RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400919.7

FAAP20-204, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene FAAP20, Length 1,413 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-204ENST00000400919 PRXQ9BXM0 1461 aa45.62■■■■■ 4.89
FAAP20-204ENST00000400919 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP45.61■■■■■ 4.89
FAAP20-204ENST00000400919 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa45.61■■■■■ 4.89
FAAP20-204ENST00000400919 JPH4Q96JJ6 628 aa45.59■■■■■ 4.89
FAAP20-204ENST00000400919 SHROOM2Q13796 1616 aa45.48■■■■■ 4.87
FAAP20-204ENST00000400919 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.46■■■■■ 4.87
FAAP20-204ENST00000400919 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP45.43■■■■■ 4.86
FAAP20-204ENST00000400919 ARAP1Q96P48 1450 aa45.4■■■■■ 4.86
FAAP20-204ENST00000400919 IQGAP2Q13576 1575 aa45.33■■■■■ 4.85
FAAP20-204ENST00000400919 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.29■■■■■ 4.84
FAAP20-204ENST00000400919 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa45.18■■■■■ 4.82
FAAP20-204ENST00000400919 KIF21BO75037 1637 aa45.17■■■■■ 4.82
FAAP20-204ENST00000400919 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa45.12■■■■■ 4.81
FAAP20-204ENST00000400919 UGGT2Q9NYU1 1516 aa45.1■■■■■ 4.81
FAAP20-204ENST00000400919 GOLGA3Q08378 1498 aa45.01■■■■■ 4.8
FAAP20-204ENST00000400919 TNIKQ9UKE5 1360 aa44.99■■■■■ 4.79
FAAP20-204ENST00000400919 UBTFP17480 764 aaKnown RBP44.99■■■■■ 4.79
FAAP20-204ENST00000400919 EHMT2Q96KQ7 1210 aa44.99■■■■■ 4.79
FAAP20-204ENST00000400919 DISP1Q96F81 1524 aa44.98■■■■■ 4.79
FAAP20-204ENST00000400919 PTPRGP23470 1445 aa44.95■■■■■ 4.79
FAAP20-204ENST00000400919 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP44.89■■■■■ 4.78
FAAP20-204ENST00000400919 KIAA0556O60303 1618 aa44.86■■■■■ 4.77
FAAP20-204ENST00000400919 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP44.77■■■■■ 4.76
FAAP20-204ENST00000400919 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP44.69■■■■■ 4.75
FAAP20-204ENST00000400919 P3H3Q8IVL6 736 aa44.69■■■■■ 4.75
FAAP20-204ENST00000400919 UACAQ9BZF9 1416 aa44.63■■■■■ 4.74
FAAP20-204ENST00000400919 SAMD9Q5K651 1589 aa44.62■■■■■ 4.73
FAAP20-204ENST00000400919 ADCY10Q96PN6 1610 aa44.57■■■■■ 4.73
FAAP20-204ENST00000400919 EFCAB5A4FU69 1503 aa44.55■■■■■ 4.72
FAAP20-204ENST00000400919 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa44.54■■■■■ 4.72
FAAP20-204ENST00000400919 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44.5■■■■■ 4.71
FAAP20-204ENST00000400919 ABCC2Q92887 1545 aa44.49■■■■■ 4.71
FAAP20-204ENST00000400919 PLB1Q6P1J6 1458 aa44.45■■■■■ 4.71
FAAP20-204ENST00000400919 FHOD3Q2V2M9 1422 aa44.45■■■■■ 4.71
FAAP20-204ENST00000400919 ABCA8O94911 1581 aa44.36■■■■■ 4.69
FAAP20-204ENST00000400919 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa44.35■■■■■ 4.69
FAAP20-204ENST00000400919 MAPKBP1O60336 1514 aa44.32■■■■■ 4.68
FAAP20-204ENST00000400919 KDM5BQ9UGL1 1544 aa44.32■■■■■ 4.68
FAAP20-204ENST00000400919 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa44.28■■■■■ 4.68
FAAP20-204ENST00000400919 CLIP1P30622 1438 aa44.23■■■■■ 4.67
FAAP20-204ENST00000400919 FMN1Q68DA7 1419 aa44.21■■■■■ 4.67
FAAP20-204ENST00000400919 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa44.17■■■■■ 4.66
FAAP20-204ENST00000400919 ASXL2Q76L83 1435 aa44.17■■■■■ 4.66
FAAP20-204ENST00000400919 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP44.14■■■■■ 4.66
FAAP20-204ENST00000400919 ABCC10Q5T3U5 1492 aa44.12■■■■■ 4.65
FAAP20-204ENST00000400919 ARID3CA6NKF2 412 aa44.11■■■■■ 4.65
FAAP20-204ENST00000400919 FAM69CQ0P6D2 419 aa44.1■■■■■ 4.65
FAAP20-204ENST00000400919 CEP162Q5TB80 1403 aa44.06■■■■■ 4.64
FAAP20-204ENST00000400919 ATP10BO94823 1461 aa44.06■■■■■ 4.64
