RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 PBRM1Q86U86 1689 aa35.42■■■■□ 3.26
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.4■■■■□ 3.26
FAAP20-209ENST00000428120 IFT140Q96RY7 1462 aa35.39■■■■□ 3.26
FAAP20-209ENST00000428120 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP35.38■■■■□ 3.25
FAAP20-209ENST00000428120 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.35■■■■□ 3.25
FAAP20-209ENST00000428120 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
FAAP20-209ENST00000428120 GRIN2BQ13224 1484 aa35.3■■■■□ 3.24
FAAP20-209ENST00000428120 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.29■■■■□ 3.24
FAAP20-209ENST00000428120 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
FAAP20-209ENST00000428120 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
FAAP20-209ENST00000428120 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.28■■■■□ 3.24
FAAP20-209ENST00000428120 ADAMTS12P58397 1594 aa35.26■■■■□ 3.23
FAAP20-209ENST00000428120 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
FAAP20-209ENST00000428120 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
FAAP20-209ENST00000428120 TIAM1Q13009 1591 aa35.19■■■■□ 3.22
FAAP20-209ENST00000428120 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
FAAP20-209ENST00000428120 SAMD9Q5K651 1589 aa35.12■■■■□ 3.21
FAAP20-209ENST00000428120 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.1■■■■□ 3.21
FAAP20-209ENST00000428120 MAP3K1Q13233 1512 aa35.1■■■■□ 3.21
FAAP20-209ENST00000428120 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.06■■■■□ 3.2
FAAP20-209ENST00000428120 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.06■■■■□ 3.2
FAAP20-209ENST00000428120 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.05■■■■□ 3.2
FAAP20-209ENST00000428120 FMN1Q68DA7 1419 aa35.05■■■■□ 3.2
FAAP20-209ENST00000428120 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.01■■■■□ 3.2
FAAP20-209ENST00000428120 IQGAP2Q13576 1575 aa35.01■■■■□ 3.2
FAAP20-209ENST00000428120 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP35■■■■□ 3.19
FAAP20-209ENST00000428120 CCNB3Q8WWL7 1395 aa34.92■■■■□ 3.18
FAAP20-209ENST00000428120 GRIN2AQ12879 1464 aa34.92■■■■□ 3.18
FAAP20-209ENST00000428120 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.88■■■■□ 3.17
FAAP20-209ENST00000428120 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.87■■■■□ 3.17
FAAP20-209ENST00000428120 FBLN2P98095 1184 aa34.85■■■■□ 3.17
FAAP20-209ENST00000428120 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.85■■■■□ 3.17
FAAP20-209ENST00000428120 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa34.82■■■■□ 3.16
FAAP20-209ENST00000428120 ITGAEP38570 1179 aa34.82■■■■□ 3.16
FAAP20-209ENST00000428120 SYNJ2O15056 1496 aa34.81■■■■□ 3.16
FAAP20-209ENST00000428120 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.81■■■■□ 3.16
FAAP20-209ENST00000428120 UGGT2Q9NYU1 1516 aa34.79■■■■□ 3.16
FAAP20-209ENST00000428120 MTUS2Q5JR59 1369 aa34.72■■■■□ 3.15
FAAP20-209ENST00000428120 CEP170Q5SW79 1584 aa34.71■■■■□ 3.15
FAAP20-209ENST00000428120 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP34.68■■■■□ 3.14
FAAP20-209ENST00000428120 DISP1Q96F81 1524 aa34.68■■■■□ 3.14
FAAP20-209ENST00000428120 KIAA0556O60303 1618 aa34.65■■■■□ 3.14
FAAP20-209ENST00000428120 ARID3CA6NKF2 412 aa34.61■■■■□ 3.13
FAAP20-209ENST00000428120 HECW1Q76N89 1606 aa34.61■■■■□ 3.13
FAAP20-209ENST00000428120 NUP160Q12769 1436 aa34.57■■■■□ 3.12
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.57■■■■□ 3.12
FAAP20-209ENST00000428120 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.55■■■■□ 3.12
FAAP20-209ENST00000428120 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.55■■■■□ 3.12
FAAP20-209ENST00000428120 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
