RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 WDR62O43379 1518 aa25.32■■□□□ 1.64
TOM1-216ENST00000492723 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.32■■□□□ 1.64
TOM1-216ENST00000492723 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.32■■□□□ 1.64
TOM1-216ENST00000492723 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.32■■□□□ 1.64
TOM1-216ENST00000492723 ERCC6Q03468 1493 aa25.3■■□□□ 1.64
TOM1-216ENST00000492723 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.3■■□□□ 1.64
TOM1-216ENST00000492723 PBRM1Q86U86 1689 aa25.29■■□□□ 1.64
TOM1-216ENST00000492723 IFT140Q96RY7 1462 aa25.27■■□□□ 1.64
TOM1-216ENST00000492723 TIAM1Q13009 1591 aa25.26■■□□□ 1.63
TOM1-216ENST00000492723 MAP3K1Q13233 1512 aa25.25■■□□□ 1.63
TOM1-216ENST00000492723 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
TOM1-216ENST00000492723 GRIN2BQ13224 1484 aa25.21■■□□□ 1.63
TOM1-216ENST00000492723 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
TOM1-216ENST00000492723 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
TOM1-216ENST00000492723 ADAMTS12P58397 1594 aa25.18■■□□□ 1.62
TOM1-216ENST00000492723 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
TOM1-216ENST00000492723 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.16■■□□□ 1.62
TOM1-216ENST00000492723 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.16■■□□□ 1.62
TOM1-216ENST00000492723 SAMD9Q5K651 1589 aa25.15■■□□□ 1.62
TOM1-216ENST00000492723 FMN1Q68DA7 1419 aa25.15■■□□□ 1.62
TOM1-216ENST00000492723 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.15■■□□□ 1.62
TOM1-216ENST00000492723 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
TOM1-216ENST00000492723 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.14■■□□□ 1.61
TOM1-216ENST00000492723 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.11■■□□□ 1.61
TOM1-216ENST00000492723 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
TOM1-216ENST00000492723 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.06■■□□□ 1.6
TOM1-216ENST00000492723 IQGAP2Q13576 1575 aa25.04■■□□□ 1.6
TOM1-216ENST00000492723 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.01■■□□□ 1.59
TOM1-216ENST00000492723 ITGAEP38570 1179 aa24.98■■□□□ 1.59
TOM1-216ENST00000492723 GRIN2AQ12879 1464 aa24.93■■□□□ 1.58
TOM1-216ENST00000492723 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
TOM1-216ENST00000492723 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.9■■□□□ 1.58
TOM1-216ENST00000492723 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.9■■□□□ 1.58
TOM1-216ENST00000492723 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.9■■□□□ 1.58
TOM1-216ENST00000492723 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.89■■□□□ 1.58
TOM1-216ENST00000492723 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
TOM1-216ENST00000492723 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
TOM1-216ENST00000492723 SYNJ2O15056 1496 aa24.85■■□□□ 1.57
TOM1-216ENST00000492723 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
TOM1-216ENST00000492723 FBLN2P98095 1184 aa24.83■■□□□ 1.56
TOM1-216ENST00000492723 HECW1Q76N89 1606 aa24.81■■□□□ 1.56
TOM1-216ENST00000492723 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.8■■□□□ 1.56
TOM1-216ENST00000492723 DISP1Q96F81 1524 aa24.78■■□□□ 1.56
TOM1-216ENST00000492723 KIAA0556O60303 1618 aa24.77■■□□□ 1.56
TOM1-216ENST00000492723 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.77■■□□□ 1.56
TOM1-216ENST00000492723 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.76■■□□□ 1.55
TOM1-216ENST00000492723 CEP170Q5SW79 1584 aa24.76■■□□□ 1.55
TOM1-216ENST00000492723 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.76■■□□□ 1.55
TOM1-216ENST00000492723 NCOA2Q15596 1464 aa24.75■■□□□ 1.55
TOM1-216ENST00000492723 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.75■■□□□ 1.55
TOM1-216ENST00000492723 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
TOM1-216ENST00000492723 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.74■■□□□ 1.55
TOM1-216ENST00000492723 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
TOM1-216ENST00000492723 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.72■■□□□ 1.55
TOM1-216ENST00000492723 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.72■■□□□ 1.55
TOM1-216ENST00000492723 ARID3CA6NKF2 412 aa24.7■■□□□ 1.54
TOM1-216ENST00000492723 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
TOM1-216ENST00000492723 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.69■■□□□ 1.54
TOM1-216ENST00000492723 NUP160Q12769 1436 aa24.68■■□□□ 1.54
TOM1-216ENST00000492723 ARHGEF11O15085 1522 aa24.63■■□□□ 1.53
TOM1-216ENST00000492723 JPH4Q96JJ6 628 aa24.62■■□□□ 1.53
TOM1-216ENST00000492723 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
TOM1-216ENST00000492723 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.6■■□□□ 1.53
TOM1-216ENST00000492723 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
TOM1-216ENST00000492723 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.59■■□□□ 1.53
TOM1-216ENST00000492723 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.56■■□□□ 1.52
TOM1-216ENST00000492723 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
TOM1-216ENST00000492723 PTPRKQ15262 1439 aa24.53■■□□□ 1.52
TOM1-216ENST00000492723 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.52■■□□□ 1.52
TOM1-216ENST00000492723 MAPKBP1O60336 1514 aa24.52■■□□□ 1.52
TOM1-216ENST00000492723 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
TOM1-216ENST00000492723 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
TOM1-216ENST00000492723 HFM1A2PYH4 1435 aa24.46■■□□□ 1.51
TOM1-216ENST00000492723 MIA2Q96PC5 1412 aa24.46■■□□□ 1.51
TOM1-216ENST00000492723 CHD1O14646 1710 aa24.43■■□□□ 1.5
TOM1-216ENST00000492723 NAIPQ13075 1403 aa24.41■■□□□ 1.5
TOM1-216ENST00000492723 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
TOM1-216ENST00000492723 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
TOM1-216ENST00000492723 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.38■■□□□ 1.49
TOM1-216ENST00000492723 ABCA8O94911 1581 aa24.36■■□□□ 1.49
TOM1-216ENST00000492723 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.34■■□□□ 1.49
TOM1-216ENST00000492723 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.34■■□□□ 1.49
TOM1-216ENST00000492723 NEUROD1Q13562 356 aa24.33■■□□□ 1.48
TOM1-216ENST00000492723 UACAQ9BZF9 1416 aa24.32■■□□□ 1.48
TOM1-216ENST00000492723 PTPRGP23470 1445 aa24.31■■□□□ 1.48
TOM1-216ENST00000492723 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
TOM1-216ENST00000492723 KIF14Q15058 1648 aa24.28■■□□□ 1.48
TOM1-216ENST00000492723 ATP10BO94823 1461 aa24.28■■□□□ 1.48
TOM1-216ENST00000492723 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.27■■□□□ 1.48
TOM1-216ENST00000492723 AKNAQ7Z591 1439 aa24.27■■□□□ 1.48
TOM1-216ENST00000492723 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.27■■□□□ 1.48
TOM1-216ENST00000492723 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.26■■□□□ 1.47
TOM1-216ENST00000492723 DAPK1P53355 1430 aa24.26■■□□□ 1.47
TOM1-216ENST00000492723 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
TOM1-216ENST00000492723 SHROOM2Q13796 1616 aa24.24■■□□□ 1.47
TOM1-216ENST00000492723 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.23■■□□□ 1.47
TOM1-216ENST00000492723 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
TOM1-216ENST00000492723 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
TOM1-216ENST00000492723 ABCC5O15440 1437 aa24.22■■□□□ 1.47
TOM1-216ENST00000492723 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.2■■□□□ 1.46
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