RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559974.5

RABGGTA-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 1,963 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-212ENST00000559974 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.02■■■□□ 2.72
RABGGTA-212ENST00000559974 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.15■■■□□ 2.1
RABGGTA-212ENST00000559974 ABCC9O60706 1549 aa27.23■■□□□ 1.95
RABGGTA-212ENST00000559974 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
RABGGTA-212ENST00000559974 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.66■■□□□ 1.86
RABGGTA-212ENST00000559974 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.38■■□□□ 1.81
RABGGTA-212ENST00000559974 NACADO15069 1562 aa26.32■■□□□ 1.8
RABGGTA-212ENST00000559974 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.25■■□□□ 1.79
RABGGTA-212ENST00000559974 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.25■■□□□ 1.79
RABGGTA-212ENST00000559974 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.03■■□□□ 1.76
RABGGTA-212ENST00000559974 SCRIBQ14160 1630 aa25.93■■□□□ 1.74
RABGGTA-212ENST00000559974 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.87■■□□□ 1.73
RABGGTA-212ENST00000559974 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.59■■□□□ 1.69
RABGGTA-212ENST00000559974 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.58■■□□□ 1.694e-10■■■□□ 15
RABGGTA-212ENST00000559974 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.64
RABGGTA-212ENST00000559974 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.02■■□□□ 1.6
RABGGTA-212ENST00000559974 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
RABGGTA-212ENST00000559974 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.78■■□□□ 1.56
RABGGTA-212ENST00000559974 SMARCA4P51532 1647 aa24.76■■□□□ 1.55
RABGGTA-212ENST00000559974 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
RABGGTA-212ENST00000559974 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
RABGGTA-212ENST00000559974 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.61■■□□□ 1.53
RABGGTA-212ENST00000559974 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.61■■□□□ 1.53
RABGGTA-212ENST00000559974 WIZO95785 1651 aa24.58■■□□□ 1.53
RABGGTA-212ENST00000559974 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.53■■□□□ 1.52
RABGGTA-212ENST00000559974 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.47■■□□□ 1.51
RABGGTA-212ENST00000559974 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.43■■□□□ 1.5
RABGGTA-212ENST00000559974 SMARCA2P51531 1590 aa24.38■■□□□ 1.49
RABGGTA-212ENST00000559974 NCAPD3P42695 1498 aa24.3■■□□□ 1.48
RABGGTA-212ENST00000559974 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
RABGGTA-212ENST00000559974 HMGXB3Q12766 1538 aa24.23■■□□□ 1.47
RABGGTA-212ENST00000559974 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
RABGGTA-212ENST00000559974 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.99■■□□□ 1.43
RABGGTA-212ENST00000559974 NESP48681 1621 aa23.77■■□□□ 1.4
RABGGTA-212ENST00000559974 TRIM41Q8WV44 630 aa23.73■■□□□ 1.39
RABGGTA-212ENST00000559974 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.66■■□□□ 1.38
RABGGTA-212ENST00000559974 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.65■■□□□ 1.38
RABGGTA-212ENST00000559974 CFTRP13569 1480 aa23.63■■□□□ 1.37
RABGGTA-212ENST00000559974 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.57■■□□□ 1.36
RABGGTA-212ENST00000559974 PRDM2Q13029 1718 aa23.51■■□□□ 1.35
RABGGTA-212ENST00000559974 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-212ENST00000559974 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.43■■□□□ 1.34
RABGGTA-212ENST00000559974 ABCC8Q09428 1581 aa23.38■■□□□ 1.33
RABGGTA-212ENST00000559974 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.37■■□□□ 1.33
RABGGTA-212ENST00000559974 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
RABGGTA-212ENST00000559974 ERCC6Q03468 1493 aa23.32■■□□□ 1.32
RABGGTA-212ENST00000559974 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.31■■□□□ 1.32
RABGGTA-212ENST00000559974 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.24■■□□□ 1.31
