RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566637.5

CTU2-208, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTU2, Length 1,619 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-208ENST00000566637 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.06■■■■■ 5.12
CTU2-208ENST00000566637 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.22■■■■■ 4.19
CTU2-208ENST00000566637 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.51■■■■□ 3.91
CTU2-208ENST00000566637 ABCC9O60706 1549 aa39.06■■■■□ 3.84
CTU2-208ENST00000566637 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.95■■■■□ 3.83
CTU2-208ENST00000566637 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.88■■■■□ 3.81
CTU2-208ENST00000566637 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.57■■■■□ 3.77
CTU2-208ENST00000566637 NACADO15069 1562 aa38.41■■■■□ 3.74
CTU2-208ENST00000566637 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.19■■■■□ 3.7
CTU2-208ENST00000566637 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.14■■■■□ 3.7
CTU2-208ENST00000566637 SCRIBQ14160 1630 aa37.82■■■■□ 3.65
CTU2-208ENST00000566637 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.32■■■■□ 3.56
CTU2-208ENST00000566637 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.91■■■■□ 3.5
CTU2-208ENST00000566637 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.74■■■■□ 3.47
CTU2-208ENST00000566637 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.65■■■■□ 3.46
CTU2-208ENST00000566637 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.53■■■■□ 3.44
CTU2-208ENST00000566637 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.4■■■■□ 3.42
CTU2-208ENST00000566637 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.39■■■■□ 3.42
CTU2-208ENST00000566637 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.33■■■■□ 3.41
CTU2-208ENST00000566637 SMARCA4P51532 1647 aa36.25■■■■□ 3.39
CTU2-208ENST00000566637 WIZO95785 1651 aa36.04■■■■□ 3.36
CTU2-208ENST00000566637 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
CTU2-208ENST00000566637 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.8■■■■□ 3.32
CTU2-208ENST00000566637 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.71■■■■□ 3.31
CTU2-208ENST00000566637 SMARCA2P51531 1590 aa35.71■■■■□ 3.31
CTU2-208ENST00000566637 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.67■■■■□ 3.3
CTU2-208ENST00000566637 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
CTU2-208ENST00000566637 NCAPD3P42695 1498 aa35.4■■■■□ 3.26
CTU2-208ENST00000566637 HMGXB3Q12766 1538 aa35.38■■■■□ 3.25
CTU2-208ENST00000566637 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.37■■■■□ 3.25
CTU2-208ENST00000566637 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.27■■■■□ 3.24
CTU2-208ENST00000566637 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.96■■■■□ 3.19
CTU2-208ENST00000566637 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.81■■■■□ 3.16
CTU2-208ENST00000566637 CFTRP13569 1480 aa34.55■■■■□ 3.12
CTU2-208ENST00000566637 TRIM41Q8WV44 630 aa34.52■■■■□ 3.12
CTU2-208ENST00000566637 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.47■■■■□ 3.11
CTU2-208ENST00000566637 PRDM2Q13029 1718 aa34.47■■■■□ 3.11
CTU2-208ENST00000566637 ABCC8Q09428 1581 aa34.47■■■■□ 3.11
CTU2-208ENST00000566637 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.31■■■■□ 3.085e-6■■■■■ 29.2
CTU2-208ENST00000566637 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.28■■■■□ 3.08
CTU2-208ENST00000566637 NESP48681 1621 aa34.2■■■■□ 3.07
CTU2-208ENST00000566637 SYNJ1O43426 1573 aa34.17■■■■□ 3.06
CTU2-208ENST00000566637 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.11■■■■□ 3.05
CTU2-208ENST00000566637 TOP2BQ02880 1626 aa34.07■■■■□ 3.04
CTU2-208ENST00000566637 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.06■■■■□ 3.04
CTU2-208ENST00000566637 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.01■■■■□ 3.03
CTU2-208ENST00000566637 CUX1P39880 1505 aa33.99■■■■□ 3.03
CTU2-208ENST00000566637 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.95■■■■□ 3.03
CTU2-208ENST00000566637 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.86■■■■□ 3.01
CTU2-208ENST00000566637 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.84■■■■□ 3.01
CTU2-208ENST00000566637 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.81■■■■□ 3
CTU2-208ENST00000566637 EEA1Q15075 1411 aa33.77■■■■□ 3
CTU2-208ENST00000566637 SOGA1O94964 1423 aa33.75■■■□□ 2.99
CTU2-208ENST00000566637 TOPBP1Q92547 1522 aa33.72■■■□□ 2.99
CTU2-208ENST00000566637 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.68■■■□□ 2.98
CTU2-208ENST00000566637 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.67■■■□□ 2.98
CTU2-208ENST00000566637 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.62■■■□□ 2.97
CTU2-208ENST00000566637 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.59■■■□□ 2.97
CTU2-208ENST00000566637 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.57■■■□□ 2.97
CTU2-208ENST00000566637 ERCC6Q03468 1493 aa33.57■■■□□ 2.96
CTU2-208ENST00000566637 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.52■■■□□ 2.96
CTU2-208ENST00000566637 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.52■■■□□ 2.96
CTU2-208ENST00000566637 KIF27Q86VH2 1401 aa33.48■■■□□ 2.95
CTU2-208ENST00000566637 CUX2O14529 1486 aa33.42■■■□□ 2.94
CTU2-208ENST00000566637 WDR62O43379 1518 aa33.41■■■□□ 2.94
CTU2-208ENST00000566637 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.39■■■□□ 2.94
CTU2-208ENST00000566637 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.38■■■□□ 2.93
CTU2-208ENST00000566637 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.35■■■□□ 2.93
CTU2-208ENST00000566637 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.34■■■□□ 2.93
CTU2-208ENST00000566637 KIF21BO75037 1637 aa33.33■■■□□ 2.93
CTU2-208ENST00000566637 WDR97A6NE52 1622 aa33.31■■■□□ 2.92
CTU2-208ENST00000566637 GOLGA3Q08378 1498 aa33.27■■■□□ 2.92
CTU2-208ENST00000566637 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.23■■■□□ 2.91
CTU2-208ENST00000566637 PRXQ9BXM0 1461 aa33.16■■■□□ 2.9
CTU2-208ENST00000566637 IFT140Q96RY7 1462 aa33.15■■■□□ 2.9
CTU2-208ENST00000566637 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.14■■■□□ 2.9
CTU2-208ENST00000566637 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.14■■■□□ 2.9
CTU2-208ENST00000566637 IGF1RP08069 1367 aa33.13■■■□□ 2.89
CTU2-208ENST00000566637 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.1■■■□□ 2.89
CTU2-208ENST00000566637 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.1■■■□□ 2.89
CTU2-208ENST00000566637 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.09■■■□□ 2.89
CTU2-208ENST00000566637 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.07■■■□□ 2.89
CTU2-208ENST00000566637 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.06■■■□□ 2.88
CTU2-208ENST00000566637 CUL7Q14999 1698 aa33.02■■■□□ 2.88
CTU2-208ENST00000566637 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33■■■□□ 2.87
CTU2-208ENST00000566637 PBRM1Q86U86 1689 aa32.94■■■□□ 2.86
CTU2-208ENST00000566637 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.9■■■□□ 2.866e-8■■■■■ 31.9
CTU2-208ENST00000566637 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.9■■■□□ 2.86
CTU2-208ENST00000566637 CEP162Q5TB80 1403 aa32.9■■■□□ 2.86
CTU2-208ENST00000566637 GRIN2BQ13224 1484 aa32.86■■■□□ 2.85
CTU2-208ENST00000566637 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.86■■■□□ 2.85
CTU2-208ENST00000566637 ADAMTS12P58397 1594 aa32.74■■■□□ 2.83
CTU2-208ENST00000566637 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.72■■■□□ 2.83
CTU2-208ENST00000566637 CLIP1P30622 1438 aa32.71■■■□□ 2.83
CTU2-208ENST00000566637 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.65■■■□□ 2.82
CTU2-208ENST00000566637 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.62■■■□□ 2.81
CTU2-208ENST00000566637 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.62■■■□□ 2.81
CTU2-208ENST00000566637 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.57■■■□□ 2.8
CTU2-208ENST00000566637 SYNJ2O15056 1496 aa32.47■■■□□ 2.79
CTU2-208ENST00000566637 GRIN2AQ12879 1464 aa32.44■■■□□ 2.78
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