FAAP20-204ENST00000400919 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP44.05■■■■■ 4.64
FAAP20-204ENST00000400919 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP44.05■■■■■ 4.64
FAAP20-204ENST00000400919 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP44.05■■■■■ 4.64
FAAP20-204ENST00000400919 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP44.01■■■■■ 4.64
FAAP20-204ENST00000400919 WDR7Q9Y4E6 1490 aa43.98■■■■■ 4.63
FAAP20-204ENST00000400919 DIP2BQ9P265 1576 aa43.97■■■■■ 4.63
FAAP20-204ENST00000400919 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP43.88■■■■■ 4.62
FAAP20-204ENST00000400919 HECW1Q76N89 1606 aa43.88■■■■■ 4.61
FAAP20-204ENST00000400919 KIF13AQ9H1H9 1805 aa43.88■■■■■ 4.61
FAAP20-204ENST00000400919 KCNH8Q96L42 1107 aa43.87■■■■■ 4.61
FAAP20-204ENST00000400919 PLEKHD1A6NEE1 506 aa43.85■■■■■ 4.61
FAAP20-204ENST00000400919 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa43.85■■■■■ 4.61
FAAP20-204ENST00000400919 GLI2P10070 1586 aa43.82■■■■■ 4.61
FAAP20-204ENST00000400919 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP43.77■■■■■ 4.6
FAAP20-204ENST00000400919 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP43.74■■■■■ 4.59
FAAP20-204ENST00000400919 FYCO1Q9BQS8 1478 aa43.74■■■■■ 4.59
FAAP20-204ENST00000400919 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP43.73■■■■■ 4.59
FAAP20-204ENST00000400919 CCDC18Q5T9S5 1454 aa43.66■■■■■ 4.58
FAAP20-204ENST00000400919 CD109Q6YHK3 1445 aa43.59■■■■■ 4.57
FAAP20-204ENST00000400919 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa43.56■■■■■ 4.56
FAAP20-204ENST00000400919 VPS8Q8N3P4 1428 aa43.53■■■■■ 4.56
FAAP20-204ENST00000400919 TSPOAP1O95153 1857 aa43.52■■■■■ 4.56
FAAP20-204ENST00000400919 TEX14Q8IWB6 1497 aa43.5■■■■■ 4.55
FAAP20-204ENST00000400919 CFAP43Q8NDM7 1665 aa43.5■■■■■ 4.55
FAAP20-204ENST00000400919 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP43.48■■■■■ 4.55
FAAP20-204ENST00000400919 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa43.46■■■■■ 4.55
FAAP20-204ENST00000400919 ABCA9Q8IUA7 1624 aa43.46■■■■■ 4.55
FAAP20-204ENST00000400919 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa43.45■■■■■ 4.55
FAAP20-204ENST00000400919 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP43.38■■■■■ 4.53
FAAP20-204ENST00000400919 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP43.36■■■■■ 4.535e-8■■■□□ 16
FAAP20-204ENST00000400919 KIF14Q15058 1648 aa43.31■■■■■ 4.52
FAAP20-204ENST00000400919 MTUS2Q5JR59 1369 aa43.29■■■■■ 4.52
FAAP20-204ENST00000400919 PHLDB1Q86UU1 1377 aa43.25■■■■■ 4.51
FAAP20-204ENST00000400919 TTC37Q6PGP7 1564 aa43.24■■■■■ 4.51
FAAP20-204ENST00000400919 KDM6BO15054 1643 aa43.24■■■■■ 4.51
FAAP20-204ENST00000400919 APLP2Q06481 763 aa43.21■■■■■ 4.51
FAAP20-204ENST00000400919 PLCH2O75038 1416 aa43.19■■■■■ 4.5
FAAP20-204ENST00000400919 NEO1Q92859 1461 aa43.18■■■■■ 4.5
FAAP20-204ENST00000400919 FANCAO15360 1455 aa43.13■■■■■ 4.5
FAAP20-204ENST00000400919 TIAM1Q13009 1591 aa43.13■■■■■ 4.49
FAAP20-204ENST00000400919 MAP3K1Q13233 1512 aa43.11■■■■■ 4.49
FAAP20-204ENST00000400919 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa43.11■■■■■ 4.49
FAAP20-204ENST00000400919 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa43.11■■■■■ 4.49
FAAP20-204ENST00000400919 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP43.09■■■■■ 4.49
FAAP20-204ENST00000400919 ARAP3Q8WWN8 1544 aa43.07■■■■■ 4.48
FAAP20-204ENST00000400919 MYO5CQ9NQX4 1742 aa43.04■■■■■ 4.48
FAAP20-204ENST00000400919 CFAP74Q9C0B2 1584 aa43.04■■■■■ 4.48
FAAP20-204ENST00000400919 AKNAQ7Z591 1439 aa43.04■■■■■ 4.48
FAAP20-204ENST00000400919 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa43■■■■■ 4.47
FAAP20-204ENST00000400919 CCNB3Q8WWL7 1395 aa42.99■■■■■ 4.47
FAAP20-204ENST00000400919 ARHGAP5Q13017 1502 aa42.99■■■■■ 4.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms