RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472863.5

HOXB3-207, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,909 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-207ENST00000472863 GRIN2AQ12879 1464 aa43.42■■■■■ 4.54
HOXB3-207ENST00000472863 FBLN2P98095 1184 aa43.42■■■■■ 4.54
HOXB3-207ENST00000472863 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa43.4■■■■■ 4.54
HOXB3-207ENST00000472863 ARAP1Q96P48 1450 aa43.34■■■■■ 4.53
HOXB3-207ENST00000472863 VPS8Q8N3P4 1428 aa43.27■■■■■ 4.52
HOXB3-207ENST00000472863 P3H3Q8IVL6 736 aa43.22■■■■■ 4.51
HOXB3-207ENST00000472863 IQGAP2Q13576 1575 aa43.18■■■■■ 4.5
HOXB3-207ENST00000472863 CEP170Q5SW79 1584 aa43.16■■■■■ 4.5
HOXB3-207ENST00000472863 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa43.16■■■■■ 4.5
HOXB3-207ENST00000472863 EFCAB5A4FU69 1503 aa43.13■■■■■ 4.49
HOXB3-207ENST00000472863 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP43.12■■■■■ 4.49
HOXB3-207ENST00000472863 NUP160Q12769 1436 aa43.11■■■■■ 4.49
HOXB3-207ENST00000472863 CHD1O14646 1710 aa43.07■■■■■ 4.48
HOXB3-207ENST00000472863 FHOD3Q2V2M9 1422 aa43.07■■■■■ 4.48
HOXB3-207ENST00000472863 SAMD9Q5K651 1589 aa43.04■■■■■ 4.48
HOXB3-207ENST00000472863 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.97■■■■■ 4.47
HOXB3-207ENST00000472863 JPH4Q96JJ6 628 aa42.87■■■■■ 4.45
HOXB3-207ENST00000472863 APLP2Q06481 763 aa42.87■■■■■ 4.45
HOXB3-207ENST00000472863 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.83■■■■■ 4.45
HOXB3-207ENST00000472863 DISP1Q96F81 1524 aa42.83■■■■■ 4.45
HOXB3-207ENST00000472863 FMN1Q68DA7 1419 aa42.79■■■■■ 4.44
HOXB3-207ENST00000472863 KIAA0556O60303 1618 aa42.75■■■■■ 4.43
HOXB3-207ENST00000472863 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42.73■■■■■ 4.43
HOXB3-207ENST00000472863 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP42.73■■■■■ 4.43
HOXB3-207ENST00000472863 PCGF6Q9BYE7 350 aa42.71■■■■■ 4.43
HOXB3-207ENST00000472863 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42.71■■■■■ 4.43
HOXB3-207ENST00000472863 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.68■■■■■ 4.42
HOXB3-207ENST00000472863 FYCO1Q9BQS8 1478 aa42.63■■■■■ 4.41
HOXB3-207ENST00000472863 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP42.62■■■■■ 4.41
HOXB3-207ENST00000472863 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.62■■■■■ 4.41
HOXB3-207ENST00000472863 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.58■■■■■ 4.41
HOXB3-207ENST00000472863 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.55■■■■■ 4.4
HOXB3-207ENST00000472863 SHROOM2Q13796 1616 aa42.52■■■■■ 4.4
HOXB3-207ENST00000472863 TIAM1Q13009 1591 aa42.51■■■■■ 4.4
HOXB3-207ENST00000472863 MAP3K1Q13233 1512 aa42.5■■■■■ 4.39
HOXB3-207ENST00000472863 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa42.4■■■■■ 4.38
HOXB3-207ENST00000472863 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.39■■■■■ 4.38
HOXB3-207ENST00000472863 OSCARQ8IYS5 282 aa42.39■■■■■ 4.38
HOXB3-207ENST00000472863 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.36■■■■■ 4.37
HOXB3-207ENST00000472863 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa42.35■■■■■ 4.37
HOXB3-207ENST00000472863 HECW1Q76N89 1606 aa42.34■■■■■ 4.37
HOXB3-207ENST00000472863 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.32■■■■■ 4.36
HOXB3-207ENST00000472863 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.3■■■■■ 4.36
HOXB3-207ENST00000472863 ARID3CA6NKF2 412 aa42.29■■■■■ 4.36
HOXB3-207ENST00000472863 PTPRGP23470 1445 aa42.28■■■■■ 4.36
HOXB3-207ENST00000472863 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP42.26■■■■■ 4.36
HOXB3-207ENST00000472863 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP42.24■■■■■ 4.35
HOXB3-207ENST00000472863 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.23■■■■■ 4.35
HOXB3-207ENST00000472863 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.2■■■■■ 4.35
HOXB3-207ENST00000472863 ABCA8O94911 1581 aa42.16■■■■■ 4.34
HOXB3-207ENST00000472863 MTUS2Q5JR59 1369 aa42.14■■■■■ 4.34
HOXB3-207ENST00000472863 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.08■■■■■ 4.33
HOXB3-207ENST00000472863 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.07■■■■■ 4.32
HOXB3-207ENST00000472863 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP42.07■■■■■ 4.32
HOXB3-207ENST00000472863 UACAQ9BZF9 1416 aa42.01■■■■■ 4.32
HOXB3-207ENST00000472863 PHLDB1Q86UU1 1377 aa42■■■■■ 4.31
HOXB3-207ENST00000472863 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa41.99■■■■■ 4.31
HOXB3-207ENST00000472863 ATP10BO94823 1461 aa41.94■■■■■ 4.31
HOXB3-207ENST00000472863 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP41.92■■■■■ 4.3
HOXB3-207ENST00000472863 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP41.91■■■■■ 4.3
HOXB3-207ENST00000472863 NCOA2Q15596 1464 aa41.89■■■■■ 4.3
HOXB3-207ENST00000472863 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP41.87■■■■■ 4.29
HOXB3-207ENST00000472863 ABCC2Q92887 1545 aa41.85■■■■■ 4.29
HOXB3-207ENST00000472863 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.84■■■■■ 4.29
HOXB3-207ENST00000472863 ARHGEF11O15085 1522 aa41.78■■■■■ 4.28
HOXB3-207ENST00000472863 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP41.77■■■■■ 4.28
HOXB3-207ENST00000472863 PLEKHD1A6NEE1 506 aa41.77■■■■■ 4.28
HOXB3-207ENST00000472863 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.75■■■■■ 4.27
HOXB3-207ENST00000472863 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.69■■■■■ 4.26
HOXB3-207ENST00000472863 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.67■■■■■ 4.26
HOXB3-207ENST00000472863 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.66■■■■■ 4.26
HOXB3-207ENST00000472863 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.63■■■■■ 4.26
HOXB3-207ENST00000472863 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.61■■■■■ 4.25
HOXB3-207ENST00000472863 KIF14Q15058 1648 aa41.61■■■■■ 4.25
HOXB3-207ENST00000472863 ITGAEP38570 1179 aa41.59■■■■■ 4.25
HOXB3-207ENST00000472863 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
HOXB3-207ENST00000472863 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.5■■■■■ 4.234e-7■■■■■ 39.7
HOXB3-207ENST00000472863 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.46■■■■■ 4.23
HOXB3-207ENST00000472863 MIA2Q96PC5 1412 aa41.45■■■■■ 4.23
HOXB3-207ENST00000472863 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.43■■■■■ 4.22
HOXB3-207ENST00000472863 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.43■■■■■ 4.22
HOXB3-207ENST00000472863 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.43■■■■■ 4.22
HOXB3-207ENST00000472863 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.43■■■■■ 4.22
HOXB3-207ENST00000472863 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
HOXB3-207ENST00000472863 KCNH8Q96L42 1107 aa41.4■■■■■ 4.22
HOXB3-207ENST00000472863 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.38■■■■■ 4.21
HOXB3-207ENST00000472863 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.37■■■■■ 4.21
HOXB3-207ENST00000472863 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.35■■■■■ 4.21
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.33■■■■■ 4.21
HOXB3-207ENST00000472863 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.31■■■■■ 4.2
HOXB3-207ENST00000472863 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.31■■■■■ 4.2
HOXB3-207ENST00000472863 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.3■■■■■ 4.2
HOXB3-207ENST00000472863 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP41.28■■■■■ 4.21e-8■■□□□ 11.7
HOXB3-207ENST00000472863 PTPRKQ15262 1439 aa41.25■■■■■ 4.19
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.25■■■■■ 4.19
HOXB3-207ENST00000472863 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.24■■■■■ 4.19
HOXB3-207ENST00000472863 TTC37Q6PGP7 1564 aa41.24■■■■■ 4.19
HOXB3-207ENST00000472863 ASXL2Q76L83 1435 aa41.22■■■■■ 4.19
HOXB3-207ENST00000472863 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.16■■■■■ 4.18
HOXB3-207ENST00000472863 HRCP23327 699 aa41.15■■■■■ 4.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.8 ms