RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561610.1

PPP4C-202, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4C, Length 1,333 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-202ENST00000561610 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.56■■■■■ 4.72
PPP4C-202ENST00000561610 ABCC9O60706 1549 aa39.6■■■■□ 3.93
PPP4C-202ENST00000561610 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.51■■■■□ 3.92
PPP4C-202ENST00000561610 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.87■■■■□ 3.65
PPP4C-202ENST00000561610 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.46■■■■□ 3.59
PPP4C-202ENST00000561610 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.19■■■■□ 3.54
PPP4C-202ENST00000561610 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.15■■■■□ 3.54
PPP4C-202ENST00000561610 NACADO15069 1562 aa37.1■■■■□ 3.53
PPP4C-202ENST00000561610 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.82■■■■□ 3.49
PPP4C-202ENST00000561610 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.78■■■■□ 3.48
PPP4C-202ENST00000561610 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.69■■■■□ 3.46
PPP4C-202ENST00000561610 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.34■■■■□ 3.41
PPP4C-202ENST00000561610 SCRIBQ14160 1630 aa36.22■■■■□ 3.39
PPP4C-202ENST00000561610 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.1■■■■□ 3.37
PPP4C-202ENST00000561610 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.73■■■■□ 3.31
PPP4C-202ENST00000561610 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.67■■■■□ 3.3
PPP4C-202ENST00000561610 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.58■■■■□ 3.29
PPP4C-202ENST00000561610 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.48■■■■□ 3.27
PPP4C-202ENST00000561610 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
PPP4C-202ENST00000561610 SMARCA4P51532 1647 aa34.56■■■■□ 3.12
PPP4C-202ENST00000561610 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.56■■■■□ 3.12
PPP4C-202ENST00000561610 CUX2O14529 1486 aa34.45■■■■□ 3.11
PPP4C-202ENST00000561610 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.38■■■■□ 3.09
PPP4C-202ENST00000561610 ERCC6Q03468 1493 aa34.29■■■■□ 3.08
PPP4C-202ENST00000561610 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.29■■■■□ 3.08
PPP4C-202ENST00000561610 SMARCA2P51531 1590 aa34.28■■■■□ 3.08
PPP4C-202ENST00000561610 NCAPD3P42695 1498 aa34.19■■■■□ 3.06
PPP4C-202ENST00000561610 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.11■■■■□ 3.05
PPP4C-202ENST00000561610 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.1■■■■□ 3.05
PPP4C-202ENST00000561610 WIZO95785 1651 aa34.07■■■■□ 3.05
PPP4C-202ENST00000561610 HMGXB3Q12766 1538 aa34.06■■■■□ 3.04
PPP4C-202ENST00000561610 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.04■■■■□ 3.04
PPP4C-202ENST00000561610 TRIM41Q8WV44 630 aa33.73■■■□□ 2.99
PPP4C-202ENST00000561610 NESP48681 1621 aa33.71■■■□□ 2.99
PPP4C-202ENST00000561610 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.68■■■□□ 2.98
PPP4C-202ENST00000561610 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.6■■■□□ 2.97
PPP4C-202ENST00000561610 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.56■■■□□ 2.96
PPP4C-202ENST00000561610 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.32■■■□□ 2.92
PPP4C-202ENST00000561610 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.3■■■□□ 2.92
PPP4C-202ENST00000561610 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.27■■■□□ 2.92
PPP4C-202ENST00000561610 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.25■■■□□ 2.91
PPP4C-202ENST00000561610 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.12■■■□□ 2.89
PPP4C-202ENST00000561610 CFTRP13569 1480 aa33.07■■■□□ 2.88
PPP4C-202ENST00000561610 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.93■■■□□ 2.86
PPP4C-202ENST00000561610 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.92■■■□□ 2.86
PPP4C-202ENST00000561610 PRDM2Q13029 1718 aa32.92■■■□□ 2.86
PPP4C-202ENST00000561610 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.89■■■□□ 2.86
PPP4C-202ENST00000561610 WDR62O43379 1518 aa32.84■■■□□ 2.85
PPP4C-202ENST00000561610 OSCARQ8IYS5 282 aa32.68■■■□□ 2.82
PPP4C-202ENST00000561610 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.55■■■□□ 2.8
PPP4C-202ENST00000561610 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.46■■■□□ 2.79
PPP4C-202ENST00000561610 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.46■■■□□ 2.79
PPP4C-202ENST00000561610 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.46■■■□□ 2.79
PPP4C-202ENST00000561610 TOPBP1Q92547 1522 aa32.41■■■□□ 2.78
PPP4C-202ENST00000561610 ABCC8Q09428 1581 aa32.41■■■□□ 2.78
PPP4C-202ENST00000561610 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.39■■■□□ 2.78
PPP4C-202ENST00000561610 ARHGEF11O15085 1522 aa32.25■■■□□ 2.75
PPP4C-202ENST00000561610 CUX1P39880 1505 aa32.24■■■□□ 2.75
PPP4C-202ENST00000561610 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.16■■■□□ 2.74
PPP4C-202ENST00000561610 IFT140Q96RY7 1462 aa32.15■■■□□ 2.74
PPP4C-202ENST00000561610 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.14■■■□□ 2.74
PPP4C-202ENST00000561610 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.14■■■□□ 2.74
PPP4C-202ENST00000561610 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.1■■■□□ 2.73
PPP4C-202ENST00000561610 SOGA1O94964 1423 aa32.06■■■□□ 2.72
PPP4C-202ENST00000561610 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.06■■■□□ 2.72
PPP4C-202ENST00000561610 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.05■■■□□ 2.72
PPP4C-202ENST00000561610 SYNJ1O43426 1573 aa32.05■■■□□ 2.72
PPP4C-202ENST00000561610 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.03■■■□□ 2.72
PPP4C-202ENST00000561610 TOP2BQ02880 1626 aa32.01■■■□□ 2.72
PPP4C-202ENST00000561610 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32■■■□□ 2.71
PPP4C-202ENST00000561610 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.99■■■□□ 2.71
PPP4C-202ENST00000561610 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.9■■■□□ 2.7
PPP4C-202ENST00000561610 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
PPP4C-202ENST00000561610 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.88■■■□□ 2.698e-7■■■■□ 21.2
PPP4C-202ENST00000561610 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.88■■■□□ 2.69
PPP4C-202ENST00000561610 ARAP1Q96P48 1450 aa31.87■■■□□ 2.69
PPP4C-202ENST00000561610 WDR97A6NE52 1622 aa31.79■■■□□ 2.68
PPP4C-202ENST00000561610 CHD1O14646 1710 aa31.79■■■□□ 2.68
PPP4C-202ENST00000561610 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.77■■■□□ 2.68
PPP4C-202ENST00000561610 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.68■■■□□ 2.66
PPP4C-202ENST00000561610 FBLN2P98095 1184 aa31.67■■■□□ 2.66
PPP4C-202ENST00000561610 PBRM1Q86U86 1689 aa31.64■■■□□ 2.65
PPP4C-202ENST00000561610 GRIN2BQ13224 1484 aa31.63■■■□□ 2.65
PPP4C-202ENST00000561610 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.63■■■□□ 2.65
PPP4C-202ENST00000561610 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.59■■■□□ 2.65
PPP4C-202ENST00000561610 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.5■■■□□ 2.63
PPP4C-202ENST00000561610 KIF27Q86VH2 1401 aa31.48■■■□□ 2.63
PPP4C-202ENST00000561610 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.48■■■□□ 2.63
PPP4C-202ENST00000561610 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.4■■■□□ 2.62
PPP4C-202ENST00000561610 SYNJ2O15056 1496 aa31.39■■■□□ 2.62
PPP4C-202ENST00000561610 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.35■■■□□ 2.61
PPP4C-202ENST00000561610 ADAMTS12P58397 1594 aa31.35■■■□□ 2.61
PPP4C-202ENST00000561610 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.34■■■□□ 2.61
PPP4C-202ENST00000561610 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.31■■■□□ 2.6
PPP4C-202ENST00000561610 IGF1RP08069 1367 aa31.27■■■□□ 2.6
PPP4C-202ENST00000561610 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.26■■■□□ 2.6
PPP4C-202ENST00000561610 GRIN2AQ12879 1464 aa31.23■■■□□ 2.59
PPP4C-202ENST00000561610 CUL7Q14999 1698 aa31.2■■■□□ 2.59
PPP4C-202ENST00000561610 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.15■■■□□ 2.58
PPP4C-202ENST00000561610 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.11■■■□□ 2.57
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