RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453632.5

TTC28-AS1-218, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 562 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-218ENST00000453632 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.57■■■□□ 2.48
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ABCC9O60706 1549 aa28.44■■■□□ 2.14
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.76■■■□□ 2.03
TTC28-AS1-218ENST00000453632 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.26■■□□□ 1.95
TTC28-AS1-218ENST00000453632 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.73■■□□□ 1.87
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.36■■□□□ 1.81
TTC28-AS1-218ENST00000453632 NACADO15069 1562 aa26.36■■□□□ 1.81
TTC28-AS1-218ENST00000453632 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.25■■□□□ 1.79
TTC28-AS1-218ENST00000453632 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.14■■□□□ 1.78
TTC28-AS1-218ENST00000453632 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.02■■□□□ 1.76
TTC28-AS1-218ENST00000453632 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.7■■□□□ 1.7
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.66■■□□□ 1.7
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.66■■□□□ 1.7
TTC28-AS1-218ENST00000453632 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.47■■□□□ 1.67
TTC28-AS1-218ENST00000453632 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.47■■□□□ 1.67
TTC28-AS1-218ENST00000453632 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
TTC28-AS1-218ENST00000453632 SCRIBQ14160 1630 aa25.3■■□□□ 1.64
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
TTC28-AS1-218ENST00000453632 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.16■■□□□ 1.62
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CUX2O14529 1486 aa24.72■■□□□ 1.55
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ERCC6Q03468 1493 aa24.58■■□□□ 1.53
TTC28-AS1-218ENST00000453632 NCAPD3P42695 1498 aa24.32■■□□□ 1.48
TTC28-AS1-218ENST00000453632 NESP48681 1621 aa24.25■■□□□ 1.47
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.18■■□□□ 1.46
TTC28-AS1-218ENST00000453632 TRIM41Q8WV44 630 aa24.16■■□□□ 1.46
TTC28-AS1-218ENST00000453632 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
TTC28-AS1-218ENST00000453632 HMGXB3Q12766 1538 aa24.1■■□□□ 1.45
TTC28-AS1-218ENST00000453632 SMARCA2P51531 1590 aa24.08■■□□□ 1.44
TTC28-AS1-218ENST00000453632 SMARCA4P51532 1647 aa24.03■■□□□ 1.44
TTC28-AS1-218ENST00000453632 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.97■■□□□ 1.43
TTC28-AS1-218ENST00000453632 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.92■■□□□ 1.42
TTC28-AS1-218ENST00000453632 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
TTC28-AS1-218ENST00000453632 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.76■■□□□ 1.39
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.74■■□□□ 1.39
TTC28-AS1-218ENST00000453632 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.64■■□□□ 1.38
TTC28-AS1-218ENST00000453632 WDR62O43379 1518 aa23.61■■□□□ 1.37
TTC28-AS1-218ENST00000453632 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.58■■□□□ 1.37
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.55■■□□□ 1.36
TTC28-AS1-218ENST00000453632 OSCARQ8IYS5 282 aa23.46■■□□□ 1.35
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.42■■□□□ 1.34
TTC28-AS1-218ENST00000453632 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.34■■□□□ 1.33
TTC28-AS1-218ENST00000453632 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.34■■□□□ 1.33
TTC28-AS1-218ENST00000453632 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.34■■□□□ 1.33
TTC28-AS1-218ENST00000453632 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.33■■□□□ 1.33
TTC28-AS1-218ENST00000453632 WIZO95785 1651 aa23.32■■□□□ 1.32
TTC28-AS1-218ENST00000453632 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ARHGEF11O15085 1522 aa23.16■■□□□ 1.3
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CFTRP13569 1480 aa23.15■■□□□ 1.3
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.01■■□□□ 1.27
TTC28-AS1-218ENST00000453632 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PRDM2Q13029 1718 aa22.98■■□□□ 1.27
TTC28-AS1-218ENST00000453632 IFT140Q96RY7 1462 aa22.94■■□□□ 1.26
TTC28-AS1-218ENST00000453632 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CHD1O14646 1710 aa22.91■■□□□ 1.26
TTC28-AS1-218ENST00000453632 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ARAP1Q96P48 1450 aa22.89■■□□□ 1.25
TTC28-AS1-218ENST00000453632 TOPBP1Q92547 1522 aa22.82■■□□□ 1.24
TTC28-AS1-218ENST00000453632 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
TTC28-AS1-218ENST00000453632 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
TTC28-AS1-218ENST00000453632 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.73■■□□□ 1.23
TTC28-AS1-218ENST00000453632 FBLN2P98095 1184 aa22.72■■□□□ 1.23
TTC28-AS1-218ENST00000453632 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
TTC28-AS1-218ENST00000453632 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.68■■□□□ 1.22
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ABCC8Q09428 1581 aa22.66■■□□□ 1.22
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.66■■□□□ 1.22
TTC28-AS1-218ENST00000453632 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.54■■□□□ 1.2
TTC28-AS1-218ENST00000453632 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.5■■□□□ 1.19
TTC28-AS1-218ENST00000453632 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.48■■□□□ 1.19
TTC28-AS1-218ENST00000453632 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
TTC28-AS1-218ENST00000453632 SYNJ1O43426 1573 aa22.46■■□□□ 1.19
TTC28-AS1-218ENST00000453632 SOGA1O94964 1423 aa22.4■■□□□ 1.18
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
TTC28-AS1-218ENST00000453632 WDR97A6NE52 1622 aa22.35■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-218ENST00000453632 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.34■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-218ENST00000453632 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-218ENST00000453632 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.32■■□□□ 1.16
TTC28-AS1-218ENST00000453632 SYNJ2O15056 1496 aa22.29■■□□□ 1.16
TTC28-AS1-218ENST00000453632 GRIN2BQ13224 1484 aa22.28■■□□□ 1.16
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PBRM1Q86U86 1689 aa22.26■■□□□ 1.15
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CUX1P39880 1505 aa22.2■■□□□ 1.14
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.2■■□□□ 1.14
TTC28-AS1-218ENST00000453632 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.13■■□□□ 1.13
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.06■■□□□ 1.12
TTC28-AS1-218ENST00000453632 CEP170Q5SW79 1584 aa22.06■■□□□ 1.12
TTC28-AS1-218ENST00000453632 GRIN2AQ12879 1464 aa22.02■■□□□ 1.12
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.98■■□□□ 1.11
TTC28-AS1-218ENST00000453632 SHROOM2Q13796 1616 aa21.98■■□□□ 1.11
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ADAMTS12P58397 1594 aa21.95■■□□□ 1.1
TTC28-AS1-218ENST00000453632 NUP160Q12769 1436 aa21.94■■□□□ 1.1
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
TTC28-AS1-218ENST00000453632 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.84■■□□□ 1.09
TTC28-AS1-218ENST00000453632 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.84■■□□□ 1.09
TTC28-AS1-218ENST00000453632 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.82■■□□□ 1.08
TTC28-AS1-218ENST00000453632 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
TTC28-AS1-218ENST00000453632 KDM6BO15054 1643 aa21.8■■□□□ 1.08
TTC28-AS1-218ENST00000453632 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.8■■□□□ 1.08
TTC28-AS1-218ENST00000453632 DIP2BQ9P265 1576 aa21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms