RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561610.1

PPP4C-202, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4C, Length 1,333 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-202ENST00000561610 CEP170Q5SW79 1584 aa31.06■■■□□ 2.56
PPP4C-202ENST00000561610 NUP160Q12769 1436 aa31.01■■■□□ 2.56
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PPP4C-202ENST00000561610 EEA1Q15075 1411 aa30.98■■■□□ 2.55
PPP4C-202ENST00000561610 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.98■■■□□ 2.55
PPP4C-202ENST00000561610 PRXQ9BXM0 1461 aa30.84■■■□□ 2.53
PPP4C-202ENST00000561610 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.82■■■□□ 2.52
PPP4C-202ENST00000561610 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.81■■■□□ 2.52
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PPP4C-202ENST00000561610 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.79■■■□□ 2.52
PPP4C-202ENST00000561610 SHROOM2Q13796 1616 aa30.74■■■□□ 2.51
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PPP4C-202ENST00000561610 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.7■■■□□ 2.5
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PPP4C-202ENST00000561610 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
PPP4C-202ENST00000561610 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
PPP4C-202ENST00000561610 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.56■■■□□ 2.48
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PPP4C-202ENST00000561610 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.49■■■□□ 2.47
PPP4C-202ENST00000561610 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.44■■■□□ 2.46
PPP4C-202ENST00000561610 DISP1Q96F81 1524 aa30.43■■■□□ 2.46
PPP4C-202ENST00000561610 KIAA0556O60303 1618 aa30.41■■■□□ 2.46
PPP4C-202ENST00000561610 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.41■■■□□ 2.46
PPP4C-202ENST00000561610 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa30.4■■■□□ 2.46
PPP4C-202ENST00000561610 P3H3Q8IVL6 736 aa30.4■■■□□ 2.46
PPP4C-202ENST00000561610 PTPRGP23470 1445 aa30.39■■■□□ 2.46
PPP4C-202ENST00000561610 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.37■■■□□ 2.45
PPP4C-202ENST00000561610 KDM6BO15054 1643 aa30.37■■■□□ 2.45
PPP4C-202ENST00000561610 DIP2BQ9P265 1576 aa30.32■■■□□ 2.44
PPP4C-202ENST00000561610 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.29■■■□□ 2.44
PPP4C-202ENST00000561610 MAPKBP1O60336 1514 aa30.26■■■□□ 2.43
PPP4C-202ENST00000561610 SAMD9Q5K651 1589 aa30.23■■■□□ 2.43
PPP4C-202ENST00000561610 TSPOAP1O95153 1857 aa30.21■■■□□ 2.43
PPP4C-202ENST00000561610 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.19■■■□□ 2.42
PPP4C-202ENST00000561610 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.18■■■□□ 2.42
PPP4C-202ENST00000561610 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.18■■■□□ 2.42
PPP4C-202ENST00000561610 UACAQ9BZF9 1416 aa30.17■■■□□ 2.42
PPP4C-202ENST00000561610 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.15■■■□□ 2.42
PPP4C-202ENST00000561610 PLB1Q6P1J6 1458 aa30.11■■■□□ 2.41
PPP4C-202ENST00000561610 ABCC2Q92887 1545 aa30.1■■■□□ 2.41
PPP4C-202ENST00000561610 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.06■■■□□ 2.4
PPP4C-202ENST00000561610 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.06■■■□□ 2.4
PPP4C-202ENST00000561610 ARID3CA6NKF2 412 aa30.03■■■□□ 2.4
PPP4C-202ENST00000561610 ABCA8O94911 1581 aa30.02■■■□□ 2.4
PPP4C-202ENST00000561610 ADGRL1O94910 1474 aa30.02■■■□□ 2.4
PPP4C-202ENST00000561610 CLIP1P30622 1438 aa30.01■■■□□ 2.4
PPP4C-202ENST00000561610 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
PPP4C-202ENST00000561610 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.98■■■□□ 2.39
PPP4C-202ENST00000561610 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
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PPP4C-202ENST00000561610 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.92■■■□□ 2.38
PPP4C-202ENST00000561610 CEP162Q5TB80 1403 aa29.92■■■□□ 2.38
PPP4C-202ENST00000561610 ASXL2Q76L83 1435 aa29.87■■■□□ 2.37
PPP4C-202ENST00000561610 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
PPP4C-202ENST00000561610 ATP10BO94823 1461 aa29.8■■■□□ 2.36
PPP4C-202ENST00000561610 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
PPP4C-202ENST00000561610 HECW1Q76N89 1606 aa29.79■■■□□ 2.36
PPP4C-202ENST00000561610 KCNH8Q96L42 1107 aa29.76■■■□□ 2.36
PPP4C-202ENST00000561610 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.74■■■□□ 2.35
PPP4C-202ENST00000561610 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
PPP4C-202ENST00000561610 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
PPP4C-202ENST00000561610 GLI2P10070 1586 aa29.7■■■□□ 2.35
PPP4C-202ENST00000561610 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.69■■■□□ 2.34
PPP4C-202ENST00000561610 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.68■■■□□ 2.34
PPP4C-202ENST00000561610 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
PPP4C-202ENST00000561610 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
PPP4C-202ENST00000561610 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.63■■■□□ 2.33
PPP4C-202ENST00000561610 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
PPP4C-202ENST00000561610 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.59■■■□□ 2.33
PPP4C-202ENST00000561610 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.57■■■□□ 2.32
PPP4C-202ENST00000561610 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.56■■■□□ 2.32
PPP4C-202ENST00000561610 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.54■■■□□ 2.32
PPP4C-202ENST00000561610 FBXO41Q8TF61 875 aa29.54■■■□□ 2.32
PPP4C-202ENST00000561610 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.52■■■□□ 2.32
PPP4C-202ENST00000561610 CD109Q6YHK3 1445 aa29.48■■■□□ 2.31
PPP4C-202ENST00000561610 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.47■■■□□ 2.31
PPP4C-202ENST00000561610 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
PPP4C-202ENST00000561610 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.42■■■□□ 2.3
PPP4C-202ENST00000561610 KIF14Q15058 1648 aa29.39■■■□□ 2.3
PPP4C-202ENST00000561610 APLP2Q06481 763 aa29.38■■■□□ 2.29
PPP4C-202ENST00000561610 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.37■■■□□ 2.295e-11■■□□□ 12.7
PPP4C-202ENST00000561610 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.37■■■□□ 2.29
PPP4C-202ENST00000561610 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.35■■■□□ 2.29
PPP4C-202ENST00000561610 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.34■■■□□ 2.29
PPP4C-202ENST00000561610 TIAM1Q13009 1591 aa29.29■■■□□ 2.28
PPP4C-202ENST00000561610 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.25■■■□□ 2.27
PPP4C-202ENST00000561610 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.25■■■□□ 2.27
PPP4C-202ENST00000561610 FANCAO15360 1455 aa29.19■■■□□ 2.26
PPP4C-202ENST00000561610 PLCH2O75038 1416 aa29.19■■■□□ 2.26
PPP4C-202ENST00000561610 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.18■■■□□ 2.26
PPP4C-202ENST00000561610 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.16■■■□□ 2.26
PPP4C-202ENST00000561610 NEO1Q92859 1461 aa29.16■■■□□ 2.26
PPP4C-202ENST00000561610 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.15■■■□□ 2.26
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