RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522111.2

TRNP1-201, Transcript of TMF1-regulated nuclear protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRNP1, Length 1,958 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1-201ENST00000522111 GRIN2AQ12879 1464 aa42.9■■■■■ 4.46
TRNP1-201ENST00000522111 FBLN2P98095 1184 aa42.89■■■■■ 4.46
TRNP1-201ENST00000522111 ARAP1Q96P48 1450 aa42.89■■■■■ 4.46
TRNP1-201ENST00000522111 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.88■■■■■ 4.45
TRNP1-201ENST00000522111 VPS8Q8N3P4 1428 aa42.84■■■■■ 4.45
TRNP1-201ENST00000522111 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP42.76■■■■■ 4.44
TRNP1-201ENST00000522111 P3H3Q8IVL6 736 aa42.74■■■■■ 4.43
TRNP1-201ENST00000522111 IQGAP2Q13576 1575 aa42.73■■■■■ 4.43
TRNP1-201ENST00000522111 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.68■■■■■ 4.42
TRNP1-201ENST00000522111 CEP170Q5SW79 1584 aa42.67■■■■■ 4.42
TRNP1-201ENST00000522111 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.63■■■■■ 4.41
TRNP1-201ENST00000522111 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.61■■■■■ 4.41
TRNP1-201ENST00000522111 CHD1O14646 1710 aa42.6■■■■■ 4.41
TRNP1-201ENST00000522111 SAMD9Q5K651 1589 aa42.59■■■■■ 4.41
TRNP1-201ENST00000522111 NUP160Q12769 1436 aa42.55■■■■■ 4.4
TRNP1-201ENST00000522111 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.52■■■■■ 4.4
TRNP1-201ENST00000522111 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.45■■■■■ 4.39
TRNP1-201ENST00000522111 APLP2Q06481 763 aa42.44■■■■■ 4.38
TRNP1-201ENST00000522111 PCGF6Q9BYE7 350 aa42.39■■■■■ 4.38
TRNP1-201ENST00000522111 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42.36■■■■■ 4.37
TRNP1-201ENST00000522111 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP42.33■■■■■ 4.37
TRNP1-201ENST00000522111 FMN1Q68DA7 1419 aa42.32■■■■■ 4.36
TRNP1-201ENST00000522111 DISP1Q96F81 1524 aa42.31■■■■■ 4.36
TRNP1-201ENST00000522111 KIAA0556O60303 1618 aa42.3■■■■■ 4.36
TRNP1-201ENST00000522111 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42.27■■■■■ 4.36
TRNP1-201ENST00000522111 JPH4Q96JJ6 628 aa42.26■■■■■ 4.36
TRNP1-201ENST00000522111 FYCO1Q9BQS8 1478 aa42.2■■■■■ 4.35
TRNP1-201ENST00000522111 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.2■■■■■ 4.35
TRNP1-201ENST00000522111 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP42.13■■■■■ 4.33
TRNP1-201ENST00000522111 TIAM1Q13009 1591 aa42.11■■■■■ 4.33
TRNP1-201ENST00000522111 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.1■■■■■ 4.33
TRNP1-201ENST00000522111 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.04■■■■■ 4.32
TRNP1-201ENST00000522111 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.04■■■■■ 4.32
TRNP1-201ENST00000522111 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa42.01■■■■■ 4.32
TRNP1-201ENST00000522111 MAP3K1Q13233 1512 aa42.01■■■■■ 4.32
TRNP1-201ENST00000522111 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.01■■■■■ 4.32
TRNP1-201ENST00000522111 SHROOM2Q13796 1616 aa42.01■■■■■ 4.32
TRNP1-201ENST00000522111 HECW1Q76N89 1606 aa41.94■■■■■ 4.3
TRNP1-201ENST00000522111 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa41.91■■■■■ 4.3
TRNP1-201ENST00000522111 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.86■■■■■ 4.29
TRNP1-201ENST00000522111 ARID3CA6NKF2 412 aa41.86■■■■■ 4.29
TRNP1-201ENST00000522111 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.86■■■■■ 4.29
TRNP1-201ENST00000522111 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.83■■■■■ 4.29
TRNP1-201ENST00000522111 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.79■■■■■ 4.28
TRNP1-201ENST00000522111 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.79■■■■■ 4.28
TRNP1-201ENST00000522111 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41.78■■■■■ 4.28
TRNP1-201ENST00000522111 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.76■■■■■ 4.28
TRNP1-201ENST00000522111 PTPRGP23470 1445 aa41.73■■■■■ 4.27
TRNP1-201ENST00000522111 OSCARQ8IYS5 282 aa41.73■■■■■ 4.27
TRNP1-201ENST00000522111 MTUS2Q5JR59 1369 aa41.71■■■■■ 4.27
TRNP1-201ENST00000522111 ABCA8O94911 1581 aa41.66■■■■■ 4.26
TRNP1-201ENST00000522111 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.64■■■■■ 4.26
TRNP1-201ENST00000522111 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.61■■■■■ 4.25
TRNP1-201ENST00000522111 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.61■■■■■ 4.25
TRNP1-201ENST00000522111 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa41.59■■■■■ 4.25
TRNP1-201ENST00000522111 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.56■■■■■ 4.24
TRNP1-201ENST00000522111 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP41.49■■■■■ 4.23
TRNP1-201ENST00000522111 UACAQ9BZF9 1416 aa41.48■■■■■ 4.23
TRNP1-201ENST00000522111 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP41.48■■■■■ 4.23
TRNP1-201ENST00000522111 NCOA2Q15596 1464 aa41.45■■■■■ 4.23
TRNP1-201ENST00000522111 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.42■■■■■ 4.22
TRNP1-201ENST00000522111 ATP10BO94823 1461 aa41.41■■■■■ 4.22
TRNP1-201ENST00000522111 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP41.39■■■■■ 4.22
TRNP1-201ENST00000522111 ABCC2Q92887 1545 aa41.37■■■■■ 4.21
TRNP1-201ENST00000522111 ARHGEF11O15085 1522 aa41.31■■■■■ 4.2
TRNP1-201ENST00000522111 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP41.29■■■■■ 4.2
TRNP1-201ENST00000522111 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.25■■■■■ 4.19
TRNP1-201ENST00000522111 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
TRNP1-201ENST00000522111 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.24■■■■■ 4.19
TRNP1-201ENST00000522111 PLEKHD1A6NEE1 506 aa41.22■■■■■ 4.19
TRNP1-201ENST00000522111 ITGAEP38570 1179 aa41.21■■■■■ 4.19
TRNP1-201ENST00000522111 KIF14Q15058 1648 aa41.21■■■■■ 4.19
TRNP1-201ENST00000522111 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.19■■■■■ 4.18
TRNP1-201ENST00000522111 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.15■■■■■ 4.18
TRNP1-201ENST00000522111 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.13■■■■■ 4.18
TRNP1-201ENST00000522111 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.08■■■■■ 4.17
TRNP1-201ENST00000522111 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.06■■■■■ 4.16
TRNP1-201ENST00000522111 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41■■■■■ 4.15
TRNP1-201ENST00000522111 MIA2Q96PC5 1412 aa40.96■■■■■ 4.15
TRNP1-201ENST00000522111 ITSN2Q9NZM3 1697 aa40.95■■■■■ 4.15
TRNP1-201ENST00000522111 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.94■■■■■ 4.14
TRNP1-201ENST00000522111 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
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TRNP1-201ENST00000522111 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.9■■■■■ 4.14
TRNP1-201ENST00000522111 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.9■■■■■ 4.14
TRNP1-201ENST00000522111 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.9■■■■■ 4.14
TRNP1-201ENST00000522111 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa40.89■■■■■ 4.14
TRNP1-201ENST00000522111 KCNH8Q96L42 1107 aa40.88■■■■■ 4.13
TRNP1-201ENST00000522111 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP40.86■■■■■ 4.13
TRNP1-201ENST00000522111 HRCP23327 699 aa40.85■■■■■ 4.13
TRNP1-201ENST00000522111 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP40.84■■■■■ 4.13
TRNP1-201ENST00000522111 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.83■■■■■ 4.13
TRNP1-201ENST00000522111 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.8■■■■■ 4.12
TRNP1-201ENST00000522111 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP40.79■■■■■ 4.12
TRNP1-201ENST00000522111 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP40.79■■■■■ 4.12
TRNP1-201ENST00000522111 PTPRKQ15262 1439 aa40.79■■■■■ 4.12
TRNP1-201ENST00000522111 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.77■■■■■ 4.12
TRNP1-201ENST00000522111 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa40.76■■■■■ 4.12
TRNP1-201ENST00000522111 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.75■■■■■ 4.11
TRNP1-201ENST00000522111 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.75■■■■■ 4.11
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