RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482052.5

HLA-L-211, Transcript of major histocompatibility complex, class I, L (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene HLA-L, Length 1,765 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-L-211ENST00000482052 SYNJ2O15056 1496 aa36.61■■■■□ 3.45
HLA-L-211ENST00000482052 GRIN2AQ12879 1464 aa36.59■■■■□ 3.45
HLA-L-211ENST00000482052 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.59■■■■□ 3.45
HLA-L-211ENST00000482052 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.57■■■■□ 3.44
HLA-L-211ENST00000482052 FBLN2P98095 1184 aa36.51■■■■□ 3.44
HLA-L-211ENST00000482052 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.43■■■■□ 3.42
HLA-L-211ENST00000482052 P3H3Q8IVL6 736 aa36.43■■■■□ 3.42
HLA-L-211ENST00000482052 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.42■■■■□ 3.42
HLA-L-211ENST00000482052 IQGAP2Q13576 1575 aa36.41■■■■□ 3.42
HLA-L-211ENST00000482052 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.39■■■■□ 3.42
HLA-L-211ENST00000482052 CEP170Q5SW79 1584 aa36.36■■■■□ 3.41
HLA-L-211ENST00000482052 FHOD3Q2V2M9 1422 aa36.35■■■■□ 3.41
HLA-L-211ENST00000482052 NUP160Q12769 1436 aa36.33■■■■□ 3.41
HLA-L-211ENST00000482052 SAMD9Q5K651 1589 aa36.33■■■■□ 3.41
HLA-L-211ENST00000482052 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.24■■■■□ 3.39
HLA-L-211ENST00000482052 APLP2Q06481 763 aa36.22■■■■□ 3.39
HLA-L-211ENST00000482052 CHD1O14646 1710 aa36.21■■■■□ 3.39
HLA-L-211ENST00000482052 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
HLA-L-211ENST00000482052 PCGF6Q9BYE7 350 aa36.19■■■■□ 3.38
HLA-L-211ENST00000482052 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.16■■■■□ 3.38
HLA-L-211ENST00000482052 FMN1Q68DA7 1419 aa36.13■■■■□ 3.37
HLA-L-211ENST00000482052 DISP1Q96F81 1524 aa36.11■■■■□ 3.37
HLA-L-211ENST00000482052 JPH4Q96JJ6 628 aa36.09■■■■□ 3.37
HLA-L-211ENST00000482052 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
HLA-L-211ENST00000482052 KIAA0556O60303 1618 aa36.06■■■■□ 3.36
HLA-L-211ENST00000482052 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.05■■■■□ 3.36
HLA-L-211ENST00000482052 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.02■■■■□ 3.36
HLA-L-211ENST00000482052 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.01■■■■□ 3.35
HLA-L-211ENST00000482052 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.97■■■■□ 3.35
HLA-L-211ENST00000482052 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.93■■■■□ 3.34
HLA-L-211ENST00000482052 MAP3K1Q13233 1512 aa35.93■■■■□ 3.34
HLA-L-211ENST00000482052 TIAM1Q13009 1591 aa35.92■■■■□ 3.34
HLA-L-211ENST00000482052 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.86■■■■□ 3.33
HLA-L-211ENST00000482052 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.83■■■■□ 3.33
HLA-L-211ENST00000482052 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.81■■■■□ 3.32
HLA-L-211ENST00000482052 SHROOM2Q13796 1616 aa35.81■■■■□ 3.32
HLA-L-211ENST00000482052 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.78■■■■□ 3.32
HLA-L-211ENST00000482052 HECW1Q76N89 1606 aa35.75■■■■□ 3.31
HLA-L-211ENST00000482052 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.73■■■■□ 3.31
HLA-L-211ENST00000482052 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.67■■■■□ 3.3
HLA-L-211ENST00000482052 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.67■■■■□ 3.3
HLA-L-211ENST00000482052 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.66■■■■□ 3.3
HLA-L-211ENST00000482052 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.66■■■■□ 3.3
HLA-L-211ENST00000482052 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.64■■■■□ 3.3
HLA-L-211ENST00000482052 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
HLA-L-211ENST00000482052 ARID3CA6NKF2 412 aa35.62■■■■□ 3.29
HLA-L-211ENST00000482052 PTPRGP23470 1445 aa35.62■■■■□ 3.29
HLA-L-211ENST00000482052 OSCARQ8IYS5 282 aa35.61■■■■□ 3.29
HLA-L-211ENST00000482052 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
HLA-L-211ENST00000482052 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.57■■■■□ 3.29
