RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568252.1

MKRN3-203, Transcript of makorin ring finger protein 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MKRN3, Length 1,312 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3-203ENST00000568252 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.35■■□□□ 1.97
MKRN3-203ENST00000568252 SHROOM2Q13796 1616 aa27.3■■□□□ 1.96
MKRN3-203ENST00000568252 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.3■■□□□ 1.96
MKRN3-203ENST00000568252 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.25■■□□□ 1.95
MKRN3-203ENST00000568252 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.19■■□□□ 1.94
MKRN3-203ENST00000568252 JPH4Q96JJ6 628 aa27.18■■□□□ 1.94
MKRN3-203ENST00000568252 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.18■■□□□ 1.94
MKRN3-203ENST00000568252 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
MKRN3-203ENST00000568252 PRXQ9BXM0 1461 aa27.08■■□□□ 1.93
MKRN3-203ENST00000568252 IQGAP2Q13576 1575 aa27.05■■□□□ 1.92
MKRN3-203ENST00000568252 EEA1Q15075 1411 aa27.03■■□□□ 1.92
MKRN3-203ENST00000568252 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.01■■□□□ 1.91
MKRN3-203ENST00000568252 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.97■■□□□ 1.91
MKRN3-203ENST00000568252 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
MKRN3-203ENST00000568252 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.9■■□□□ 1.9
MKRN3-203ENST00000568252 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.89■■□□□ 1.89
MKRN3-203ENST00000568252 DISP1Q96F81 1524 aa26.87■■□□□ 1.89
MKRN3-203ENST00000568252 FOXD1Q16676 465 aa26.84■■□□□ 1.89
MKRN3-203ENST00000568252 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.82■■□□□ 1.88
MKRN3-203ENST00000568252 KIAA0556O60303 1618 aa26.81■■□□□ 1.88
MKRN3-203ENST00000568252 PTPRGP23470 1445 aa26.8■■□□□ 1.88
MKRN3-203ENST00000568252 KIF21BO75037 1637 aa26.8■■□□□ 1.88
MKRN3-203ENST00000568252 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.78■■□□□ 1.88
MKRN3-203ENST00000568252 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
MKRN3-203ENST00000568252 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
MKRN3-203ENST00000568252 GOLGA3Q08378 1498 aa26.72■■□□□ 1.87
MKRN3-203ENST00000568252 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.65■■□□□ 1.86
MKRN3-203ENST00000568252 UACAQ9BZF9 1416 aa26.63■■□□□ 1.85
MKRN3-203ENST00000568252 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.62■■□□□ 1.85
MKRN3-203ENST00000568252 SAMD9Q5K651 1589 aa26.61■■□□□ 1.85
MKRN3-203ENST00000568252 MAPKBP1O60336 1514 aa26.61■■□□□ 1.85
MKRN3-203ENST00000568252 ABCC2Q92887 1545 aa26.61■■□□□ 1.85
MKRN3-203ENST00000568252 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.6■■□□□ 1.85
MKRN3-203ENST00000568252 P3H3Q8IVL6 736 aa26.55■■□□□ 1.84
MKRN3-203ENST00000568252 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.53■■□□□ 1.84
MKRN3-203ENST00000568252 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.53■■□□□ 1.84
MKRN3-203ENST00000568252 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
MKRN3-203ENST00000568252 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
MKRN3-203ENST00000568252 ABCA8O94911 1581 aa26.51■■□□□ 1.83
MKRN3-203ENST00000568252 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.49■■□□□ 1.83
MKRN3-203ENST00000568252 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.48■■□□□ 1.83
MKRN3-203ENST00000568252 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
MKRN3-203ENST00000568252 DIP2BQ9P265 1576 aa26.46■■□□□ 1.83
MKRN3-203ENST00000568252 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.46■■□□□ 1.83
MKRN3-203ENST00000568252 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.43■■□□□ 1.82
MKRN3-203ENST00000568252 ASXL2Q76L83 1435 aa26.42■■□□□ 1.82
MKRN3-203ENST00000568252 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.4■■□□□ 1.82
MKRN3-203ENST00000568252 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.36■■□□□ 1.81
MKRN3-203ENST00000568252 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.33■■□□□ 1.8
MKRN3-203ENST00000568252 GLI2P10070 1586 aa26.29■■□□□ 1.8
MKRN3-203ENST00000568252 ATP10BO94823 1461 aa26.28■■□□□ 1.8
MKRN3-203ENST00000568252 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.28■■□□□ 1.8
MKRN3-203ENST00000568252 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
MKRN3-203ENST00000568252 ARID3CA6NKF2 412 aa26.27■■□□□ 1.8
MKRN3-203ENST00000568252 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
MKRN3-203ENST00000568252 TSPOAP1O95153 1857 aa26.25■■□□□ 1.79
MKRN3-203ENST00000568252 FMN1Q68DA7 1419 aa26.2■■□□□ 1.78
MKRN3-203ENST00000568252 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.18■■□□□ 1.78
MKRN3-203ENST00000568252 POTEDQ86YR6 584 aa26.17■■□□□ 1.78
MKRN3-203ENST00000568252 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
MKRN3-203ENST00000568252 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
MKRN3-203ENST00000568252 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
MKRN3-203ENST00000568252 KCNH8Q96L42 1107 aa26.14■■□□□ 1.78
MKRN3-203ENST00000568252 CLIP1P30622 1438 aa26.12■■□□□ 1.77
MKRN3-203ENST00000568252 HECW1Q76N89 1606 aa26.11■■□□□ 1.77
MKRN3-203ENST00000568252 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.1■■□□□ 1.77
MKRN3-203ENST00000568252 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
MKRN3-203ENST00000568252 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
MKRN3-203ENST00000568252 KDM6BO15054 1643 aa26.05■■□□□ 1.76
MKRN3-203ENST00000568252 CD109Q6YHK3 1445 aa26.04■■□□□ 1.76
MKRN3-203ENST00000568252 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.03■■□□□ 1.76
MKRN3-203ENST00000568252 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.03■■□□□ 1.76
MKRN3-203ENST00000568252 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
MKRN3-203ENST00000568252 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.02■■□□□ 1.76
MKRN3-203ENST00000568252 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.02■■□□□ 1.76
MKRN3-203ENST00000568252 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.01■■□□□ 1.75
MKRN3-203ENST00000568252 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26■■□□□ 1.75
MKRN3-203ENST00000568252 CEP162Q5TB80 1403 aa26■■□□□ 1.75
MKRN3-203ENST00000568252 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.99■■□□□ 1.75
MKRN3-203ENST00000568252 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.94■■□□□ 1.74
MKRN3-203ENST00000568252 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
MKRN3-203ENST00000568252 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.91■■□□□ 1.746e-6■■□□□ 13.3
MKRN3-203ENST00000568252 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.89■■□□□ 1.74
MKRN3-203ENST00000568252 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
MKRN3-203ENST00000568252 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.88■■□□□ 1.73
MKRN3-203ENST00000568252 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
MKRN3-203ENST00000568252 KIF14Q15058 1648 aa25.82■■□□□ 1.72
MKRN3-203ENST00000568252 NEO1Q92859 1461 aa25.79■■□□□ 1.72
MKRN3-203ENST00000568252 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.78■■□□□ 1.72
MKRN3-203ENST00000568252 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.77■■□□□ 1.72
MKRN3-203ENST00000568252 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.74■■□□□ 1.71
MKRN3-203ENST00000568252 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.73■■□□□ 1.71
MKRN3-203ENST00000568252 FANCAO15360 1455 aa25.73■■□□□ 1.71
MKRN3-203ENST00000568252 PLCH2O75038 1416 aa25.73■■□□□ 1.71
MKRN3-203ENST00000568252 AKNAQ7Z591 1439 aa25.69■■□□□ 1.7
MKRN3-203ENST00000568252 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.69■■□□□ 1.7
MKRN3-203ENST00000568252 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.64■■□□□ 1.7
MKRN3-203ENST00000568252 RAPGEF3O95398 923 aa25.63■■□□□ 1.69
MKRN3-203ENST00000568252 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.63■■□□□ 1.69
MKRN3-203ENST00000568252 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.62■■□□□ 1.69
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