RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542778.5

NELFA-216, Transcript of negative elongation factor complex member A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NELFA, Length 2,465 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFA-216ENST00000542778 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.1■■□□□ 1.61
NELFA-216ENST00000542778 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
NELFA-216ENST00000542778 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.07■■□□□ 1.6
NELFA-216ENST00000542778 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.05■■□□□ 1.6
NELFA-216ENST00000542778 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.05■■□□□ 1.6
NELFA-216ENST00000542778 ANP32EQ9BTT0 268 aa25.04■■□□□ 1.6
NELFA-216ENST00000542778 BCL11AQ9H165 835 aa25.04■■□□□ 1.6
NELFA-216ENST00000542778 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.04■■□□□ 1.6
NELFA-216ENST00000542778 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.01■■□□□ 1.592e-7■■■□□ 18
NELFA-216ENST00000542778 ERCC6Q03468 1493 aa25.01■■□□□ 1.59
NELFA-216ENST00000542778 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
NELFA-216ENST00000542778 P3H3Q8IVL6 736 aa24.97■■□□□ 1.59
NELFA-216ENST00000542778 CUL7Q14999 1698 aa24.97■■□□□ 1.59
NELFA-216ENST00000542778 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
NELFA-216ENST00000542778 WDR62O43379 1518 aa24.95■■□□□ 1.58
NELFA-216ENST00000542778 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.93■■□□□ 1.58
NELFA-216ENST00000542778 APLP2Q06481 763 aa24.9■■□□□ 1.58
NELFA-216ENST00000542778 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
NELFA-216ENST00000542778 PBRM1Q86U86 1689 aa24.88■■□□□ 1.57
NELFA-216ENST00000542778 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
NELFA-216ENST00000542778 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.84■■□□□ 1.57
NELFA-216ENST00000542778 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.81■■□□□ 1.56
NELFA-216ENST00000542778 IFT140Q96RY7 1462 aa24.8■■□□□ 1.56
NELFA-216ENST00000542778 GRIN2BQ13224 1484 aa24.73■■□□□ 1.55
NELFA-216ENST00000542778 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
NELFA-216ENST00000542778 ADAMTS12P58397 1594 aa24.73■■□□□ 1.55
NELFA-216ENST00000542778 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
NELFA-216ENST00000542778 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
NELFA-216ENST00000542778 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.7■■□□□ 1.54
NELFA-216ENST00000542778 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
NELFA-216ENST00000542778 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.67■■□□□ 1.54
NELFA-216ENST00000542778 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.61■■□□□ 1.53
NELFA-216ENST00000542778 TIAM1Q13009 1591 aa24.6■■□□□ 1.53
NELFA-216ENST00000542778 SAMD9Q5K651 1589 aa24.59■■□□□ 1.53
NELFA-216ENST00000542778 FBLN2P98095 1184 aa24.55■■□□□ 1.52
NELFA-216ENST00000542778 IQGAP2Q13576 1575 aa24.53■■□□□ 1.52
NELFA-216ENST00000542778 GRIN2AQ12879 1464 aa24.5■■□□□ 1.51
NELFA-216ENST00000542778 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.5■■□□□ 1.51
NELFA-216ENST00000542778 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.49■■□□□ 1.51
NELFA-216ENST00000542778 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.49■■□□□ 1.51
NELFA-216ENST00000542778 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.47■■□□□ 1.51
NELFA-216ENST00000542778 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.47■■□□□ 1.51
NELFA-216ENST00000542778 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
NELFA-216ENST00000542778 FMN1Q68DA7 1419 aa24.46■■□□□ 1.51
NELFA-216ENST00000542778 MAP3K1Q13233 1512 aa24.44■■□□□ 1.5
NELFA-216ENST00000542778 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
NELFA-216ENST00000542778 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.42■■□□□ 1.5
NELFA-216ENST00000542778 ITGAEP38570 1179 aa24.42■■□□□ 1.5
NELFA-216ENST00000542778 ARID3CA6NKF2 412 aa24.42■■□□□ 1.5
NELFA-216ENST00000542778 CEP170Q5SW79 1584 aa24.41■■□□□ 1.5
NELFA-216ENST00000542778 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
NELFA-216ENST00000542778 SYNJ2O15056 1496 aa24.4■■□□□ 1.5
NELFA-216ENST00000542778 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.38■■□□□ 1.49
NELFA-216ENST00000542778 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.37■■□□□ 1.49
NELFA-216ENST00000542778 DISP1Q96F81 1524 aa24.35■■□□□ 1.49
NELFA-216ENST00000542778 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.35■■□□□ 1.49
NELFA-216ENST00000542778 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
NELFA-216ENST00000542778 BCANQ96GW7 911 aa24.34■■□□□ 1.49
NELFA-216ENST00000542778 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
NELFA-216ENST00000542778 KIAA0556O60303 1618 aa24.29■■□□□ 1.48
NELFA-216ENST00000542778 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.27■■□□□ 1.48
NELFA-216ENST00000542778 FKBP8Q14318 412 aa24.26■■□□□ 1.47
NELFA-216ENST00000542778 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
NELFA-216ENST00000542778 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
NELFA-216ENST00000542778 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.26■■□□□ 1.47
NELFA-216ENST00000542778 NUP160Q12769 1436 aa24.24■■□□□ 1.47
NELFA-216ENST00000542778 KCNH8Q96L42 1107 aa24.24■■□□□ 1.47
NELFA-216ENST00000542778 JPH4Q96JJ6 628 aa24.21■■□□□ 1.47
NELFA-216ENST00000542778 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
NELFA-216ENST00000542778 HECW1Q76N89 1606 aa24.19■■□□□ 1.46
NELFA-216ENST00000542778 CHD1O14646 1710 aa24.18■■□□□ 1.46
NELFA-216ENST00000542778 NCOA2Q15596 1464 aa24.15■■□□□ 1.46
NELFA-216ENST00000542778 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.13■■□□□ 1.45
NELFA-216ENST00000542778 MSH5O43196 834 aa24.12■■□□□ 1.45
NELFA-216ENST00000542778 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
NELFA-216ENST00000542778 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.1■■□□□ 1.45
NELFA-216ENST00000542778 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.1■■□□□ 1.45
NELFA-216ENST00000542778 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.09■■□□□ 1.45
NELFA-216ENST00000542778 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
NELFA-216ENST00000542778 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.09■■□□□ 1.45
NELFA-216ENST00000542778 NEFLP07196 543 aa24.06■■□□□ 1.44
NELFA-216ENST00000542778 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.05■■□□□ 1.44
NELFA-216ENST00000542778 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
NELFA-216ENST00000542778 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.03■■□□□ 1.44
NELFA-216ENST00000542778 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.02■■□□□ 1.44
NELFA-216ENST00000542778 ARHGEF11O15085 1522 aa24.02■■□□□ 1.44
NELFA-216ENST00000542778 PTPRKQ15262 1439 aa24.01■■□□□ 1.43
NELFA-216ENST00000542778 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
NELFA-216ENST00000542778 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.96■■□□□ 1.43
NELFA-216ENST00000542778 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.96■■□□□ 1.43
NELFA-216ENST00000542778 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.95■■□□□ 1.43
NELFA-216ENST00000542778 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.95■■□□□ 1.42
NELFA-216ENST00000542778 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.91■■□□□ 1.424e-7■■■■■ 33.5
NELFA-216ENST00000542778 ABCA8O94911 1581 aa23.89■■□□□ 1.42
NELFA-216ENST00000542778 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.89■■□□□ 1.41
NELFA-216ENST00000542778 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
NELFA-216ENST00000542778 KIF14Q15058 1648 aa23.87■■□□□ 1.41
NELFA-216ENST00000542778 PTPRGP23470 1445 aa23.86■■□□□ 1.41
NELFA-216ENST00000542778 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
NELFA-216ENST00000542778 SHROOM2Q13796 1616 aa23.85■■□□□ 1.41
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