENST00000615330 APLP2Q06481 763 aa43.27■■■■■ 4.52
RASGEF1C-207ENST00000615330 FHOD3Q2V2M9 1422 aa43.15■■■■■ 4.5
RASGEF1C-207ENST00000615330 FBLN2P98095 1184 aa43.12■■■■■ 4.49
RASGEF1C-207ENST00000615330 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.04■■■■■ 4.48
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RASGEF1C-207ENST00000615330 EFCAB5A4FU69 1503 aa43■■■■■ 4.47
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RASGEF1C-207ENST00000615330 SAMD9Q5K651 1589 aa42.88■■■■■ 4.46
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RASGEF1C-207ENST00000615330 CEP170Q5SW79 1584 aa42.77■■■■■ 4.44
RASGEF1C-207ENST00000615330 HRCP23327 699 aa42.72■■■■■ 4.43
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RASGEF1C-207ENST00000615330 TIAM1Q13009 1591 aa42.69■■■■■ 4.42
RASGEF1C-207ENST00000615330 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.67■■■■■ 4.42
RASGEF1C-207ENST00000615330 FYCO1Q9BQS8 1478 aa42.64■■■■■ 4.42
RASGEF1C-207ENST00000615330 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.64■■■■■ 4.42
RASGEF1C-207ENST00000615330 NUP160Q12769 1436 aa42.6■■■■■ 4.41
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RASGEF1C-207ENST00000615330 CHD1O14646 1710 aa42.48■■■■■ 4.39
RASGEF1C-207ENST00000615330 ARID3CA6NKF2 412 aa42.48■■■■■ 4.39
RASGEF1C-207ENST00000615330 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa42.46■■■■■ 4.39
RASGEF1C-207ENST00000615330 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.41■■■■■ 4.38
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RASGEF1C-207ENST00000615330 MTUS2Q5JR59 1369 aa42.26■■■■■ 4.36
RASGEF1C-207ENST00000615330 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP42.25■■■■■ 4.35
RASGEF1C-207ENST00000615330 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.24■■■■■ 4.35
RASGEF1C-207ENST00000615330 HECW1Q76N89 1606 aa42.23■■■■■ 4.35
RASGEF1C-207ENST00000615330 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.22■■■■■ 4.35
RASGEF1C-207ENST00000615330 CCNB3Q8WWL7 1395 aa42.21■■■■■ 4.35
RASGEF1C-207ENST00000615330 ITGAEP38570 1179 aa42.2■■■■■ 4.35
RASGEF1C-207ENST00000615330 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP42.19■■■■■ 4.35
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RASGEF1C-207ENST00000615330 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.16■■■■■ 4.34
RASGEF1C-207ENST00000615330 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.15■■■■■ 4.34
RASGEF1C-207ENST00000615330 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP42.15■■■■■ 4.34
RASGEF1C-207ENST00000615330 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.12■■■■■ 4.33
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RASGEF1C-207ENST00000615330 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP42.07■■■■■ 4.33
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RASGEF1C-207ENST00000615330 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa41.99■■■■■ 4.31
RASGEF1C-207ENST00000615330 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.96■■■■■ 4.31
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RASGEF1C-207ENST00000615330 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.86■■■■■ 4.29
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RASGEF1C-207ENST00000615330 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.8■■■■■ 4.28
RASGEF1C-207ENST00000615330 ARHGEF11O15085 1522 aa41.77■■■■■ 4.28
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RASGEF1C-207ENST00000615330 ATP10BO94823 1461 aa41.7■■■■■ 4.27
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RASGEF1C-207ENST00000615330 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.59■■■■■ 4.25
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RASGEF1C-207ENST00000615330 PTPRKQ15262 1439 aa41.54■■■■■ 4.24
RASGEF1C-207ENST00000615330 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa41.53■■■■■ 4.24
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RASGEF1C-207ENST00000615330 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.23
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RASGEF1C-207ENST00000615330 MIA2Q96PC5 1412 aa41.42■■■■■ 4.22
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RASGEF1C-207ENST00000615330 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.26■■■■■ 4.19
RASGEF1C-207ENST00000615330 KCNH8Q96L42 1107 aa41.25■■■■■ 4.19
RASGEF1C-207ENST00000615330 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.21■■■■■ 4.19
RASGEF1C-207ENST00000615330 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.2■■■■■ 4.19
RASGEF1C-207ENST00000615330 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.19■■■■■ 4.18
RASGEF1C-207ENST00000615330 HFM1A2PYH4 1435 aa41.19■■■■■ 4.18
RASGEF1C-207ENST00000615330 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.18■■■■■ 4.18
RASGEF1C-207ENST00000615330 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.18■■■■■ 4.18
RASGEF1C-207ENST00000615330 NAIPQ13075 1403 aa41.17■■■■■ 4.18
RASGEF1C-207ENST00000615330 DAPK1P53355 1430 aa41.15■■■■■ 4.18
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