RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317063.10

CHTF18-202, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CHTF18, Length 2,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-202ENST00000317063 ADAMTS12P58397 1594 aa25.57■■□□□ 1.68
CHTF18-202ENST00000317063 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
CHTF18-202ENST00000317063 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
CHTF18-202ENST00000317063 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.48■■□□□ 1.67
CHTF18-202ENST00000317063 ARAP1Q96P48 1450 aa25.48■■□□□ 1.67
CHTF18-202ENST00000317063 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.47■■□□□ 1.67
CHTF18-202ENST00000317063 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
CHTF18-202ENST00000317063 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.41■■□□□ 1.66
CHTF18-202ENST00000317063 GRIN2AQ12879 1464 aa25.41■■□□□ 1.66
CHTF18-202ENST00000317063 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.4■■□□□ 1.66
CHTF18-202ENST00000317063 SYNJ2O15056 1496 aa25.39■■□□□ 1.66
CHTF18-202ENST00000317063 HRCP23327 699 aa25.37■■□□□ 1.65
CHTF18-202ENST00000317063 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.35■■□□□ 1.65
CHTF18-202ENST00000317063 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
CHTF18-202ENST00000317063 CEP170Q5SW79 1584 aa25.28■■□□□ 1.64
CHTF18-202ENST00000317063 IQGAP2Q13576 1575 aa25.28■■□□□ 1.64
CHTF18-202ENST00000317063 APLP2Q06481 763 aa25.26■■□□□ 1.63
CHTF18-202ENST00000317063 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
CHTF18-202ENST00000317063 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.24■■□□□ 1.63
CHTF18-202ENST00000317063 CHD1O14646 1710 aa25.23■■□□□ 1.63
CHTF18-202ENST00000317063 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.19■■□□□ 1.62
CHTF18-202ENST00000317063 SAMD9Q5K651 1589 aa25.18■■□□□ 1.62
CHTF18-202ENST00000317063 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
CHTF18-202ENST00000317063 NUP160Q12769 1436 aa25.17■■□□□ 1.62
CHTF18-202ENST00000317063 JPH4Q96JJ6 628 aa25.17■■□□□ 1.62
CHTF18-202ENST00000317063 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.1■■□□□ 1.61
CHTF18-202ENST00000317063 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
CHTF18-202ENST00000317063 DISP1Q96F81 1524 aa25.09■■□□□ 1.61
CHTF18-202ENST00000317063 ARID3CA6NKF2 412 aa25.08■■□□□ 1.61
CHTF18-202ENST00000317063 FMN1Q68DA7 1419 aa25.05■■□□□ 1.6
CHTF18-202ENST00000317063 KIAA0556O60303 1618 aa25.02■■□□□ 1.6
CHTF18-202ENST00000317063 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25■■□□□ 1.59
CHTF18-202ENST00000317063 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
CHTF18-202ENST00000317063 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.95■■□□□ 1.59
CHTF18-202ENST00000317063 TIAM1Q13009 1591 aa24.94■■□□□ 1.58
CHTF18-202ENST00000317063 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.94■■□□□ 1.58
CHTF18-202ENST00000317063 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.93■■□□□ 1.58
CHTF18-202ENST00000317063 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.89■■□□□ 1.57
CHTF18-202ENST00000317063 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
CHTF18-202ENST00000317063 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.87■■□□□ 1.57
CHTF18-202ENST00000317063 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.86■■□□□ 1.57
CHTF18-202ENST00000317063 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
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CHTF18-202ENST00000317063 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.83■■□□□ 1.57
CHTF18-202ENST00000317063 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.83■■□□□ 1.57
CHTF18-202ENST00000317063 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CHTF18-202ENST00000317063 OSCARQ8IYS5 282 aa24.82■■□□□ 1.56
CHTF18-202ENST00000317063 MAP3K1Q13233 1512 aa24.82■■□□□ 1.56
CHTF18-202ENST00000317063 SHROOM2Q13796 1616 aa24.81■■□□□ 1.56
CHTF18-202ENST00000317063 PTPRGP23470 1445 aa24.79■■□□□ 1.56
CHTF18-202ENST00000317063 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
CHTF18-202ENST00000317063 HECW1Q76N89 1606 aa24.78■■□□□ 1.56
CHTF18-202ENST00000317063 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.78■■□□□ 1.56
CHTF18-202ENST00000317063 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.78■■□□□ 1.56
CHTF18-202ENST00000317063 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CHTF18-202ENST00000317063 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.74■■□□□ 1.55
CHTF18-202ENST00000317063 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.73■■□□□ 1.55
CHTF18-202ENST00000317063 ITGAEP38570 1179 aa24.69■■□□□ 1.54
CHTF18-202ENST00000317063 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.69■■□□□ 1.54
CHTF18-202ENST00000317063 ABCA8O94911 1581 aa24.65■■□□□ 1.54
CHTF18-202ENST00000317063 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
CHTF18-202ENST00000317063 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.6■■□□□ 1.53
CHTF18-202ENST00000317063 NCOA2Q15596 1464 aa24.6■■□□□ 1.53
CHTF18-202ENST00000317063 ATP10BO94823 1461 aa24.59■■□□□ 1.53
CHTF18-202ENST00000317063 UACAQ9BZF9 1416 aa24.59■■□□□ 1.53
CHTF18-202ENST00000317063 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
CHTF18-202ENST00000317063 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.58■■□□□ 1.52
CHTF18-202ENST00000317063 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
CHTF18-202ENST00000317063 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CHTF18-202ENST00000317063 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.53■■□□□ 1.52
CHTF18-202ENST00000317063 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.47■■□□□ 1.51
CHTF18-202ENST00000317063 ABCC2Q92887 1545 aa24.47■■□□□ 1.51
CHTF18-202ENST00000317063 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
CHTF18-202ENST00000317063 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
CHTF18-202ENST00000317063 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.46■■□□□ 1.51
CHTF18-202ENST00000317063 KIF14Q15058 1648 aa24.45■■□□□ 1.5
CHTF18-202ENST00000317063 ARHGEF11O15085 1522 aa24.44■■□□□ 1.5
CHTF18-202ENST00000317063 KCNH8Q96L42 1107 aa24.44■■□□□ 1.5
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
CHTF18-202ENST00000317063 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.38■■□□□ 1.49
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
CHTF18-202ENST00000317063 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
CHTF18-202ENST00000317063 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
CHTF18-202ENST00000317063 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.35■■□□□ 1.49
CHTF18-202ENST00000317063 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.35■■□□□ 1.49
CHTF18-202ENST00000317063 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.34■■□□□ 1.49
CHTF18-202ENST00000317063 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
CHTF18-202ENST00000317063 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.32■■□□□ 1.48
CHTF18-202ENST00000317063 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.31■■□□□ 1.48
CHTF18-202ENST00000317063 PTPRKQ15262 1439 aa24.3■■□□□ 1.48
CHTF18-202ENST00000317063 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CHTF18-202ENST00000317063 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.26■■□□□ 1.47
CHTF18-202ENST00000317063 MIA2Q96PC5 1412 aa24.25■■□□□ 1.47
CHTF18-202ENST00000317063 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.25■■□□□ 1.471e-7■■■■□ 25.3
CHTF18-202ENST00000317063 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.24■■□□□ 1.47
CHTF18-202ENST00000317063 BCL11AQ9H165 835 aa24.24■■□□□ 1.47
CHTF18-202ENST00000317063 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.23■■□□□ 1.47
CHTF18-202ENST00000317063 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.23■■□□□ 1.47
CHTF18-202ENST00000317063 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.23■■□□□ 1.47
CHTF18-202ENST00000317063 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.23■■□□□ 1.47
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