RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472863.5

HOXB3-207, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,909 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-207ENST00000472863 GRIN2AQ12879 1464 aa43.42■■■■■ 4.54
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HOXB3-207ENST00000472863 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa43.4■■■■■ 4.54
HOXB3-207ENST00000472863 ARAP1Q96P48 1450 aa43.34■■■■■ 4.53
HOXB3-207ENST00000472863 VPS8Q8N3P4 1428 aa43.27■■■■■ 4.52
HOXB3-207ENST00000472863 P3H3Q8IVL6 736 aa43.22■■■■■ 4.51
HOXB3-207ENST00000472863 IQGAP2Q13576 1575 aa43.18■■■■■ 4.5
HOXB3-207ENST00000472863 CEP170Q5SW79 1584 aa43.16■■■■■ 4.5
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HOXB3-207ENST00000472863 SAMD9Q5K651 1589 aa43.04■■■■■ 4.48
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HOXB3-207ENST00000472863 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.83■■■■■ 4.45
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HOXB3-207ENST00000472863 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42.71■■■■■ 4.43
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HOXB3-207ENST00000472863 ITGAEP38570 1179 aa41.59■■■■■ 4.25
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HOXB3-207ENST00000472863 PTPRKQ15262 1439 aa41.25■■■■■ 4.19
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.25■■■■■ 4.19
HOXB3-207ENST00000472863 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.24■■■■■ 4.19
HOXB3-207ENST00000472863 TTC37Q6PGP7 1564 aa41.24■■■■■ 4.19
HOXB3-207ENST00000472863 ASXL2Q76L83 1435 aa41.22■■■■■ 4.19
HOXB3-207ENST00000472863 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.16■■■■■ 4.18
HOXB3-207ENST00000472863 HRCP23327 699 aa41.15■■■■■ 4.18
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