RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559974.5

RABGGTA-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 1,963 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-212ENST00000559974 CHD1O14646 1710 aa22.32■■□□□ 1.16
RABGGTA-212ENST00000559974 FBLN2P98095 1184 aa22.31■■□□□ 1.16
RABGGTA-212ENST00000559974 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.31■■□□□ 1.16
RABGGTA-212ENST00000559974 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.31■■□□□ 1.16
RABGGTA-212ENST00000559974 SYNJ2O15056 1496 aa22.28■■□□□ 1.16
RABGGTA-212ENST00000559974 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
RABGGTA-212ENST00000559974 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
RABGGTA-212ENST00000559974 GRIN2AQ12879 1464 aa22.24■■□□□ 1.15
RABGGTA-212ENST00000559974 CEP170Q5SW79 1584 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-212ENST00000559974 ARAP1Q96P48 1450 aa22.14■■□□□ 1.13
RABGGTA-212ENST00000559974 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
RABGGTA-212ENST00000559974 NUP160Q12769 1436 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-212ENST00000559974 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-212ENST00000559974 APLP2Q06481 763 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-212ENST00000559974 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
RABGGTA-212ENST00000559974 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
RABGGTA-212ENST00000559974 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-212ENST00000559974 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-212ENST00000559974 IQGAP2Q13576 1575 aa21.99■■□□□ 1.11
RABGGTA-212ENST00000559974 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.98■■□□□ 1.11
RABGGTA-212ENST00000559974 OSCARQ8IYS5 282 aa21.98■■□□□ 1.11
RABGGTA-212ENST00000559974 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.91■■□□□ 1.1
RABGGTA-212ENST00000559974 SHROOM2Q13796 1616 aa21.89■■□□□ 1.09
RABGGTA-212ENST00000559974 JPH4Q96JJ6 628 aa21.88■■□□□ 1.09
RABGGTA-212ENST00000559974 P3H3Q8IVL6 736 aa21.87■■□□□ 1.09
RABGGTA-212ENST00000559974 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.85■■□□□ 1.09
RABGGTA-212ENST00000559974 DISP1Q96F81 1524 aa21.85■■□□□ 1.09
RABGGTA-212ENST00000559974 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
RABGGTA-212ENST00000559974 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
RABGGTA-212ENST00000559974 SAMD9Q5K651 1589 aa21.82■■□□□ 1.08
RABGGTA-212ENST00000559974 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
RABGGTA-212ENST00000559974 KIAA0556O60303 1618 aa21.8■■□□□ 1.08
RABGGTA-212ENST00000559974 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.79■■□□□ 1.08
RABGGTA-212ENST00000559974 MAP3K1Q13233 1512 aa21.78■■□□□ 1.08
RABGGTA-212ENST00000559974 TIAM1Q13009 1591 aa21.76■■□□□ 1.07
RABGGTA-212ENST00000559974 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.76■■□□□ 1.07
RABGGTA-212ENST00000559974 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
RABGGTA-212ENST00000559974 ARHGEF11O15085 1522 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-212ENST00000559974 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-212ENST00000559974 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
RABGGTA-212ENST00000559974 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.69■■□□□ 1.06
RABGGTA-212ENST00000559974 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.69■■□□□ 1.06
RABGGTA-212ENST00000559974 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.69■■□□□ 1.06
RABGGTA-212ENST00000559974 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.68■■□□□ 1.06
RABGGTA-212ENST00000559974 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.64■■□□□ 1.05
RABGGTA-212ENST00000559974 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.62■■□□□ 1.05
RABGGTA-212ENST00000559974 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.62■■□□□ 1.05
RABGGTA-212ENST00000559974 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.6■■□□□ 1.05
RABGGTA-212ENST00000559974 PTPRGP23470 1445 aa21.59■■□□□ 1.05
RABGGTA-212ENST00000559974 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.58■■□□□ 1.05
RABGGTA-212ENST00000559974 FMN1Q68DA7 1419 aa21.55■■□□□ 1.04
RABGGTA-212ENST00000559974 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.55■■□□□ 1.04
RABGGTA-212ENST00000559974 ARID3CA6NKF2 412 aa21.54■■□□□ 1.04
RABGGTA-212ENST00000559974 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.53■■□□□ 1.04
RABGGTA-212ENST00000559974 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.52■■□□□ 1.04
RABGGTA-212ENST00000559974 ABCA8O94911 1581 aa21.52■■□□□ 1.03
RABGGTA-212ENST00000559974 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.5■■□□□ 1.03
RABGGTA-212ENST00000559974 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
RABGGTA-212ENST00000559974 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.48■■□□□ 1.03
RABGGTA-212ENST00000559974 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.48■■□□□ 1.03
RABGGTA-212ENST00000559974 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
RABGGTA-212ENST00000559974 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.48■■□□□ 1.03
RABGGTA-212ENST00000559974 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
RABGGTA-212ENST00000559974 UACAQ9BZF9 1416 aa21.46■■□□□ 1.03
RABGGTA-212ENST00000559974 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
RABGGTA-212ENST00000559974 ABCC2Q92887 1545 aa21.43■■□□□ 1.02
RABGGTA-212ENST00000559974 HECW1Q76N89 1606 aa21.41■■□□□ 1.02
RABGGTA-212ENST00000559974 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
RABGGTA-212ENST00000559974 ITGAEP38570 1179 aa21.38■■□□□ 1.01
RABGGTA-212ENST00000559974 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
RABGGTA-212ENST00000559974 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
RABGGTA-212ENST00000559974 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.36■■□□□ 1.01
RABGGTA-212ENST00000559974 ATP10BO94823 1461 aa21.36■■□□□ 1.01
RABGGTA-212ENST00000559974 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
RABGGTA-212ENST00000559974 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.33■■□□□ 1
RABGGTA-212ENST00000559974 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.32■■□□□ 1
RABGGTA-212ENST00000559974 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.32■■□□□ 1
RABGGTA-212ENST00000559974 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.31■■□□□ 1
RABGGTA-212ENST00000559974 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
RABGGTA-212ENST00000559974 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.31■■□□□ 1
RABGGTA-212ENST00000559974 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
RABGGTA-212ENST00000559974 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.3■■□□□ 1
RABGGTA-212ENST00000559974 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.29■■□□□ 1
RABGGTA-212ENST00000559974 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.28■■□□□ 1
RABGGTA-212ENST00000559974 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.27■■□□□ 1
RABGGTA-212ENST00000559974 NCOA2Q15596 1464 aa21.24■□□□□ 0.99
RABGGTA-212ENST00000559974 MAPKBP1O60336 1514 aa21.21■□□□□ 0.99
RABGGTA-212ENST00000559974 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.2■□□□□ 0.98
RABGGTA-212ENST00000559974 ASXL2Q76L83 1435 aa21.19■□□□□ 0.98
RABGGTA-212ENST00000559974 KIF14Q15058 1648 aa21.18■□□□□ 0.98
RABGGTA-212ENST00000559974 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.16■□□□□ 0.98
RABGGTA-212ENST00000559974 KCNH8Q96L42 1107 aa21.14■□□□□ 0.98
RABGGTA-212ENST00000559974 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.14■□□□□ 0.98
RABGGTA-212ENST00000559974 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
RABGGTA-212ENST00000559974 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.13■□□□□ 0.97
RABGGTA-212ENST00000559974 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.12■□□□□ 0.97
RABGGTA-212ENST00000559974 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
RABGGTA-212ENST00000559974 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.08■□□□□ 0.96
RABGGTA-212ENST00000559974 HFM1A2PYH4 1435 aa21.07■□□□□ 0.96
RABGGTA-212ENST00000559974 PTPRKQ15262 1439 aa21.07■□□□□ 0.96
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