FAAP20-209ENST00000428120 NCOA2Q15596 1464 aa34.52■■■■□ 3.12
FAAP20-209ENST00000428120 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.52■■■■□ 3.12
FAAP20-209ENST00000428120 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP34.49■■■■□ 3.11
FAAP20-209ENST00000428120 FGD6Q6ZV73 1430 aa34.49■■■■□ 3.11
FAAP20-209ENST00000428120 JPH4Q96JJ6 628 aa34.48■■■■□ 3.11
FAAP20-209ENST00000428120 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
FAAP20-209ENST00000428120 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa34.41■■■■□ 3.1
FAAP20-209ENST00000428120 MYOM3Q5VTT5 1437 aa34.4■■■■□ 3.1
FAAP20-209ENST00000428120 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.39■■■■□ 3.1
FAAP20-209ENST00000428120 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.38■■■■□ 3.09
FAAP20-209ENST00000428120 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.38■■■■□ 3.09
FAAP20-209ENST00000428120 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP34.37■■■■□ 3.091e-7■■■■□ 21
FAAP20-209ENST00000428120 SETD5Q9C0A6 1442 aa34.34■■■■□ 3.09
FAAP20-209ENST00000428120 ARHGEF11O15085 1522 aa34.34■■■■□ 3.09
FAAP20-209ENST00000428120 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.33■■■■□ 3.09
FAAP20-209ENST00000428120 CHD1O14646 1710 aa34.32■■■■□ 3.08
FAAP20-209ENST00000428120 CLSPNQ9HAW4 1339 aa34.27■■■■□ 3.08
FAAP20-209ENST00000428120 PTPN23Q9H3S7 1636 aa34.23■■■■□ 3.07
FAAP20-209ENST00000428120 PTPRKQ15262 1439 aa34.22■■■■□ 3.07
FAAP20-209ENST00000428120 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.19■■■■□ 3.06
FAAP20-209ENST00000428120 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
FAAP20-209ENST00000428120 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
FAAP20-209ENST00000428120 MAPKBP1O60336 1514 aa34.08■■■■□ 3.05
FAAP20-209ENST00000428120 ABCA8O94911 1581 aa34.07■■■■□ 3.04
FAAP20-209ENST00000428120 MIA2Q96PC5 1412 aa34.06■■■■□ 3.04
FAAP20-209ENST00000428120 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.05■■■■□ 3.04
FAAP20-209ENST00000428120 HFM1A2PYH4 1435 aa34.04■■■■□ 3.04
FAAP20-209ENST00000428120 PTPRGP23470 1445 aa34.03■■■■□ 3.04
FAAP20-209ENST00000428120 CHIC2Q9UKJ5 165 aa34.03■■■■□ 3.04
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP34.01■■■■□ 3.03
FAAP20-209ENST00000428120 NAIPQ13075 1403 aa33.98■■■■□ 3.03
FAAP20-209ENST00000428120 SHROOM2Q13796 1616 aa33.97■■■■□ 3.03
FAAP20-209ENST00000428120 KIF14Q15058 1648 aa33.97■■■■□ 3.03
FAAP20-209ENST00000428120 ATP10BO94823 1461 aa33.96■■■■□ 3.03
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP33.96■■■■□ 3.03
FAAP20-209ENST00000428120 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa33.96■■■■□ 3.03
FAAP20-209ENST00000428120 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.93■■■■□ 3.02
FAAP20-209ENST00000428120 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP33.91■■■■□ 3.02
FAAP20-209ENST00000428120 PLEKHD1A6NEE1 506 aa33.91■■■■□ 3.02
FAAP20-209ENST00000428120 ADCY10Q96PN6 1610 aa33.87■■■■□ 3.01
FAAP20-209ENST00000428120 SIN3AQ96ST3 1273 aa33.86■■■■□ 3.01
FAAP20-209ENST00000428120 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP33.86■■■■□ 3.01
FAAP20-209ENST00000428120 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP33.85■■■■□ 3.01
FAAP20-209ENST00000428120 NEUROD1Q13562 356 aa33.83■■■■□ 3.01
FAAP20-209ENST00000428120 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.82■■■■□ 3
FAAP20-209ENST00000428120 DAPK1P53355 1430 aa33.82■■■■□ 3
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP33.81■■■■□ 3
FAAP20-209ENST00000428120 UACAQ9BZF9 1416 aa33.81■■■■□ 3
FAAP20-209ENST00000428120 ITSN2Q9NZM3 1697 aa33.8■■■■□ 3
FAAP20-209ENST00000428120 ABCC5O15440 1437 aa33.79■■■■□ 3
FAAP20-209ENST00000428120 GCC2Q8IWJ2 1684 aa33.78■■■■□ 3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms