RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531188.5

RPS3-217, Transcript of ribosomal protein S3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS3, Length 2,097 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3-217ENST00000531188 ARAP1Q96P48 1450 aa19.05■□□□□ 0.64
RPS3-217ENST00000531188 VPS8Q8N3P4 1428 aa19.04■□□□□ 0.64
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RPS3-217ENST00000531188 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa19.03■□□□□ 0.64
RPS3-217ENST00000531188 GRIN2BQ13224 1484 aa19.03■□□□□ 0.64
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RPS3-217ENST00000531188 FHAD1B1AJZ9 1412 aa18.97■□□□□ 0.63
RPS3-217ENST00000531188 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
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RPS3-217ENST00000531188 FHOD3Q2V2M9 1422 aa18.84■□□□□ 0.61
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RPS3-217ENST00000531188 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa18.47■□□□□ 0.55
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RPS3-217ENST00000531188 PHLDB1Q86UU1 1377 aa18.46■□□□□ 0.55
RPS3-217ENST00000531188 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
RPS3-217ENST00000531188 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
RPS3-217ENST00000531188 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa18.45■□□□□ 0.54
RPS3-217ENST00000531188 CCDC18Q5T9S5 1454 aa18.45■□□□□ 0.54
RPS3-217ENST00000531188 ARID3CA6NKF2 412 aa18.45■□□□□ 0.54
RPS3-217ENST00000531188 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
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RPS3-217ENST00000531188 CCNB3Q8WWL7 1395 aa18.42■□□□□ 0.54
RPS3-217ENST00000531188 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
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RPS3-217ENST00000531188 ERCC6L2Q5T890 1561 aa18.36■□□□□ 0.53
RPS3-217ENST00000531188 NCOA2Q15596 1464 aa18.36■□□□□ 0.53
RPS3-217ENST00000531188 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
RPS3-217ENST00000531188 ABCA8O94911 1581 aa18.34■□□□□ 0.53
RPS3-217ENST00000531188 ITGAEP38570 1179 aa18.33■□□□□ 0.52
RPS3-217ENST00000531188 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
RPS3-217ENST00000531188 ARHGEF11O15085 1522 aa18.31■□□□□ 0.52
RPS3-217ENST00000531188 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
RPS3-217ENST00000531188 PTPRGP23470 1445 aa18.3■□□□□ 0.52
RPS3-217ENST00000531188 FGD6Q6ZV73 1430 aa18.29■□□□□ 0.52
RPS3-217ENST00000531188 MYOM3Q5VTT5 1437 aa18.27■□□□□ 0.52
RPS3-217ENST00000531188 PPP6R1Q9UPN7 881 aa18.24■□□□□ 0.51
RPS3-217ENST00000531188 ATP10BO94823 1461 aa18.24■□□□□ 0.51
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RPS3-217ENST00000531188 PTPN23Q9H3S7 1636 aa18.22■□□□□ 0.51
RPS3-217ENST00000531188 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP18.22■□□□□ 0.51
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RPS3-217ENST00000531188 UACAQ9BZF9 1416 aa18.2■□□□□ 0.5
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RPS3-217ENST00000531188 OSCARQ8IYS5 282 aa18.14■□□□□ 0.49
RPS3-217ENST00000531188 MIA2Q96PC5 1412 aa18.13■□□□□ 0.49
RPS3-217ENST00000531188 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa18.12■□□□□ 0.49
RPS3-217ENST00000531188 SETD5Q9C0A6 1442 aa18.11■□□□□ 0.49
RPS3-217ENST00000531188 ITSN2Q9NZM3 1697 aa18.1■□□□□ 0.49
RPS3-217ENST00000531188 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa18.1■□□□□ 0.49
RPS3-217ENST00000531188 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
RPS3-217ENST00000531188 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
RPS3-217ENST00000531188 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
RPS3-217ENST00000531188 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
RPS3-217ENST00000531188 ABCC10Q5T3U5 1492 aa18.07■□□□□ 0.48
RPS3-217ENST00000531188 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
RPS3-217ENST00000531188 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa18.06■□□□□ 0.48
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