RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376510.7

MSRB2-201, Transcript of methionine sulfoxide reductase B2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSRB2, Length 1,803 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB2-201ENST00000376510 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.63■■■■■ 4.41
MSRB2-201ENST00000376510 ADAMTS12P58397 1594 aa42.6■■■■■ 4.41
MSRB2-201ENST00000376510 APLP2Q06481 763 aa42.55■■■■■ 4.4
MSRB2-201ENST00000376510 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.45■■■■■ 4.39
MSRB2-201ENST00000376510 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.42■■■■■ 4.38
MSRB2-201ENST00000376510 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.37■■■■■ 4.37
MSRB2-201ENST00000376510 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.37■■■■■ 4.37
MSRB2-201ENST00000376510 P3H3Q8IVL6 736 aa42.29■■■■■ 4.36
MSRB2-201ENST00000376510 GRIN2AQ12879 1464 aa42.23■■■■■ 4.35
MSRB2-201ENST00000376510 SYNJ2O15056 1496 aa42.21■■■■■ 4.35
MSRB2-201ENST00000376510 IQGAP2Q13576 1575 aa42.2■■■■■ 4.35
MSRB2-201ENST00000376510 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.2■■■■■ 4.35
MSRB2-201ENST00000376510 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.2■■■■■ 4.35
MSRB2-201ENST00000376510 SAMD9Q5K651 1589 aa42.19■■■■■ 4.34
MSRB2-201ENST00000376510 FBLN2P98095 1184 aa42.09■■■■■ 4.33
MSRB2-201ENST00000376510 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.08■■■■■ 4.33
MSRB2-201ENST00000376510 FMN1Q68DA7 1419 aa42.07■■■■■ 4.33
MSRB2-201ENST00000376510 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42.02■■■■■ 4.32
MSRB2-201ENST00000376510 MAP3K1Q13233 1512 aa42.01■■■■■ 4.32
MSRB2-201ENST00000376510 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.98■■■■■ 4.31
MSRB2-201ENST00000376510 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.98■■■■■ 4.31
MSRB2-201ENST00000376510 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.97■■■■■ 4.31
MSRB2-201ENST00000376510 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.96■■■■■ 4.31
MSRB2-201ENST00000376510 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP41.95■■■■■ 4.31
MSRB2-201ENST00000376510 TIAM1Q13009 1591 aa41.94■■■■■ 4.3
MSRB2-201ENST00000376510 CEP170Q5SW79 1584 aa41.94■■■■■ 4.3
MSRB2-201ENST00000376510 NUP160Q12769 1436 aa41.88■■■■■ 4.29
MSRB2-201ENST00000376510 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.83■■■■■ 4.29
MSRB2-201ENST00000376510 HRCP23327 699 aa41.81■■■■■ 4.28
MSRB2-201ENST00000376510 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa41.75■■■■■ 4.27
MSRB2-201ENST00000376510 KIAA0556O60303 1618 aa41.75■■■■■ 4.27
MSRB2-201ENST00000376510 DISP1Q96F81 1524 aa41.73■■■■■ 4.27
MSRB2-201ENST00000376510 CHD1O14646 1710 aa41.7■■■■■ 4.27
MSRB2-201ENST00000376510 JPH4Q96JJ6 628 aa41.67■■■■■ 4.26
MSRB2-201ENST00000376510 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.62■■■■■ 4.25
MSRB2-201ENST00000376510 HECW1Q76N89 1606 aa41.6■■■■■ 4.25
MSRB2-201ENST00000376510 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.57■■■■■ 4.24
MSRB2-201ENST00000376510 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.55■■■■■ 4.24
MSRB2-201ENST00000376510 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP41.52■■■■■ 4.24
MSRB2-201ENST00000376510 MTUS2Q5JR59 1369 aa41.48■■■■■ 4.23
MSRB2-201ENST00000376510 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.48■■■■■ 4.23
MSRB2-201ENST00000376510 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.43■■■■■ 4.22
MSRB2-201ENST00000376510 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
MSRB2-201ENST00000376510 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.4■■■■■ 4.22
MSRB2-201ENST00000376510 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.36■■■■■ 4.21
MSRB2-201ENST00000376510 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa41.35■■■■■ 4.21
MSRB2-201ENST00000376510 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.35■■■■■ 4.21
MSRB2-201ENST00000376510 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP41.34■■■■■ 4.21
MSRB2-201ENST00000376510 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41.28■■■■■ 4.2
MSRB2-201ENST00000376510 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.28■■■■■ 4.2
MSRB2-201ENST00000376510 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP41.28■■■■■ 4.2
MSRB2-201ENST00000376510 SHROOM2Q13796 1616 aa41.27■■■■■ 4.2
MSRB2-201ENST00000376510 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.26■■■■■ 4.2
MSRB2-201ENST00000376510 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP41.24■■■■■ 4.19
MSRB2-201ENST00000376510 ARID3CA6NKF2 412 aa41.23■■■■■ 4.19
MSRB2-201ENST00000376510 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.22■■■■■ 4.19
MSRB2-201ENST00000376510 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.21■■■■■ 4.19
MSRB2-201ENST00000376510 NCOA2Q15596 1464 aa41.2■■■■■ 4.19
MSRB2-201ENST00000376510 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.17■■■■■ 4.18
MSRB2-201ENST00000376510 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP41.16■■■■■ 4.18
MSRB2-201ENST00000376510 PTPRGP23470 1445 aa41.15■■■■■ 4.18
MSRB2-201ENST00000376510 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.14■■■■■ 4.18
MSRB2-201ENST00000376510 ABCA8O94911 1581 aa41.12■■■■■ 4.17
MSRB2-201ENST00000376510 ITGAEP38570 1179 aa41.09■■■■■ 4.17
MSRB2-201ENST00000376510 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.08■■■■■ 4.17
MSRB2-201ENST00000376510 ARHGEF11O15085 1522 aa41.07■■■■■ 4.16
MSRB2-201ENST00000376510 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.07■■■■■ 4.16
MSRB2-201ENST00000376510 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.06■■■■■ 4.16
MSRB2-201ENST00000376510 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.96■■■■■ 4.15
MSRB2-201ENST00000376510 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.92■■■■■ 4.14
MSRB2-201ENST00000376510 UACAQ9BZF9 1416 aa40.89■■■■■ 4.14
MSRB2-201ENST00000376510 ATP10BO94823 1461 aa40.89■■■■■ 4.14
MSRB2-201ENST00000376510 PTPN23Q9H3S7 1636 aa40.87■■■■■ 4.13
MSRB2-201ENST00000376510 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.84■■■■■ 4.13
MSRB2-201ENST00000376510 MIA2Q96PC5 1412 aa40.82■■■■■ 4.13
MSRB2-201ENST00000376510 OSCARQ8IYS5 282 aa40.79■■■■■ 4.12
MSRB2-201ENST00000376510 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.78■■■■■ 4.12
MSRB2-201ENST00000376510 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP40.77■■■■■ 4.12
MSRB2-201ENST00000376510 ABCC2Q92887 1545 aa40.74■■■■■ 4.11
MSRB2-201ENST00000376510 SETD5Q9C0A6 1442 aa40.72■■■■■ 4.11
MSRB2-201ENST00000376510 KIF14Q15058 1648 aa40.68■■■■■ 4.1
MSRB2-201ENST00000376510 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa40.66■■■■■ 4.1
MSRB2-201ENST00000376510 ITSN2Q9NZM3 1697 aa40.66■■■■■ 4.1
MSRB2-201ENST00000376510 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.61■■■■■ 4.09
MSRB2-201ENST00000376510 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP40.59■■■■■ 4.09
MSRB2-201ENST00000376510 PTPRKQ15262 1439 aa40.57■■■■■ 4.08
MSRB2-201ENST00000376510 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP40.56■■■■■ 4.08
MSRB2-201ENST00000376510 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP40.56■■■■■ 4.08
MSRB2-201ENST00000376510 CLSPNQ9HAW4 1339 aa40.53■■■■■ 4.08
MSRB2-201ENST00000376510 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.51■■■■■ 4.08
MSRB2-201ENST00000376510 HFM1A2PYH4 1435 aa40.47■■■■■ 4.07
MSRB2-201ENST00000376510 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.46■■■■■ 4.07
MSRB2-201ENST00000376510 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.45■■■■■ 4.07
MSRB2-201ENST00000376510 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa40.45■■■■■ 4.07
MSRB2-201ENST00000376510 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP40.43■■■■■ 4.06
MSRB2-201ENST00000376510 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa40.41■■■■■ 4.06
MSRB2-201ENST00000376510 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP40.4■■■■■ 4.06
MSRB2-201ENST00000376510 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP40.39■■■■■ 4.06
MSRB2-201ENST00000376510 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.39■■■■■ 4.06
MSRB2-201ENST00000376510 DAPK1P53355 1430 aa40.39■■■■■ 4.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms