RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491530.5

CHTF18-211, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene CHTF18, Length 819 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-211ENST00000491530 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
CHTF18-211ENST00000491530 IGF1RP08069 1367 aa25.91■■□□□ 1.74
CHTF18-211ENST00000491530 JPH4Q96JJ6 628 aa25.89■■□□□ 1.74
CHTF18-211ENST00000491530 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
CHTF18-211ENST00000491530 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.81■■□□□ 1.72
CHTF18-211ENST00000491530 EEA1Q15075 1411 aa25.75■■□□□ 1.71
CHTF18-211ENST00000491530 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.72■■□□□ 1.71
CHTF18-211ENST00000491530 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.71■■□□□ 1.71
CHTF18-211ENST00000491530 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.7■■□□□ 1.7
CHTF18-211ENST00000491530 IQGAP2Q13576 1575 aa25.69■■□□□ 1.7
CHTF18-211ENST00000491530 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
CHTF18-211ENST00000491530 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.66■■□□□ 1.7
CHTF18-211ENST00000491530 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.66■■□□□ 1.7
CHTF18-211ENST00000491530 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.64■■□□□ 1.7
CHTF18-211ENST00000491530 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.64■■□□□ 1.7
CHTF18-211ENST00000491530 PRXQ9BXM0 1461 aa25.64■■□□□ 1.69
CHTF18-211ENST00000491530 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.61■■□□□ 1.69
CHTF18-211ENST00000491530 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.61■■□□□ 1.69
CHTF18-211ENST00000491530 MAPKBP1O60336 1514 aa25.59■■□□□ 1.69
CHTF18-211ENST00000491530 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
CHTF18-211ENST00000491530 DIP2BQ9P265 1576 aa25.56■■□□□ 1.68
CHTF18-211ENST00000491530 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.55■■□□□ 1.68
CHTF18-211ENST00000491530 DISP1Q96F81 1524 aa25.53■■□□□ 1.68
CHTF18-211ENST00000491530 KIF21BO75037 1637 aa25.52■■□□□ 1.68
CHTF18-211ENST00000491530 PTPRGP23470 1445 aa25.51■■□□□ 1.67
CHTF18-211ENST00000491530 KIAA0556O60303 1618 aa25.51■■□□□ 1.67
CHTF18-211ENST00000491530 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.46■■□□□ 1.67
CHTF18-211ENST00000491530 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.44■■□□□ 1.66
CHTF18-211ENST00000491530 TSPOAP1O95153 1857 aa25.39■■□□□ 1.66
CHTF18-211ENST00000491530 KDM6BO15054 1643 aa25.39■■□□□ 1.66
CHTF18-211ENST00000491530 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.38■■□□□ 1.65
CHTF18-211ENST00000491530 ABCC2Q92887 1545 aa25.37■■□□□ 1.65
CHTF18-211ENST00000491530 GOLGA3Q08378 1498 aa25.35■■□□□ 1.65
CHTF18-211ENST00000491530 ASXL2Q76L83 1435 aa25.31■■□□□ 1.64
CHTF18-211ENST00000491530 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.3■■□□□ 1.64
CHTF18-211ENST00000491530 UACAQ9BZF9 1416 aa25.29■■□□□ 1.64
CHTF18-211ENST00000491530 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
CHTF18-211ENST00000491530 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.28■■□□□ 1.64
CHTF18-211ENST00000491530 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.27■■□□□ 1.64
CHTF18-211ENST00000491530 SAMD9Q5K651 1589 aa25.26■■□□□ 1.63
CHTF18-211ENST00000491530 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CHTF18-211ENST00000491530 ABCA8O94911 1581 aa25.23■■□□□ 1.63
CHTF18-211ENST00000491530 GLI2P10070 1586 aa25.22■■□□□ 1.63
CHTF18-211ENST00000491530 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
CHTF18-211ENST00000491530 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.18■■□□□ 1.62
CHTF18-211ENST00000491530 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.15■■□□□ 1.62
CHTF18-211ENST00000491530 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
CHTF18-211ENST00000491530 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.14■■□□□ 1.62
CHTF18-211ENST00000491530 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
CHTF18-211ENST00000491530 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.03■■□□□ 1.6
CHTF18-211ENST00000491530 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.03■■□□□ 1.6
CHTF18-211ENST00000491530 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
CHTF18-211ENST00000491530 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.01■■□□□ 1.59
CHTF18-211ENST00000491530 EFCAB5A4FU69 1503 aa25■■□□□ 1.59
CHTF18-211ENST00000491530 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25■■□□□ 1.59
CHTF18-211ENST00000491530 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.97■■□□□ 1.59
CHTF18-211ENST00000491530 KCNH8Q96L42 1107 aa24.97■■□□□ 1.59
CHTF18-211ENST00000491530 ADGRL1O94910 1474 aa24.96■■□□□ 1.59
CHTF18-211ENST00000491530 P3H3Q8IVL6 736 aa24.94■■□□□ 1.58
CHTF18-211ENST00000491530 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.92■■□□□ 1.58
CHTF18-211ENST00000491530 ARID3CA6NKF2 412 aa24.91■■□□□ 1.58
CHTF18-211ENST00000491530 CLIP1P30622 1438 aa24.91■■□□□ 1.58
CHTF18-211ENST00000491530 CEP162Q5TB80 1403 aa24.91■■□□□ 1.58
CHTF18-211ENST00000491530 CD109Q6YHK3 1445 aa24.91■■□□□ 1.58
CHTF18-211ENST00000491530 ATP10BO94823 1461 aa24.88■■□□□ 1.57
CHTF18-211ENST00000491530 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
CHTF18-211ENST00000491530 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.86■■□□□ 1.57
CHTF18-211ENST00000491530 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.86■■□□□ 1.57
CHTF18-211ENST00000491530 FMN1Q68DA7 1419 aa24.72■■□□□ 1.55
CHTF18-211ENST00000491530 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
CHTF18-211ENST00000491530 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
CHTF18-211ENST00000491530 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.71■■□□□ 1.55
CHTF18-211ENST00000491530 HECW1Q76N89 1606 aa24.7■■□□□ 1.54
CHTF18-211ENST00000491530 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
CHTF18-211ENST00000491530 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.67■■□□□ 1.54
CHTF18-211ENST00000491530 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
CHTF18-211ENST00000491530 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.66■■□□□ 1.54
CHTF18-211ENST00000491530 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.64■■□□□ 1.54
CHTF18-211ENST00000491530 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.62■■□□□ 1.53
CHTF18-211ENST00000491530 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.61■■□□□ 1.53
CHTF18-211ENST00000491530 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.6■■□□□ 1.536e-8■■■□□ 19.1
CHTF18-211ENST00000491530 RAPGEF3O95398 923 aa24.59■■□□□ 1.53
CHTF18-211ENST00000491530 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.58■■□□□ 1.53
CHTF18-211ENST00000491530 NEO1Q92859 1461 aa24.58■■□□□ 1.52
CHTF18-211ENST00000491530 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.58■■□□□ 1.52
CHTF18-211ENST00000491530 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.57■■□□□ 1.52
CHTF18-211ENST00000491530 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
CHTF18-211ENST00000491530 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.56■■□□□ 1.52
CHTF18-211ENST00000491530 RICTORQ6R327 1708 aa24.54■■□□□ 1.52
CHTF18-211ENST00000491530 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.51■■□□□ 1.51
CHTF18-211ENST00000491530 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
CHTF18-211ENST00000491530 KIF14Q15058 1648 aa24.5■■□□□ 1.51
CHTF18-211ENST00000491530 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.49■■□□□ 1.51
CHTF18-211ENST00000491530 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
CHTF18-211ENST00000491530 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.45■■□□□ 1.51
CHTF18-211ENST00000491530 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.44■■□□□ 1.5
CHTF18-211ENST00000491530 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.42■■□□□ 1.5
CHTF18-211ENST00000491530 PTPRMP28827 1452 aa24.42■■□□□ 1.5
CHTF18-211ENST00000491530 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.42■■□□□ 1.5
CHTF18-211ENST00000491530 FANCAO15360 1455 aa24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms