RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453632.5

TTC28-AS1-218, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 562 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-218ENST00000453632 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.57■■■□□ 2.48
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TTC28-AS1-218ENST00000453632 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.73■■□□□ 1.87
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.36■■□□□ 1.81
TTC28-AS1-218ENST00000453632 NACADO15069 1562 aa26.36■■□□□ 1.81
TTC28-AS1-218ENST00000453632 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.25■■□□□ 1.79
TTC28-AS1-218ENST00000453632 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.14■■□□□ 1.78
TTC28-AS1-218ENST00000453632 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.02■■□□□ 1.76
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TTC28-AS1-218ENST00000453632 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.66■■□□□ 1.7
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.66■■□□□ 1.7
TTC28-AS1-218ENST00000453632 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.47■■□□□ 1.67
TTC28-AS1-218ENST00000453632 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.47■■□□□ 1.67
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TTC28-AS1-218ENST00000453632 SCRIBQ14160 1630 aa25.3■■□□□ 1.64
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TTC28-AS1-218ENST00000453632 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.16■■□□□ 1.62
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TTC28-AS1-218ENST00000453632 ERCC6Q03468 1493 aa24.58■■□□□ 1.53
TTC28-AS1-218ENST00000453632 NCAPD3P42695 1498 aa24.32■■□□□ 1.48
TTC28-AS1-218ENST00000453632 NESP48681 1621 aa24.25■■□□□ 1.47
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.18■■□□□ 1.46
TTC28-AS1-218ENST00000453632 TRIM41Q8WV44 630 aa24.16■■□□□ 1.46
TTC28-AS1-218ENST00000453632 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
TTC28-AS1-218ENST00000453632 HMGXB3Q12766 1538 aa24.1■■□□□ 1.45
TTC28-AS1-218ENST00000453632 SMARCA2P51531 1590 aa24.08■■□□□ 1.44
TTC28-AS1-218ENST00000453632 SMARCA4P51532 1647 aa24.03■■□□□ 1.44
TTC28-AS1-218ENST00000453632 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.97■■□□□ 1.43
TTC28-AS1-218ENST00000453632 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.92■■□□□ 1.42
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TTC28-AS1-218ENST00000453632 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.64■■□□□ 1.38
TTC28-AS1-218ENST00000453632 WDR62O43379 1518 aa23.61■■□□□ 1.37
TTC28-AS1-218ENST00000453632 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.58■■□□□ 1.37
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.55■■□□□ 1.36
TTC28-AS1-218ENST00000453632 OSCARQ8IYS5 282 aa23.46■■□□□ 1.35
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.42■■□□□ 1.34
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TTC28-AS1-218ENST00000453632 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.34■■□□□ 1.33
TTC28-AS1-218ENST00000453632 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.34■■□□□ 1.33
TTC28-AS1-218ENST00000453632 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.33■■□□□ 1.33
TTC28-AS1-218ENST00000453632 WIZO95785 1651 aa23.32■■□□□ 1.32
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TTC28-AS1-218ENST00000453632 ARHGEF11O15085 1522 aa23.16■■□□□ 1.3
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CFTRP13569 1480 aa23.15■■□□□ 1.3
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TTC28-AS1-218ENST00000453632 CHD1O14646 1710 aa22.91■■□□□ 1.26
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TTC28-AS1-218ENST00000453632 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
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TTC28-AS1-218ENST00000453632 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.66■■□□□ 1.22
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TTC28-AS1-218ENST00000453632 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
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TTC28-AS1-218ENST00000453632 SOGA1O94964 1423 aa22.4■■□□□ 1.18
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
TTC28-AS1-218ENST00000453632 WDR97A6NE52 1622 aa22.35■■□□□ 1.17
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TTC28-AS1-218ENST00000453632 CEP170Q5SW79 1584 aa22.06■■□□□ 1.12
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TTC28-AS1-218ENST00000453632 SHROOM2Q13796 1616 aa21.98■■□□□ 1.11
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ADAMTS12P58397 1594 aa21.95■■□□□ 1.1
TTC28-AS1-218ENST00000453632 NUP160Q12769 1436 aa21.94■■□□□ 1.1
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
TTC28-AS1-218ENST00000453632 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.84■■□□□ 1.09
TTC28-AS1-218ENST00000453632 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.84■■□□□ 1.09
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.82■■□□□ 1.08
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
TTC28-AS1-218ENST00000453632 KDM6BO15054 1643 aa21.8■■□□□ 1.08
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TTC28-AS1-218ENST00000453632 DIP2BQ9P265 1576 aa21.79■■□□□ 1.08
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