RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.47■■■■□ 3.27
CAPNS1-212ENST00000591041 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.42■■■■□ 3.26
CAPNS1-212ENST00000591041 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.39■■■■□ 3.26
CAPNS1-212ENST00000591041 ARHGEF11O15085 1522 aa35.37■■■■□ 3.25
CAPNS1-212ENST00000591041 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.37■■■■□ 3.25
CAPNS1-212ENST00000591041 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.35■■■■□ 3.25
CAPNS1-212ENST00000591041 SYNJ2O15056 1496 aa35.33■■■■□ 3.25
CAPNS1-212ENST00000591041 APLP2Q06481 763 aa35.3■■■■□ 3.24
CAPNS1-212ENST00000591041 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.28■■■■□ 3.24
CAPNS1-212ENST00000591041 GRIN2AQ12879 1464 aa35.26■■■■□ 3.23
CAPNS1-212ENST00000591041 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.25■■■■□ 3.23
CAPNS1-212ENST00000591041 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.24■■■■□ 3.23
CAPNS1-212ENST00000591041 ARAP1Q96P48 1450 aa35.22■■■■□ 3.23
CAPNS1-212ENST00000591041 IQGAP2Q13576 1575 aa35.17■■■■□ 3.22
CAPNS1-212ENST00000591041 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.14■■■■□ 3.22
CAPNS1-212ENST00000591041 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP35.13■■■■□ 3.21
CAPNS1-212ENST00000591041 FBLN2P98095 1184 aa35.12■■■■□ 3.21
CAPNS1-212ENST00000591041 CHD1O14646 1710 aa35.11■■■■□ 3.21
CAPNS1-212ENST00000591041 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.08■■■■□ 3.21
CAPNS1-212ENST00000591041 FMN1Q68DA7 1419 aa35.06■■■■□ 3.2
CAPNS1-212ENST00000591041 SAMD9Q5K651 1589 aa35.04■■■■□ 3.2
CAPNS1-212ENST00000591041 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35■■■■□ 3.19
CAPNS1-212ENST00000591041 NUP160Q12769 1436 aa34.99■■■■□ 3.19
CAPNS1-212ENST00000591041 FHOD3Q2V2M9 1422 aa34.93■■■■□ 3.18
CAPNS1-212ENST00000591041 CEP170Q5SW79 1584 aa34.91■■■■□ 3.18
CAPNS1-212ENST00000591041 P3H3Q8IVL6 736 aa34.91■■■■□ 3.18
CAPNS1-212ENST00000591041 MAP3K1Q13233 1512 aa34.89■■■■□ 3.18
CAPNS1-212ENST00000591041 FYCO1Q9BQS8 1478 aa34.89■■■■□ 3.18
CAPNS1-212ENST00000591041 PCGF6Q9BYE7 350 aa34.87■■■■□ 3.17
CAPNS1-212ENST00000591041 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.86■■■■□ 3.17
CAPNS1-212ENST00000591041 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa34.85■■■■□ 3.17
CAPNS1-212ENST00000591041 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.77■■■■□ 3.16
CAPNS1-212ENST00000591041 KIAA0556O60303 1618 aa34.76■■■■□ 3.15
CAPNS1-212ENST00000591041 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP34.75■■■■□ 3.15
CAPNS1-212ENST00000591041 JPH4Q96JJ6 628 aa34.74■■■■□ 3.15
CAPNS1-212ENST00000591041 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.71■■■■□ 3.15
CAPNS1-212ENST00000591041 TIAM1Q13009 1591 aa34.7■■■■□ 3.15
CAPNS1-212ENST00000591041 DISP1Q96F81 1524 aa34.69■■■■□ 3.14
CAPNS1-212ENST00000591041 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.65■■■■□ 3.14
CAPNS1-212ENST00000591041 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.65■■■■□ 3.14
CAPNS1-212ENST00000591041 HECW1Q76N89 1606 aa34.64■■■■□ 3.14
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.64■■■■□ 3.14
CAPNS1-212ENST00000591041 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.58■■■■□ 3.13
CAPNS1-212ENST00000591041 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa34.54■■■■□ 3.12
CAPNS1-212ENST00000591041 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.51■■■■□ 3.12
CAPNS1-212ENST00000591041 SHROOM2Q13796 1616 aa34.51■■■■□ 3.11
CAPNS1-212ENST00000591041 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP34.48■■■■□ 3.11
CAPNS1-212ENST00000591041 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
CAPNS1-212ENST00000591041 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.45■■■■□ 3.11
CAPNS1-212ENST00000591041 MTUS2Q5JR59 1369 aa34.44■■■■□ 3.1
CAPNS1-212ENST00000591041 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.42■■■■□ 3.1
