RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa9.03□□□□□ -0.96
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PTPRC-210ENST00000462363 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa9□□□□□ -0.97
PTPRC-210ENST00000462363 CUX2O14529 1486 aa9□□□□□ -0.97
PTPRC-210ENST00000462363 IGF1RP08069 1367 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRC-210ENST00000462363 TRHP20396 242 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PTPRC-210ENST00000462363 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PTPRC-210ENST00000462363 PDS5BQ9NTI5 1447 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRC-210ENST00000462363 ABCB7O75027 752 aa8.98□□□□□ -0.97
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PTPRC-210ENST00000462363 VPS8Q8N3P4 1428 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRC-210ENST00000462363 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa8.96□□□□□ -0.98
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PTPRC-210ENST00000462363 APLP2Q06481 763 aa8.9□□□□□ -0.98
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PTPRC-210ENST00000462363 MAP3K1Q13233 1512 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-210ENST00000462363 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
PTPRC-210ENST00000462363 CFAP43Q8NDM7 1665 aa8.82□□□□□ -1
PTPRC-210ENST00000462363 IFT140Q96RY7 1462 aa8.82□□□□□ -1
PTPRC-210ENST00000462363 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
PTPRC-210ENST00000462363 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP8.8□□□□□ -1
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PTPRC-210ENST00000462363 FHAD1B1AJZ9 1412 aa8.78□□□□□ -1
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PTPRC-210ENST00000462363 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRC-210ENST00000462363 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRC-210ENST00000462363 UGGT2Q9NYU1 1516 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRC-210ENST00000462363 IQGAP2Q13576 1575 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRC-210ENST00000462363 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRC-210ENST00000462363 FHOD3Q2V2M9 1422 aa8.71□□□□□ -1.01
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PTPRC-210ENST00000462363 ERCC6Q03468 1493 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-210ENST00000462363 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-210ENST00000462363 GRIN2AQ12879 1464 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-210ENST00000462363 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRC-210ENST00000462363 FMN1Q68DA7 1419 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRC-210ENST00000462363 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRC-210ENST00000462363 SYNJ2O15056 1496 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-210ENST00000462363 ARHGEF11O15085 1522 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-210ENST00000462363 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-210ENST00000462363 CEP170Q5SW79 1584 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-210ENST00000462363 DISP1Q96F81 1524 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-210ENST00000462363 KIAA0556O60303 1618 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRC-210ENST00000462363 NUP160Q12769 1436 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRC-210ENST00000462363 HAX1O00165 279 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRC-210ENST00000462363 HECW1Q76N89 1606 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRC-210ENST00000462363 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRC-210ENST00000462363 PHLDB1Q86UU1 1377 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-210ENST00000462363 CCNB3Q8WWL7 1395 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-210ENST00000462363 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-210ENST00000462363 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP8.62□□□□□ -1.03
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PTPRC-210ENST00000462363 CCDC18Q5T9S5 1454 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-210ENST00000462363 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRC-210ENST00000462363 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRC-210ENST00000462363 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRC-210ENST00000462363 SHROOM2Q13796 1616 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-210ENST00000462363 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-210ENST00000462363 P3H3Q8IVL6 736 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-210ENST00000462363 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-210ENST00000462363 CHD1O14646 1710 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-210ENST00000462363 FGD6Q6ZV73 1430 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-210ENST00000462363 NCOA2Q15596 1464 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-210ENST00000462363 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-210ENST00000462363 ABCA8O94911 1581 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-210ENST00000462363 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-210ENST00000462363 ADCY10Q96PN6 1610 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-210ENST00000462363 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-210ENST00000462363 MYOM3Q5VTT5 1437 aa8.54□□□□□ -1.04
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