RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354050.8

PLTP-201, Transcript of phospholipid transfer protein, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PLTP, Length 1,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTP-201ENST00000354050 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.56■■□□□ 1.36
PLTP-201ENST00000354050 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.49■■□□□ 1.35
PLTP-201ENST00000354050 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.48■■□□□ 1.35
PLTP-201ENST00000354050 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PLTP-201ENST00000354050 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PLTP-201ENST00000354050 SAMD9Q5K651 1589 aa23.38■■□□□ 1.33
PLTP-201ENST00000354050 APLP2Q06481 763 aa23.37■■□□□ 1.33
PLTP-201ENST00000354050 IQGAP2Q13576 1575 aa23.37■■□□□ 1.33
PLTP-201ENST00000354050 GRIN2AQ12879 1464 aa23.36■■□□□ 1.33
PLTP-201ENST00000354050 SYNJ2O15056 1496 aa23.35■■□□□ 1.33
PLTP-201ENST00000354050 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.31■■□□□ 1.32
PLTP-201ENST00000354050 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
PLTP-201ENST00000354050 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
PLTP-201ENST00000354050 P3H3Q8IVL6 736 aa23.26■■□□□ 1.31
PLTP-201ENST00000354050 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.25■■□□□ 1.31
PLTP-201ENST00000354050 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PLTP-201ENST00000354050 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.24■■□□□ 1.31
PLTP-201ENST00000354050 CEP170Q5SW79 1584 aa23.23■■□□□ 1.31
PLTP-201ENST00000354050 FMN1Q68DA7 1419 aa23.23■■□□□ 1.31
PLTP-201ENST00000354050 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.22■■□□□ 1.31
PLTP-201ENST00000354050 MAP3K1Q13233 1512 aa23.22■■□□□ 1.31
PLTP-201ENST00000354050 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.21■■□□□ 1.31
PLTP-201ENST00000354050 TIAM1Q13009 1591 aa23.21■■□□□ 1.31
PLTP-201ENST00000354050 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.18■■□□□ 1.3
PLTP-201ENST00000354050 NUP160Q12769 1436 aa23.17■■□□□ 1.3
PLTP-201ENST00000354050 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.17■■□□□ 1.3
PLTP-201ENST00000354050 FBLN2P98095 1184 aa23.16■■□□□ 1.3
PLTP-201ENST00000354050 CHD1O14646 1710 aa23.15■■□□□ 1.3
PLTP-201ENST00000354050 KIAA0556O60303 1618 aa23.13■■□□□ 1.29
PLTP-201ENST00000354050 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
PLTP-201ENST00000354050 DISP1Q96F81 1524 aa23.08■■□□□ 1.29
PLTP-201ENST00000354050 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.06■■□□□ 1.28
PLTP-201ENST00000354050 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.05■■□□□ 1.28
PLTP-201ENST00000354050 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
PLTP-201ENST00000354050 HECW1Q76N89 1606 aa23.04■■□□□ 1.28
PLTP-201ENST00000354050 HRCP23327 699 aa22.98■■□□□ 1.27
PLTP-201ENST00000354050 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.98■■□□□ 1.27
PLTP-201ENST00000354050 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.97■■□□□ 1.27
PLTP-201ENST00000354050 JPH4Q96JJ6 628 aa22.94■■□□□ 1.26
PLTP-201ENST00000354050 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PLTP-201ENST00000354050 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.92■■□□□ 1.26
PLTP-201ENST00000354050 SHROOM2Q13796 1616 aa22.9■■□□□ 1.26
PLTP-201ENST00000354050 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.9■■□□□ 1.26
PLTP-201ENST00000354050 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PLTP-201ENST00000354050 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.87■■□□□ 1.25
PLTP-201ENST00000354050 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PLTP-201ENST00000354050 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.84■■□□□ 1.25
PLTP-201ENST00000354050 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
PLTP-201ENST00000354050 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
PLTP-201ENST00000354050 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.83■■□□□ 1.24
PLTP-201ENST00000354050 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.82■■□□□ 1.24
PLTP-201ENST00000354050 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PLTP-201ENST00000354050 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.8■■□□□ 1.24
PLTP-201ENST00000354050 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PLTP-201ENST00000354050 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.78■■□□□ 1.24
PLTP-201ENST00000354050 ABCA8O94911 1581 aa22.77■■□□□ 1.24
PLTP-201ENST00000354050 NCOA2Q15596 1464 aa22.76■■□□□ 1.23
PLTP-201ENST00000354050 ARHGEF11O15085 1522 aa22.73■■□□□ 1.23
PLTP-201ENST00000354050 ARID3CA6NKF2 412 aa22.7■■□□□ 1.22
PLTP-201ENST00000354050 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PLTP-201ENST00000354050 PTPRGP23470 1445 aa22.69■■□□□ 1.22
PLTP-201ENST00000354050 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.69■■□□□ 1.22
PLTP-201ENST00000354050 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.68■■□□□ 1.22
PLTP-201ENST00000354050 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.68■■□□□ 1.22
PLTP-201ENST00000354050 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PLTP-201ENST00000354050 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.22
PLTP-201ENST00000354050 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
PLTP-201ENST00000354050 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
PLTP-201ENST00000354050 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
PLTP-201ENST00000354050 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.62■■□□□ 1.21
PLTP-201ENST00000354050 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
PLTP-201ENST00000354050 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.61■■□□□ 1.21
PLTP-201ENST00000354050 UACAQ9BZF9 1416 aa22.58■■□□□ 1.21
PLTP-201ENST00000354050 ITGAEP38570 1179 aa22.57■■□□□ 1.2
PLTP-201ENST00000354050 ATP10BO94823 1461 aa22.57■■□□□ 1.2
PLTP-201ENST00000354050 ABCC2Q92887 1545 aa22.56■■□□□ 1.2
PLTP-201ENST00000354050 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.54■■□□□ 1.2
PLTP-201ENST00000354050 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PLTP-201ENST00000354050 MIA2Q96PC5 1412 aa22.54■■□□□ 1.2
PLTP-201ENST00000354050 KIF14Q15058 1648 aa22.53■■□□□ 1.2
PLTP-201ENST00000354050 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.47■■□□□ 1.19
PLTP-201ENST00000354050 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.47■■□□□ 1.19
PLTP-201ENST00000354050 OSCARQ8IYS5 282 aa22.47■■□□□ 1.19
PLTP-201ENST00000354050 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.44■■□□□ 1.18
PLTP-201ENST00000354050 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
PLTP-201ENST00000354050 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.42■■□□□ 1.18
PLTP-201ENST00000354050 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.41■■□□□ 1.18
PLTP-201ENST00000354050 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PLTP-201ENST00000354050 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.4■■□□□ 1.18
PLTP-201ENST00000354050 PTPRKQ15262 1439 aa22.39■■□□□ 1.17
PLTP-201ENST00000354050 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.38■■□□□ 1.17
PLTP-201ENST00000354050 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PLTP-201ENST00000354050 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PLTP-201ENST00000354050 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.35■■□□□ 1.17
PLTP-201ENST00000354050 HFM1A2PYH4 1435 aa22.34■■□□□ 1.17
PLTP-201ENST00000354050 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.34■■□□□ 1.17
PLTP-201ENST00000354050 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PLTP-201ENST00000354050 PREX2Q70Z35 1606 aa22.33■■□□□ 1.16
PLTP-201ENST00000354050 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.31■■□□□ 1.16
PLTP-201ENST00000354050 DAPK1P53355 1430 aa22.31■■□□□ 1.16
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