CAPNS1-212ENST00000591041 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.39■■■■□ 3.1
CAPNS1-212ENST00000591041 PTPRGP23470 1445 aa34.38■■■■□ 3.09
CAPNS1-212ENST00000591041 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.37■■■■□ 3.09
CAPNS1-212ENST00000591041 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
CAPNS1-212ENST00000591041 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.07
CAPNS1-212ENST00000591041 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.26■■■■□ 3.07
CAPNS1-212ENST00000591041 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.07
CAPNS1-212ENST00000591041 ABCA8O94911 1581 aa34.25■■■■□ 3.07
CAPNS1-212ENST00000591041 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.23■■■■□ 3.07
CAPNS1-212ENST00000591041 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
CAPNS1-212ENST00000591041 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.22■■■■□ 3.07
CAPNS1-212ENST00000591041 CCNB3Q8WWL7 1395 aa34.22■■■■□ 3.07
CAPNS1-212ENST00000591041 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
CAPNS1-212ENST00000591041 UACAQ9BZF9 1416 aa34.17■■■■□ 3.06
CAPNS1-212ENST00000591041 NCOA2Q15596 1464 aa34.12■■■■□ 3.05
CAPNS1-212ENST00000591041 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP34.1■■■■□ 3.05
CAPNS1-212ENST00000591041 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.09■■■■□ 3.05
CAPNS1-212ENST00000591041 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.09■■■■□ 3.05
CAPNS1-212ENST00000591041 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.07■■■■□ 3.04
CAPNS1-212ENST00000591041 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
CAPNS1-212ENST00000591041 MYOM3Q5VTT5 1437 aa34.04■■■■□ 3.04
CAPNS1-212ENST00000591041 ABCC2Q92887 1545 aa34.04■■■■□ 3.04
CAPNS1-212ENST00000591041 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.03■■■■□ 3.04
CAPNS1-212ENST00000591041 ARID3CA6NKF2 412 aa34.03■■■■□ 3.04
CAPNS1-212ENST00000591041 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.01■■■■□ 3.04
CAPNS1-212ENST00000591041 FGD6Q6ZV73 1430 aa34■■■■□ 3.03
CAPNS1-212ENST00000591041 ATP10BO94823 1461 aa34■■■■□ 3.03
CAPNS1-212ENST00000591041 MIA2Q96PC5 1412 aa33.96■■■■□ 3.03
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP33.96■■■■□ 3.03
CAPNS1-212ENST00000591041 ADCY10Q96PN6 1610 aa33.93■■■■□ 3.02
CAPNS1-212ENST00000591041 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
CAPNS1-212ENST00000591041 KIF14Q15058 1648 aa33.9■■■■□ 3.02
CAPNS1-212ENST00000591041 ITSN2Q9NZM3 1697 aa33.86■■■■□ 3.01
CAPNS1-212ENST00000591041 HRCP23327 699 aa33.85■■■■□ 3.01
CAPNS1-212ENST00000591041 PTPN23Q9H3S7 1636 aa33.82■■■■□ 3.01
CAPNS1-212ENST00000591041 KDM5BQ9UGL1 1544 aa33.81■■■■□ 3
CAPNS1-212ENST00000591041 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP33.8■■■■□ 3
CAPNS1-212ENST00000591041 ITGAEP38570 1179 aa33.76■■■□□ 2.99
CAPNS1-212ENST00000591041 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP33.76■■■□□ 2.99
CAPNS1-212ENST00000591041 KIF13AQ9H1H9 1805 aa33.74■■■□□ 2.99
CAPNS1-212ENST00000591041 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP33.74■■■□□ 2.99
CAPNS1-212ENST00000591041 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP33.74■■■□□ 2.99
CAPNS1-212ENST00000591041 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP33.71■■■□□ 2.99
CAPNS1-212ENST00000591041 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP33.66■■■□□ 2.98
CAPNS1-212ENST00000591041 ABCC10Q5T3U5 1492 aa33.63■■■□□ 2.97
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM69CQ0P6D2 419 aa33.63■■■□□ 2.97
CAPNS1-212ENST00000591041 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP33.62■■■□□ 2.97
CAPNS1-212ENST00000591041 SETD5Q9C0A6 1442 aa33.61■■■□□ 2.97
CAPNS1-212ENST00000591041 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa33.54■■■□□ 2.96
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