RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371935.6

REXO4-201, Transcript of REX4 homolog, 3'-5' exonuclease, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene REXO4, Length 1,899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4-201ENST00000371935 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.92■■■■□ 3.82
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REXO4-201ENST00000371935 EFCAB5A4FU69 1503 aa38.88■■■■□ 3.81
REXO4-201ENST00000371935 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.86■■■■□ 3.81
REXO4-201ENST00000371935 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.83■■■■□ 3.81
REXO4-201ENST00000371935 SAMD9Q5K651 1589 aa38.7■■■■□ 3.79
REXO4-201ENST00000371935 FHOD3Q2V2M9 1422 aa38.67■■■■□ 3.78
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REXO4-201ENST00000371935 MAP3K1Q13233 1512 aa38.63■■■■□ 3.77
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REXO4-201ENST00000371935 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP38.6■■■■□ 3.77
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REXO4-201ENST00000371935 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.53■■■■□ 3.76
REXO4-201ENST00000371935 FYCO1Q9BQS8 1478 aa38.52■■■■□ 3.76
REXO4-201ENST00000371935 FMN1Q68DA7 1419 aa38.48■■■■□ 3.75
REXO4-201ENST00000371935 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa38.48■■■■□ 3.75
REXO4-201ENST00000371935 GRIN2AQ12879 1464 aa38.47■■■■□ 3.75
REXO4-201ENST00000371935 SYNJ2O15056 1496 aa38.39■■■■□ 3.74
REXO4-201ENST00000371935 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP38.39■■■■□ 3.74
REXO4-201ENST00000371935 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa38.38■■■■□ 3.74
REXO4-201ENST00000371935 UGGT2Q9NYU1 1516 aa38.36■■■■□ 3.73
REXO4-201ENST00000371935 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.36■■■■□ 3.73
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REXO4-201ENST00000371935 CEP170Q5SW79 1584 aa38.26■■■■□ 3.72
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REXO4-201ENST00000371935 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP38.21■■■■□ 3.71
REXO4-201ENST00000371935 KIAA0556O60303 1618 aa38.18■■■■□ 3.7
REXO4-201ENST00000371935 NUP160Q12769 1436 aa38.16■■■■□ 3.7
REXO4-201ENST00000371935 DISP1Q96F81 1524 aa38.15■■■■□ 3.7
REXO4-201ENST00000371935 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP38.13■■■■□ 3.7
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REXO4-201ENST00000371935 HECW1Q76N89 1606 aa38.09■■■■□ 3.69
REXO4-201ENST00000371935 FBLN2P98095 1184 aa38.07■■■■□ 3.69
REXO4-201ENST00000371935 PHLDB1Q86UU1 1377 aa38.06■■■■□ 3.68
REXO4-201ENST00000371935 CCDC18Q5T9S5 1454 aa38.03■■■■□ 3.68
REXO4-201ENST00000371935 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa37.94■■■■□ 3.66
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REXO4-201ENST00000371935 CHD1O14646 1710 aa37.93■■■■□ 3.66
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REXO4-201ENST00000371935 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa37.87■■■■□ 3.65
REXO4-201ENST00000371935 JPH4Q96JJ6 628 aa37.84■■■■□ 3.65
REXO4-201ENST00000371935 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa37.83■■■■□ 3.65
REXO4-201ENST00000371935 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP37.82■■■■□ 3.65
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REXO4-201ENST00000371935 ARHGEF11O15085 1522 aa37.78■■■■□ 3.64
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REXO4-201ENST00000371935 CLSPNQ9HAW4 1339 aa37.44■■■■□ 3.58
REXO4-201ENST00000371935 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP37.44■■■■□ 3.58
REXO4-201ENST00000371935 MIA2Q96PC5 1412 aa37.42■■■■□ 3.58
REXO4-201ENST00000371935 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP37.41■■■■□ 3.58
REXO4-201ENST00000371935 ADCY10Q96PN6 1610 aa37.4■■■■□ 3.58
REXO4-201ENST00000371935 PTPRGP23470 1445 aa37.39■■■■□ 3.58
REXO4-201ENST00000371935 PTPRKQ15262 1439 aa37.37■■■■□ 3.57
REXO4-201ENST00000371935 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.33■■■■□ 3.57
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REXO4-201ENST00000371935 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP37.14■■■■□ 3.54
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REXO4-201ENST00000371935 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa37.04■■■■□ 3.52
REXO4-201ENST00000371935 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP37.02■■■■□ 3.52
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REXO4-201ENST00000371935 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.99■■■■□ 3.51
REXO4-201ENST00000371935 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.98■■■■□ 3.51
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