RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513398.1

ACTN3-203, Transcript of actinin alpha 3 (gene/pseudogene), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTN3, Length 2,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3-203ENST00000513398 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
ACTN3-203ENST00000513398 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
ACTN3-203ENST00000513398 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
ACTN3-203ENST00000513398 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.77■■□□□ 1.88
ACTN3-203ENST00000513398 IFT140Q96RY7 1462 aa26.77■■□□□ 1.88
ACTN3-203ENST00000513398 WDR97A6NE52 1622 aa26.76■■□□□ 1.87
ACTN3-203ENST00000513398 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.74■■□□□ 1.87
ACTN3-203ENST00000513398 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
ACTN3-203ENST00000513398 APLP2Q06481 763 aa26.67■■□□□ 1.86
ACTN3-203ENST00000513398 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
ACTN3-203ENST00000513398 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.67■■□□□ 1.86
ACTN3-203ENST00000513398 ARAP1Q96P48 1450 aa26.67■■□□□ 1.86
ACTN3-203ENST00000513398 ARID3CA6NKF2 412 aa26.66■■□□□ 1.86
ACTN3-203ENST00000513398 GRIN2BQ13224 1484 aa26.65■■□□□ 1.86
ACTN3-203ENST00000513398 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
ACTN3-203ENST00000513398 MYT1Q01538 1121 aa26.62■■□□□ 1.85
ACTN3-203ENST00000513398 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.62■■□□□ 1.85
ACTN3-203ENST00000513398 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.59■■□□□ 1.85
ACTN3-203ENST00000513398 PBRM1Q86U86 1689 aa26.58■■□□□ 1.85
ACTN3-203ENST00000513398 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.56■■□□□ 1.84
ACTN3-203ENST00000513398 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.56■■□□□ 1.84
ACTN3-203ENST00000513398 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
ACTN3-203ENST00000513398 CUL7Q14999 1698 aa26.54■■□□□ 1.84
ACTN3-203ENST00000513398 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
ACTN3-203ENST00000513398 ADAMTS12P58397 1594 aa26.46■■□□□ 1.83
ACTN3-203ENST00000513398 MIER1Q8N108 512 aa26.39■■□□□ 1.82
ACTN3-203ENST00000513398 GRIN2AQ12879 1464 aa26.38■■□□□ 1.81
ACTN3-203ENST00000513398 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
ACTN3-203ENST00000513398 SYNJ2O15056 1496 aa26.32■■□□□ 1.8
ACTN3-203ENST00000513398 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.32■■□□□ 1.8
ACTN3-203ENST00000513398 ITGAEP38570 1179 aa26.3■■□□□ 1.8
ACTN3-203ENST00000513398 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
ACTN3-203ENST00000513398 JPH4Q96JJ6 628 aa26.29■■□□□ 1.8
ACTN3-203ENST00000513398 IQGAP2Q13576 1575 aa26.24■■□□□ 1.79
ACTN3-203ENST00000513398 CEP170Q5SW79 1584 aa26.23■■□□□ 1.79
ACTN3-203ENST00000513398 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.18■■□□□ 1.78
ACTN3-203ENST00000513398 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
ACTN3-203ENST00000513398 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.09■■□□□ 1.77
ACTN3-203ENST00000513398 FMN1Q68DA7 1419 aa26.09■■□□□ 1.77
ACTN3-203ENST00000513398 DISP1Q96F81 1524 aa26.08■■□□□ 1.76
ACTN3-203ENST00000513398 CHD1O14646 1710 aa26.06■■□□□ 1.76
ACTN3-203ENST00000513398 NUP160Q12769 1436 aa26.06■■□□□ 1.76
ACTN3-203ENST00000513398 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
ACTN3-203ENST00000513398 SAMD9Q5K651 1589 aa26.06■■□□□ 1.76
ACTN3-203ENST00000513398 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
ACTN3-203ENST00000513398 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.03■■□□□ 1.76
ACTN3-203ENST00000513398 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.01■■□□□ 1.75
ACTN3-203ENST00000513398 PLB1Q6P1J6 1458 aa26■■□□□ 1.75
ACTN3-203ENST00000513398 TIAM1Q13009 1591 aa25.98■■□□□ 1.75
ACTN3-203ENST00000513398 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
ACTN3-203ENST00000513398 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.98■■□□□ 1.75
ACTN3-203ENST00000513398 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.97■■□□□ 1.75
ACTN3-203ENST00000513398 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.96■■□□□ 1.75
ACTN3-203ENST00000513398 KIAA0556O60303 1618 aa25.96■■□□□ 1.75
ACTN3-203ENST00000513398 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.95■■□□□ 1.74
ACTN3-203ENST00000513398 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.94■■□□□ 1.74
ACTN3-203ENST00000513398 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.92■■□□□ 1.74
ACTN3-203ENST00000513398 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.87■■□□□ 1.73
ACTN3-203ENST00000513398 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.86■■□□□ 1.73
ACTN3-203ENST00000513398 PTPRGP23470 1445 aa25.85■■□□□ 1.73
ACTN3-203ENST00000513398 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
ACTN3-203ENST00000513398 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
ACTN3-203ENST00000513398 OSCARQ8IYS5 282 aa25.83■■□□□ 1.73
ACTN3-203ENST00000513398 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.82■■□□□ 1.72
ACTN3-203ENST00000513398 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.81■■□□□ 1.72
ACTN3-203ENST00000513398 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
ACTN3-203ENST00000513398 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
ACTN3-203ENST00000513398 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
ACTN3-203ENST00000513398 KCNH8Q96L42 1107 aa25.76■■□□□ 1.71
ACTN3-203ENST00000513398 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.75■■□□□ 1.71
ACTN3-203ENST00000513398 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.72■■□□□ 1.71
ACTN3-203ENST00000513398 HECW1Q76N89 1606 aa25.72■■□□□ 1.71
ACTN3-203ENST00000513398 NCOA2Q15596 1464 aa25.71■■□□□ 1.71
ACTN3-203ENST00000513398 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
ACTN3-203ENST00000513398 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.7■■□□□ 1.71
ACTN3-203ENST00000513398 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.68■■□□□ 1.7
ACTN3-203ENST00000513398 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
ACTN3-203ENST00000513398 MAP3K1Q13233 1512 aa25.67■■□□□ 1.7
ACTN3-203ENST00000513398 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
ACTN3-203ENST00000513398 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.63■■□□□ 1.69
ACTN3-203ENST00000513398 ATP10BO94823 1461 aa25.61■■□□□ 1.69
ACTN3-203ENST00000513398 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.6■■□□□ 1.69
ACTN3-203ENST00000513398 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.59■■□□□ 1.69
ACTN3-203ENST00000513398 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.58■■□□□ 1.69
ACTN3-203ENST00000513398 UACAQ9BZF9 1416 aa25.57■■□□□ 1.68
ACTN3-203ENST00000513398 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa25.55■■□□□ 1.68
ACTN3-203ENST00000513398 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.55■■□□□ 1.68
ACTN3-203ENST00000513398 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.54■■□□□ 1.68
ACTN3-203ENST00000513398 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
ACTN3-203ENST00000513398 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.54■■□□□ 1.68
ACTN3-203ENST00000513398 ABCA8O94911 1581 aa25.52■■□□□ 1.68
ACTN3-203ENST00000513398 SHROOM2Q13796 1616 aa25.52■■□□□ 1.68
ACTN3-203ENST00000513398 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
ACTN3-203ENST00000513398 PTPRKQ15262 1439 aa25.49■■□□□ 1.67
ACTN3-203ENST00000513398 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
ACTN3-203ENST00000513398 KIF14Q15058 1648 aa25.48■■□□□ 1.67
ACTN3-203ENST00000513398 ARHGEF11O15085 1522 aa25.45■■□□□ 1.66
ACTN3-203ENST00000513398 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.44■■□□□ 1.66
ACTN3-203ENST00000513398 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.4■■□□□ 1.66
ACTN3-203ENST00000513398 ANP32EQ9BTT0 268 aa25.37■■□□□ 1.65
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