RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519339.5

TNIP1-206, Transcript of TNFAIP3 interacting protein 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TNIP1, Length 1,815 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1-206ENST00000519339 PBRM1Q86U86 1689 aa23.46■■□□□ 1.35
TNIP1-206ENST00000519339 MAP3K1Q13233 1512 aa23.4■■□□□ 1.34
TNIP1-206ENST00000519339 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.4■■□□□ 1.34
TNIP1-206ENST00000519339 GRIN2BQ13224 1484 aa23.4■■□□□ 1.34
TNIP1-206ENST00000519339 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.37■■□□□ 1.33
TNIP1-206ENST00000519339 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.37■■□□□ 1.33
TNIP1-206ENST00000519339 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
TNIP1-206ENST00000519339 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.32■■□□□ 1.32
TNIP1-206ENST00000519339 ADAMTS12P58397 1594 aa23.3■■□□□ 1.32
TNIP1-206ENST00000519339 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
TNIP1-206ENST00000519339 TIAM1Q13009 1591 aa23.23■■□□□ 1.31
TNIP1-206ENST00000519339 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
TNIP1-206ENST00000519339 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
TNIP1-206ENST00000519339 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
TNIP1-206ENST00000519339 FMN1Q68DA7 1419 aa23.2■■□□□ 1.3
TNIP1-206ENST00000519339 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.2■■□□□ 1.3
TNIP1-206ENST00000519339 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
TNIP1-206ENST00000519339 SAMD9Q5K651 1589 aa23.19■■□□□ 1.3
TNIP1-206ENST00000519339 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.17■■□□□ 1.3
TNIP1-206ENST00000519339 SYNJ2O15056 1496 aa23.17■■□□□ 1.3
TNIP1-206ENST00000519339 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.15■■□□□ 1.3
TNIP1-206ENST00000519339 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.14■■□□□ 1.3
TNIP1-206ENST00000519339 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
TNIP1-206ENST00000519339 GRIN2AQ12879 1464 aa23.14■■□□□ 1.29
TNIP1-206ENST00000519339 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.14■■□□□ 1.29
TNIP1-206ENST00000519339 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
TNIP1-206ENST00000519339 FBLN2P98095 1184 aa23.1■■□□□ 1.29
TNIP1-206ENST00000519339 CHD1O14646 1710 aa23.08■■□□□ 1.29
TNIP1-206ENST00000519339 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.07■■□□□ 1.28
TNIP1-206ENST00000519339 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
TNIP1-206ENST00000519339 IQGAP2Q13576 1575 aa23.05■■□□□ 1.28
TNIP1-206ENST00000519339 P3H3Q8IVL6 736 aa23.05■■□□□ 1.28
TNIP1-206ENST00000519339 CEP170Q5SW79 1584 aa23.04■■□□□ 1.28
TNIP1-206ENST00000519339 NUP160Q12769 1436 aa22.99■■□□□ 1.27
TNIP1-206ENST00000519339 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.99■■□□□ 1.27
TNIP1-206ENST00000519339 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.98■■□□□ 1.27
TNIP1-206ENST00000519339 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.94■■□□□ 1.26
TNIP1-206ENST00000519339 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
TNIP1-206ENST00000519339 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.91■■□□□ 1.26
TNIP1-206ENST00000519339 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.9■■□□□ 1.26
TNIP1-206ENST00000519339 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
TNIP1-206ENST00000519339 HECW1Q76N89 1606 aa22.85■■□□□ 1.25
TNIP1-206ENST00000519339 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.84■■□□□ 1.25
TNIP1-206ENST00000519339 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.83■■□□□ 1.24
TNIP1-206ENST00000519339 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.82■■□□□ 1.24
TNIP1-206ENST00000519339 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.81■■□□□ 1.24
TNIP1-206ENST00000519339 KIAA0556O60303 1618 aa22.8■■□□□ 1.24
TNIP1-206ENST00000519339 DISP1Q96F81 1524 aa22.8■■□□□ 1.24
TNIP1-206ENST00000519339 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
TNIP1-206ENST00000519339 JPH4Q96JJ6 628 aa22.78■■□□□ 1.24
TNIP1-206ENST00000519339 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
TNIP1-206ENST00000519339 ARHGEF11O15085 1522 aa22.75■■□□□ 1.23
TNIP1-206ENST00000519339 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.75■■□□□ 1.23
TNIP1-206ENST00000519339 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
TNIP1-206ENST00000519339 SHROOM2Q13796 1616 aa22.74■■□□□ 1.23
TNIP1-206ENST00000519339 OSCARQ8IYS5 282 aa22.73■■□□□ 1.23
TNIP1-206ENST00000519339 NCOA2Q15596 1464 aa22.72■■□□□ 1.23
TNIP1-206ENST00000519339 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.71■■□□□ 1.23
TNIP1-206ENST00000519339 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.7■■□□□ 1.22
TNIP1-206ENST00000519339 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
TNIP1-206ENST00000519339 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
TNIP1-206ENST00000519339 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.67■■□□□ 1.22
TNIP1-206ENST00000519339 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.67■■□□□ 1.22
TNIP1-206ENST00000519339 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.67■■□□□ 1.22
TNIP1-206ENST00000519339 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.66■■□□□ 1.22
TNIP1-206ENST00000519339 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.64■■□□□ 1.21
TNIP1-206ENST00000519339 ITGAEP38570 1179 aa22.63■■□□□ 1.21
TNIP1-206ENST00000519339 MIA2Q96PC5 1412 aa22.61■■□□□ 1.21
TNIP1-206ENST00000519339 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
TNIP1-206ENST00000519339 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
TNIP1-206ENST00000519339 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
TNIP1-206ENST00000519339 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
TNIP1-206ENST00000519339 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.56■■□□□ 1.2
TNIP1-206ENST00000519339 HFM1A2PYH4 1435 aa22.53■■□□□ 1.2
TNIP1-206ENST00000519339 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
TNIP1-206ENST00000519339 AKNAQ7Z591 1439 aa22.48■■□□□ 1.19
TNIP1-206ENST00000519339 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.48■■□□□ 1.19
TNIP1-206ENST00000519339 MAPKBP1O60336 1514 aa22.48■■□□□ 1.19
TNIP1-206ENST00000519339 PTPRGP23470 1445 aa22.47■■□□□ 1.19
TNIP1-206ENST00000519339 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
TNIP1-206ENST00000519339 PTPRKQ15262 1439 aa22.47■■□□□ 1.19
TNIP1-206ENST00000519339 ABCA8O94911 1581 aa22.46■■□□□ 1.19
TNIP1-206ENST00000519339 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
TNIP1-206ENST00000519339 NAIPQ13075 1403 aa22.42■■□□□ 1.18
TNIP1-206ENST00000519339 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.42■■□□□ 1.18
TNIP1-206ENST00000519339 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.42■■□□□ 1.18
TNIP1-206ENST00000519339 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
TNIP1-206ENST00000519339 UACAQ9BZF9 1416 aa22.39■■□□□ 1.17
TNIP1-206ENST00000519339 ARID3CA6NKF2 412 aa22.37■■□□□ 1.17
TNIP1-206ENST00000519339 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.35■■□□□ 1.17
TNIP1-206ENST00000519339 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.35■■□□□ 1.17
TNIP1-206ENST00000519339 ROCK1Q13464 1354 aa22.34■■□□□ 1.17
TNIP1-206ENST00000519339 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.33■■□□□ 1.17
TNIP1-206ENST00000519339 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.33■■□□□ 1.17
TNIP1-206ENST00000519339 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.33■■□□□ 1.17
TNIP1-206ENST00000519339 ATP10BO94823 1461 aa22.32■■□□□ 1.16
TNIP1-206ENST00000519339 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
TNIP1-206ENST00000519339 ABCC2Q92887 1545 aa22.3■■□□□ 1.16
TNIP1-206ENST00000519339 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.29■■□□□ 1.16
TNIP1-206ENST00000519339 DAPK1P53355 1430 aa22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.3 ms