RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP17.3■□□□□ 0.369e-20■■■■■ 206
TOM1-216ENST00000492723 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.069e-14■■■■■ 55.9
TOM1-216ENST00000492723 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP18.08■□□□□ 0.481e-11■■■■■ 104.5
TOM1-216ENST00000492723 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP16.73■□□□□ 0.273e-11■■■■■ 88.4
TOM1-216ENST00000492723 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP18.87■□□□□ 0.619e-11■■■■■ 81.2
TOM1-216ENST00000492723 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP15.63■□□□□ 0.092e-10■■■■■ 70.3
TOM1-216ENST00000492723 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP13.45□□□□□ -0.264e-10■■■■■ 47.4
TOM1-216ENST00000492723 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP16.62■□□□□ 0.251e-8■■■■■ 35.2
TOM1-216ENST00000492723 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP19.4■□□□□ 0.72e-8■■■■■ 48.1
TOM1-216ENST00000492723 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP19.55■□□□□ 0.725e-8■■■■■ 35.6
TOM1-216ENST00000492723 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP18.24■□□□□ 0.512e-7■■■■□ 22.9
TOM1-216ENST00000492723 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP18.38■□□□□ 0.532e-7■■□□□ 13.9
TOM1-216ENST00000492723 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP20.44■□□□□ 0.862e-7■■■■□ 20
TOM1-216ENST00000492723 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP16.59■□□□□ 0.253e-7■■■■■ 85.3
TOM1-216ENST00000492723 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP17.33■□□□□ 0.363e-7■■■■■ 29.3
TOM1-216ENST00000492723 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP16.57■□□□□ 0.243e-7■■■■■ 42.2
TOM1-216ENST00000492723 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP18.72■□□□□ 0.594e-7■■■■■ 38
TOM1-216ENST00000492723 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP18.41■□□□□ 0.546e-7■■■□□ 15.3
TOM1-216ENST00000492723 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP18.37■□□□□ 0.537e-7■■■■■ 38.2
TOM1-216ENST00000492723 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP15.21■□□□□ 0.031e-6■■■■■ 30.2
TOM1-216ENST00000492723 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP19.06■□□□□ 0.641e-6■■■□□ 16
TOM1-216ENST00000492723 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP16.65■□□□□ 0.261e-6■■■■□ 25.5
TOM1-216ENST00000492723 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP15.99■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 62.5
TOM1-216ENST00000492723 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP15.51■□□□□ 0.072e-6■■■■□ 19.9
TOM1-216ENST00000492723 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP14.79□□□□□ -0.042e-6■■■■□ 22.8
TOM1-216ENST00000492723 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP18.15■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 149.1
TOM1-216ENST00000492723 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP18.6■□□□□ 0.573e-6■□□□□ 9
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