RABGGTA-212ENST00000559974 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
RABGGTA-212ENST00000559974 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.31
RABGGTA-212ENST00000559974 CUX1P39880 1505 aa23.2■■□□□ 1.31
RABGGTA-212ENST00000559974 SYNJ1O43426 1573 aa23.2■■□□□ 1.3
RABGGTA-212ENST00000559974 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.17■■□□□ 1.3
RABGGTA-212ENST00000559974 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.16■■□□□ 1.3
RABGGTA-212ENST00000559974 TOPBP1Q92547 1522 aa23.13■■□□□ 1.29
RABGGTA-212ENST00000559974 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.1■■□□□ 1.29
RABGGTA-212ENST00000559974 WDR62O43379 1518 aa23.08■■□□□ 1.29
RABGGTA-212ENST00000559974 TOP2BQ02880 1626 aa23.07■■□□□ 1.28
RABGGTA-212ENST00000559974 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.07■■□□□ 1.28
RABGGTA-212ENST00000559974 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.06■■□□□ 1.28
RABGGTA-212ENST00000559974 HRCP23327 699 aa23.05■■□□□ 1.28
RABGGTA-212ENST00000559974 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
RABGGTA-212ENST00000559974 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.01■■□□□ 1.27
RABGGTA-212ENST00000559974 EEA1Q15075 1411 aa23■■□□□ 1.27
RABGGTA-212ENST00000559974 SOGA1O94964 1423 aa22.99■■□□□ 1.27
RABGGTA-212ENST00000559974 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
RABGGTA-212ENST00000559974 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.95■■□□□ 1.26
RABGGTA-212ENST00000559974 CUX2O14529 1486 aa22.94■■□□□ 1.26
RABGGTA-212ENST00000559974 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.88■■□□□ 1.25
RABGGTA-212ENST00000559974 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-212ENST00000559974 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.84■■□□□ 1.25
RABGGTA-212ENST00000559974 WDR97A6NE52 1622 aa22.8■■□□□ 1.24
RABGGTA-212ENST00000559974 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
RABGGTA-212ENST00000559974 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.78■■□□□ 1.24
RABGGTA-212ENST00000559974 GOLGA3Q08378 1498 aa22.76■■□□□ 1.23
RABGGTA-212ENST00000559974 IFT140Q96RY7 1462 aa22.76■■□□□ 1.23
RABGGTA-212ENST00000559974 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
RABGGTA-212ENST00000559974 CEP162Q5TB80 1403 aa22.74■■□□□ 1.23
RABGGTA-212ENST00000559974 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.74■■□□□ 1.23
RABGGTA-212ENST00000559974 KIF21BO75037 1637 aa22.73■■□□□ 1.23
RABGGTA-212ENST00000559974 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.71■■□□□ 1.234e-7■■■■□ 23.8
RABGGTA-212ENST00000559974 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-212ENST00000559974 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-212ENST00000559974 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
RABGGTA-212ENST00000559974 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.6■■□□□ 1.21
RABGGTA-212ENST00000559974 KIF27Q86VH2 1401 aa22.59■■□□□ 1.21
RABGGTA-212ENST00000559974 PBRM1Q86U86 1689 aa22.58■■□□□ 1.21
RABGGTA-212ENST00000559974 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
RABGGTA-212ENST00000559974 IGF1RP08069 1367 aa22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-212ENST00000559974 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.49■■□□□ 1.19
RABGGTA-212ENST00000559974 GRIN2BQ13224 1484 aa22.48■■□□□ 1.19
RABGGTA-212ENST00000559974 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.47■■□□□ 1.19
RABGGTA-212ENST00000559974 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.45■■□□□ 1.18
RABGGTA-212ENST00000559974 CLIP1P30622 1438 aa22.42■■□□□ 1.18
RABGGTA-212ENST00000559974 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
RABGGTA-212ENST00000559974 PRXQ9BXM0 1461 aa22.41■■□□□ 1.18
RABGGTA-212ENST00000559974 ADAMTS12P58397 1594 aa22.4■■□□□ 1.18
RABGGTA-212ENST00000559974 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.36■■□□□ 1.17
RABGGTA-212ENST00000559974 CUL7Q14999 1698 aa22.35■■□□□ 1.17
RABGGTA-212ENST00000559974 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
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