HLA-L-211ENST00000482052 ABCA8O94911 1581 aa35.55■■■■□ 3.28
HLA-L-211ENST00000482052 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.51■■■■□ 3.28
HLA-L-211ENST00000482052 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.48■■■■□ 3.27
HLA-L-211ENST00000482052 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.48■■■■□ 3.27
HLA-L-211ENST00000482052 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
HLA-L-211ENST00000482052 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.45■■■■□ 3.27
HLA-L-211ENST00000482052 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.45■■■■□ 3.27
HLA-L-211ENST00000482052 UACAQ9BZF9 1416 aa35.41■■■■□ 3.26
HLA-L-211ENST00000482052 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.37■■■■□ 3.25
HLA-L-211ENST00000482052 NCOA2Q15596 1464 aa35.37■■■■□ 3.25
HLA-L-211ENST00000482052 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP35.36■■■■□ 3.25
HLA-L-211ENST00000482052 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
HLA-L-211ENST00000482052 ATP10BO94823 1461 aa35.35■■■■□ 3.25
HLA-L-211ENST00000482052 ARHGEF11O15085 1522 aa35.29■■■■□ 3.24
HLA-L-211ENST00000482052 ABCC2Q92887 1545 aa35.28■■■■□ 3.24
HLA-L-211ENST00000482052 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP35.25■■■■□ 3.23
HLA-L-211ENST00000482052 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.22■■■■□ 3.23
HLA-L-211ENST00000482052 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.21■■■■□ 3.23
HLA-L-211ENST00000482052 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.2■■■■□ 3.23
HLA-L-211ENST00000482052 PLEKHD1A6NEE1 506 aa35.2■■■■□ 3.23
HLA-L-211ENST00000482052 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
HLA-L-211ENST00000482052 ITGAEP38570 1179 aa35.1■■■■□ 3.21
HLA-L-211ENST00000482052 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.1■■■■□ 3.21
HLA-L-211ENST00000482052 KIF14Q15058 1648 aa35.08■■■■□ 3.21
HLA-L-211ENST00000482052 ADCY10Q96PN6 1610 aa35.08■■■■□ 3.21
HLA-L-211ENST00000482052 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.07■■■■□ 3.2
HLA-L-211ENST00000482052 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP35.02■■■■□ 3.2
HLA-L-211ENST00000482052 MIA2Q96PC5 1412 aa35.02■■■■□ 3.2
HLA-L-211ENST00000482052 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.01■■■■□ 3.2
HLA-L-211ENST00000482052 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP34.97■■■■□ 3.19
HLA-L-211ENST00000482052 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.96■■■■□ 3.19
HLA-L-211ENST00000482052 HRCP23327 699 aa34.95■■■■□ 3.19
HLA-L-211ENST00000482052 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP34.95■■■■□ 3.18
HLA-L-211ENST00000482052 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP34.87■■■■□ 3.17
HLA-L-211ENST00000482052 ITSN2Q9NZM3 1697 aa34.87■■■■□ 3.17
HLA-L-211ENST00000482052 KCNH8Q96L42 1107 aa34.84■■■■□ 3.17
HLA-L-211ENST00000482052 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP34.84■■■■□ 3.17
HLA-L-211ENST00000482052 PTPRKQ15262 1439 aa34.83■■■■□ 3.17
HLA-L-211ENST00000482052 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP34.82■■■■□ 3.16
HLA-L-211ENST00000482052 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.8■■■■□ 3.16
HLA-L-211ENST00000482052 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.8■■■■□ 3.16
HLA-L-211ENST00000482052 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.8■■■■□ 3.16
HLA-L-211ENST00000482052 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa34.8■■■■□ 3.16
HLA-L-211ENST00000482052 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP34.8■■■■□ 3.16
HLA-L-211ENST00000482052 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP34.77■■■■□ 3.16
HLA-L-211ENST00000482052 TTC37Q6PGP7 1564 aa34.76■■■■□ 3.16
HLA-L-211ENST00000482052 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP34.76■■■■□ 3.15
HLA-L-211ENST00000482052 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa34.76■■■■□ 3.15
HLA-L-211ENST00000482052 WDR7Q9Y4E6 1490 aa34.75■■■■□ 3.15
HLA-L-211ENST00000482052 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.73■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9 ms