RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566637.5

CTU2-208, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTU2, Length 1,619 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-208ENST00000566637 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.41■■■□□ 2.78
CTU2-208ENST00000566637 ARAP1Q96P48 1450 aa32.39■■■□□ 2.78
CTU2-208ENST00000566637 VPS8Q8N3P4 1428 aa32.39■■■□□ 2.78
CTU2-208ENST00000566637 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.38■■■□□ 2.77
CTU2-208ENST00000566637 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.36■■■□□ 2.77
CTU2-208ENST00000566637 IQGAP2Q13576 1575 aa32.32■■■□□ 2.77
CTU2-208ENST00000566637 FBLN2P98095 1184 aa32.29■■■□□ 2.76
CTU2-208ENST00000566637 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.26■■■□□ 2.75
CTU2-208ENST00000566637 CEP170Q5SW79 1584 aa32.23■■■□□ 2.75
CTU2-208ENST00000566637 SAMD9Q5K651 1589 aa32.23■■■□□ 2.75
CTU2-208ENST00000566637 NUP160Q12769 1436 aa32.2■■■□□ 2.75
CTU2-208ENST00000566637 CHD1O14646 1710 aa32.19■■■□□ 2.74
CTU2-208ENST00000566637 UGGT2Q9NYU1 1516 aa32.15■■■□□ 2.74
CTU2-208ENST00000566637 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.15■■■□□ 2.74
CTU2-208ENST00000566637 P3H3Q8IVL6 736 aa32.15■■■□□ 2.74
CTU2-208ENST00000566637 APLP2Q06481 763 aa32.11■■■□□ 2.73
CTU2-208ENST00000566637 FMN1Q68DA7 1419 aa32.04■■■□□ 2.72
CTU2-208ENST00000566637 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP32.03■■■□□ 2.72
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CTU2-208ENST00000566637 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.95■■■□□ 2.71
CTU2-208ENST00000566637 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.94■■■□□ 2.7
CTU2-208ENST00000566637 JPH4Q96JJ6 628 aa31.92■■■□□ 2.7
CTU2-208ENST00000566637 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.9■■■□□ 2.7
CTU2-208ENST00000566637 MAP3K1Q13233 1512 aa31.87■■■□□ 2.69
CTU2-208ENST00000566637 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.86■■■□□ 2.69
CTU2-208ENST00000566637 PCGF6Q9BYE7 350 aa31.86■■■□□ 2.69
CTU2-208ENST00000566637 TIAM1Q13009 1591 aa31.84■■■□□ 2.69
CTU2-208ENST00000566637 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.83■■■□□ 2.69
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CTU2-208ENST00000566637 SHROOM2Q13796 1616 aa31.8■■■□□ 2.68
CTU2-208ENST00000566637 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.8■■■□□ 2.68
CTU2-208ENST00000566637 HECW1Q76N89 1606 aa31.77■■■□□ 2.68
CTU2-208ENST00000566637 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.76■■■□□ 2.67
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CTU2-208ENST00000566637 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.68■■■□□ 2.66
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CTU2-208ENST00000566637 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31.68■■■□□ 2.66
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CTU2-208ENST00000566637 PTPRGP23470 1445 aa31.56■■■□□ 2.64
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CTU2-208ENST00000566637 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.54■■■□□ 2.64
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CTU2-208ENST00000566637 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.53■■■□□ 2.64
CTU2-208ENST00000566637 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.52■■■□□ 2.64
CTU2-208ENST00000566637 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP31.5■■■□□ 2.63
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CTU2-208ENST00000566637 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.42■■■□□ 2.62
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CTU2-208ENST00000566637 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.4■■■□□ 2.62
CTU2-208ENST00000566637 UACAQ9BZF9 1416 aa31.38■■■□□ 2.61
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CTU2-208ENST00000566637 NCOA2Q15596 1464 aa31.32■■■□□ 2.6
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CTU2-208ENST00000566637 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.29■■■□□ 2.6
CTU2-208ENST00000566637 ATP10BO94823 1461 aa31.28■■■□□ 2.6
CTU2-208ENST00000566637 ARHGEF11O15085 1522 aa31.25■■■□□ 2.59
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CTU2-208ENST00000566637 MYOM3Q5VTT5 1437 aa31.19■■■□□ 2.58
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CTU2-208ENST00000566637 FGD6Q6ZV73 1430 aa31.17■■■□□ 2.58
CTU2-208ENST00000566637 PLEKHD1A6NEE1 506 aa31.16■■■□□ 2.58
CTU2-208ENST00000566637 KIF14Q15058 1648 aa31.11■■■□□ 2.57
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CTU2-208ENST00000566637 PTPN23Q9H3S7 1636 aa31.05■■■□□ 2.56
CTU2-208ENST00000566637 MIA2Q96PC5 1412 aa31.04■■■□□ 2.56
CTU2-208ENST00000566637 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31.04■■■□□ 2.56
CTU2-208ENST00000566637 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
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CTU2-208ENST00000566637 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
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CTU2-208ENST00000566637 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.92■■■□□ 2.54
CTU2-208ENST00000566637 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.92■■■□□ 2.54
CTU2-208ENST00000566637 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.9■■■□□ 2.54
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CTU2-208ENST00000566637 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.83■■■□□ 2.53
CTU2-208ENST00000566637 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP30.83■■■□□ 2.53
CTU2-208ENST00000566637 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.82■■■□□ 2.52
CTU2-208ENST00000566637 PREX2Q70Z35 1606 aa30.81■■■□□ 2.52
CTU2-208ENST00000566637 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.81■■■□□ 2.52
CTU2-208ENST00000566637 HRCP23327 699 aa30.8■■■□□ 2.52
CTU2-208ENST00000566637 KCNH8Q96L42 1107 aa30.8■■■□□ 2.52
CTU2-208ENST00000566637 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.78■■■□□ 2.52
CTU2-208ENST00000566637 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.51
CTU2-208ENST00000566637 ASXL2Q76L83 1435 aa30.76■■■□□ 2.51
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