RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453632.5

TTC28-AS1-218, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 562 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-218ENST00000453632 TSPOAP1O95153 1857 aa21.78■■□□□ 1.08
TTC28-AS1-218ENST00000453632 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.75■■□□□ 1.07
TTC28-AS1-218ENST00000453632 MAPKBP1O60336 1514 aa21.74■■□□□ 1.07
TTC28-AS1-218ENST00000453632 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.72■■□□□ 1.07
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.71■■□□□ 1.07
TTC28-AS1-218ENST00000453632 JPH4Q96JJ6 628 aa21.71■■□□□ 1.07
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.7■■□□□ 1.06
TTC28-AS1-218ENST00000453632 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.68■■□□□ 1.06
TTC28-AS1-218ENST00000453632 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.67■■□□□ 1.06
TTC28-AS1-218ENST00000453632 TOP2BQ02880 1626 aa21.65■■□□□ 1.06
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ADGRL1O94910 1474 aa21.53■■□□□ 1.04
TTC28-AS1-218ENST00000453632 HECW2Q9P2P5 1572 aa21.49■■□□□ 1.03
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
TTC28-AS1-218ENST00000453632 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.41■■□□□ 1.02
TTC28-AS1-218ENST00000453632 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CUL7Q14999 1698 aa21.37■■□□□ 1.01
TTC28-AS1-218ENST00000453632 GLI2P10070 1586 aa21.36■■□□□ 1.01
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PTPRGP23470 1445 aa21.36■■□□□ 1.01
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ASXL2Q76L83 1435 aa21.36■■□□□ 1.01
TTC28-AS1-218ENST00000453632 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ABCC2Q92887 1545 aa21.34■■□□□ 1.01
TTC28-AS1-218ENST00000453632 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.32■■□□□ 1
TTC28-AS1-218ENST00000453632 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.28■■□□□ 1
TTC28-AS1-218ENST00000453632 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.25■□□□□ 0.99
TTC28-AS1-218ENST00000453632 IGF1RP08069 1367 aa21.23■□□□□ 0.99
TTC28-AS1-218ENST00000453632 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.21■□□□□ 0.99
TTC28-AS1-218ENST00000453632 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.2■□□□□ 0.98
TTC28-AS1-218ENST00000453632 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.2■□□□□ 0.98
TTC28-AS1-218ENST00000453632 FBXO41Q8TF61 875 aa21.17■□□□□ 0.98
TTC28-AS1-218ENST00000453632 UACAQ9BZF9 1416 aa21.17■□□□□ 0.98
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
TTC28-AS1-218ENST00000453632 IQGAP2Q13576 1575 aa21.16■□□□□ 0.98
TTC28-AS1-218ENST00000453632 KIF27Q86VH2 1401 aa21.16■□□□□ 0.98
TTC28-AS1-218ENST00000453632 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.13■□□□□ 0.97
TTC28-AS1-218ENST00000453632 DISP1Q96F81 1524 aa21.1■□□□□ 0.97
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.1■□□□□ 0.97
TTC28-AS1-218ENST00000453632 KIF21BO75037 1637 aa21.09■□□□□ 0.97
TTC28-AS1-218ENST00000453632 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.03■□□□□ 0.96
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.01■□□□□ 0.95
TTC28-AS1-218ENST00000453632 KIAA0556O60303 1618 aa20.99■□□□□ 0.95
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CD109Q6YHK3 1445 aa20.97■□□□□ 0.95
TTC28-AS1-218ENST00000453632 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.97■□□□□ 0.95
TTC28-AS1-218ENST00000453632 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.97■□□□□ 0.95
TTC28-AS1-218ENST00000453632 KCNH8Q96L42 1107 aa20.93■□□□□ 0.94
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PTPRMP28827 1452 aa20.9■□□□□ 0.94
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ADAMTSL3P82987 1691 aa20.89■□□□□ 0.94
TTC28-AS1-218ENST00000453632 LMTK3Q96Q04 1460 aa20.86■□□□□ 0.93
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
TTC28-AS1-218ENST00000453632 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.82■□□□□ 0.92
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ABCA8O94911 1581 aa20.82■□□□□ 0.92
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ARAP3Q8WWN8 1544 aa20.82■□□□□ 0.92
TTC28-AS1-218ENST00000453632 MADDQ8WXG6 1647 aa20.81■□□□□ 0.92
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.8■□□□□ 0.92
TTC28-AS1-218ENST00000453632 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.8■□□□□ 0.92
TTC28-AS1-218ENST00000453632 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ARID3CA6NKF2 412 aa20.72■□□□□ 0.91
TTC28-AS1-218ENST00000453632 RAPGEF3O95398 923 aa20.72■□□□□ 0.91
TTC28-AS1-218ENST00000453632 GOLGA3Q08378 1498 aa20.71■□□□□ 0.91
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ABCA9Q8IUA7 1624 aa20.7■□□□□ 0.9
TTC28-AS1-218ENST00000453632 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa20.69■□□□□ 0.9
TTC28-AS1-218ENST00000453632 HSPA2P54652 639 aa20.68■□□□□ 0.9
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ILDR2Q71H61 639 aa20.66■□□□□ 0.9
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.65■□□□□ 0.9
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.64■□□□□ 0.89
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CERKQ8TCT0 537 aa20.64■□□□□ 0.89
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ATP10BO94823 1461 aa20.63■□□□□ 0.89
TTC28-AS1-218ENST00000453632 DISP3Q9P2K9 1392 aa20.62■□□□□ 0.89
TTC28-AS1-218ENST00000453632 NEO1Q92859 1461 aa20.62■□□□□ 0.89
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa20.6■□□□□ 0.89
TTC28-AS1-218ENST00000453632 SOCS7O14512 581 aa20.59■□□□□ 0.89
TTC28-AS1-218ENST00000453632 RICTORQ6R327 1708 aa20.56■□□□□ 0.88
TTC28-AS1-218ENST00000453632 P3H3Q8IVL6 736 aa20.55■□□□□ 0.88
TTC28-AS1-218ENST00000453632 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa20.54■□□□□ 0.88
TTC28-AS1-218ENST00000453632 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa20.51■□□□□ 0.87
TTC28-AS1-218ENST00000453632 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
TTC28-AS1-218ENST00000453632 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
TTC28-AS1-218ENST00000453632 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.49■□□□□ 0.87
TTC28-AS1-218ENST00000453632 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
TTC28-AS1-218ENST00000453632 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
TTC28-AS1-218ENST00000453632 FANCAO15360 1455 aa20.48■□□□□ 0.87
TTC28-AS1-218ENST00000453632 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa20.46■□□□□ 0.87
TTC28-AS1-218ENST00000453632 POGZQ7Z3K3 1410 aa20.46■□□□□ 0.87
TTC28-AS1-218ENST00000453632 MLECQ14165 292 aa20.45■□□□□ 0.86
TTC28-AS1-218ENST00000453632 AKNAQ7Z591 1439 aa20.44■□□□□ 0.86
TTC28-AS1-218ENST00000453632 TTC37Q6PGP7 1564 aa20.44■□□□□ 0.86
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PREX1Q8TCU6 1659 aa20.43■□□□□ 0.86
TTC28-AS1-218ENST00000453632 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.43■□□□□ 0.86
TTC28-AS1-218ENST00000453632 YEATS2Q9ULM3 1422 aa20.43■□□□□ 0.86
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PRXQ9BXM0 1461 aa20.43■□□□□ 0.86
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.43■□□□□ 0.86
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CFAP74Q9C0B2 1584 aa20.42■□□□□ 0.86
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa20.42■□□□□ 0.86
TTC28-AS1-218ENST00000453632 SAMD9Q5K651 1589 aa20.41■□□□□ 0.86
TTC28-AS1-218ENST00000453632 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.4■□□□□ 0.86
TTC28-AS1-218ENST00000453632 STRCQ7RTU9 1775 aa20.4■□□□□ 0.86
TTC28-AS1-218ENST00000453632 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-218ENST00000453632 HECW1Q76N89 1606 aa20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms