RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.56■■■■□ 3.44
TOM1-216ENST00000492723 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.52■■■□□ 2.64
TOM1-216ENST00000492723 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
TOM1-216ENST00000492723 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.45■■■□□ 2.46
TOM1-216ENST00000492723 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.32■■■□□ 2.44
TOM1-216ENST00000492723 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.1■■■□□ 2.41
TOM1-216ENST00000492723 ABCC9O60706 1549 aa29.6■■■□□ 2.33
TOM1-216ENST00000492723 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
TOM1-216ENST00000492723 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.52■■■□□ 2.32
TOM1-216ENST00000492723 NACADO15069 1562 aa29.28■■■□□ 2.28
TOM1-216ENST00000492723 SCRIBQ14160 1630 aa29.26■■■□□ 2.27
TOM1-216ENST00000492723 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.94■■■□□ 2.22
TOM1-216ENST00000492723 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
TOM1-216ENST00000492723 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.47■■■□□ 2.15
TOM1-216ENST00000492723 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.45■■■□□ 2.15
TOM1-216ENST00000492723 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.41■■■□□ 2.14
TOM1-216ENST00000492723 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.33■■■□□ 2.13
TOM1-216ENST00000492723 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
TOM1-216ENST00000492723 WIZO95785 1651 aa28.13■■■□□ 2.09
TOM1-216ENST00000492723 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.1■■■□□ 2.09
TOM1-216ENST00000492723 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.09■■■□□ 2.09
TOM1-216ENST00000492723 SMARCA4P51532 1647 aa27.99■■■□□ 2.07
TOM1-216ENST00000492723 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
TOM1-216ENST00000492723 TRIM41Q8WV44 630 aa27.66■■■□□ 2.02
TOM1-216ENST00000492723 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.57■■■□□ 2
TOM1-216ENST00000492723 SMARCA2P51531 1590 aa27.56■■■□□ 2
TOM1-216ENST00000492723 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.55■■■□□ 2
TOM1-216ENST00000492723 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
TOM1-216ENST00000492723 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.5■■□□□ 1.99
TOM1-216ENST00000492723 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.43■■□□□ 1.98
TOM1-216ENST00000492723 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
TOM1-216ENST00000492723 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
TOM1-216ENST00000492723 ABCC8Q09428 1581 aa27.22■■□□□ 1.95
TOM1-216ENST00000492723 NCAPD3P42695 1498 aa27.06■■□□□ 1.92
TOM1-216ENST00000492723 HMGXB3Q12766 1538 aa27.03■■□□□ 1.92
TOM1-216ENST00000492723 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27■■□□□ 1.91
TOM1-216ENST00000492723 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.92■■□□□ 1.9
TOM1-216ENST00000492723 SOGA1O94964 1423 aa26.82■■□□□ 1.88
TOM1-216ENST00000492723 SYNJ1O43426 1573 aa26.79■■□□□ 1.88
TOM1-216ENST00000492723 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.79■■□□□ 1.88
TOM1-216ENST00000492723 EEA1Q15075 1411 aa26.71■■□□□ 1.87
TOM1-216ENST00000492723 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.71■■□□□ 1.87
TOM1-216ENST00000492723 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.7■■□□□ 1.86
TOM1-216ENST00000492723 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.65■■□□□ 1.86
TOM1-216ENST00000492723 CFTRP13569 1480 aa26.63■■□□□ 1.85
TOM1-216ENST00000492723 TOP2BQ02880 1626 aa26.58■■□□□ 1.85
TOM1-216ENST00000492723 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
TOM1-216ENST00000492723 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.51■■□□□ 1.83
TOM1-216ENST00000492723 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.46■■□□□ 1.83
TOM1-216ENST00000492723 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.46■■□□□ 1.83
TOM1-216ENST00000492723 GOLGA3Q08378 1498 aa26.44■■□□□ 1.82
TOM1-216ENST00000492723 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
TOM1-216ENST00000492723 CUX1P39880 1505 aa26.44■■□□□ 1.82
TOM1-216ENST00000492723 PRDM2Q13029 1718 aa26.43■■□□□ 1.82
TOM1-216ENST00000492723 CEP162Q5TB80 1403 aa26.41■■□□□ 1.82
TOM1-216ENST00000492723 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.38■■□□□ 1.81
TOM1-216ENST00000492723 KIF21BO75037 1637 aa26.36■■□□□ 1.81
TOM1-216ENST00000492723 HRCP23327 699 aa26.35■■□□□ 1.81
TOM1-216ENST00000492723 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
TOM1-216ENST00000492723 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.22■■□□□ 1.79
TOM1-216ENST00000492723 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.19■■□□□ 1.78
TOM1-216ENST00000492723 KIF27Q86VH2 1401 aa26.18■■□□□ 1.78
TOM1-216ENST00000492723 NESP48681 1621 aa26.15■■□□□ 1.78
TOM1-216ENST00000492723 PRXQ9BXM0 1461 aa26.11■■□□□ 1.77
TOM1-216ENST00000492723 CLIP1P30622 1438 aa26.08■■□□□ 1.77
TOM1-216ENST00000492723 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.08■■□□□ 1.77
TOM1-216ENST00000492723 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.08■■□□□ 1.76
TOM1-216ENST00000492723 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.06■■□□□ 1.76
TOM1-216ENST00000492723 CUX2O14529 1486 aa26.04■■□□□ 1.76
TOM1-216ENST00000492723 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.04■■□□□ 1.76
TOM1-216ENST00000492723 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
TOM1-216ENST00000492723 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.99■■□□□ 1.75
TOM1-216ENST00000492723 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
TOM1-216ENST00000492723 TOPBP1Q92547 1522 aa25.94■■□□□ 1.74
TOM1-216ENST00000492723 IGF1RP08069 1367 aa25.91■■□□□ 1.74
TOM1-216ENST00000492723 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.89■■□□□ 1.74
TOM1-216ENST00000492723 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.88■■□□□ 1.73
TOM1-216ENST00000492723 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
TOM1-216ENST00000492723 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.86■■□□□ 1.73
TOM1-216ENST00000492723 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
TOM1-216ENST00000492723 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.8■■□□□ 1.72
TOM1-216ENST00000492723 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.8■■□□□ 1.72
TOM1-216ENST00000492723 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.76■■□□□ 1.71
TOM1-216ENST00000492723 APLP2Q06481 763 aa25.74■■□□□ 1.71
TOM1-216ENST00000492723 ARAP1Q96P48 1450 aa25.74■■□□□ 1.71
TOM1-216ENST00000492723 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
TOM1-216ENST00000492723 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.64■■□□□ 1.7
TOM1-216ENST00000492723 WDR97A6NE52 1622 aa25.63■■□□□ 1.69
TOM1-216ENST00000492723 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
TOM1-216ENST00000492723 CUL7Q14999 1698 aa25.57■■□□□ 1.68
TOM1-216ENST00000492723 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
TOM1-216ENST00000492723 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.54■■□□□ 1.68
TOM1-216ENST00000492723 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.52■■□□□ 1.68
TOM1-216ENST00000492723 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.51■■□□□ 1.67
TOM1-216ENST00000492723 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
TOM1-216ENST00000492723 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
TOM1-216ENST00000492723 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
TOM1-216ENST00000492723 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.39■■□□□ 1.65
TOM1-216ENST00000492723 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
TOM1-216ENST00000492723 P3H3Q8IVL6 736 aa25.38■■□□□ 1.65
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