RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000314583.7

HCLS1-201, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCLS1, Length 2,000 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-201ENST00000314583 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
HCLS1-201ENST00000314583 GRIN2BQ13224 1484 aa28.34■■■□□ 2.13
HCLS1-201ENST00000314583 ADAMTS12P58397 1594 aa28.34■■■□□ 2.13
HCLS1-201ENST00000314583 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
HCLS1-201ENST00000314583 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.3■■■□□ 2.12
HCLS1-201ENST00000314583 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
HCLS1-201ENST00000314583 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.27■■■□□ 2.12
HCLS1-201ENST00000314583 SAMD9Q5K651 1589 aa28.15■■■□□ 2.1
HCLS1-201ENST00000314583 MAP3K1Q13233 1512 aa28.14■■■□□ 2.09
HCLS1-201ENST00000314583 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.13■■■□□ 2.09
HCLS1-201ENST00000314583 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.08■■■□□ 2.09
HCLS1-201ENST00000314583 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
HCLS1-201ENST00000314583 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
HCLS1-201ENST00000314583 TIAM1Q13009 1591 aa28.04■■■□□ 2.08
HCLS1-201ENST00000314583 IQGAP2Q13576 1575 aa28.04■■■□□ 2.08
HCLS1-201ENST00000314583 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
HCLS1-201ENST00000314583 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
HCLS1-201ENST00000314583 GRIN2AQ12879 1464 aa28.01■■■□□ 2.07
HCLS1-201ENST00000314583 P3H3Q8IVL6 736 aa28.01■■■□□ 2.07
HCLS1-201ENST00000314583 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28■■■□□ 2.07
HCLS1-201ENST00000314583 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
HCLS1-201ENST00000314583 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.99■■■□□ 2.07
HCLS1-201ENST00000314583 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.97■■■□□ 2.07
HCLS1-201ENST00000314583 FMN1Q68DA7 1419 aa27.96■■■□□ 2.07
HCLS1-201ENST00000314583 SYNJ2O15056 1496 aa27.96■■■□□ 2.07
HCLS1-201ENST00000314583 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.94■■■□□ 2.06
HCLS1-201ENST00000314583 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
HCLS1-201ENST00000314583 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.93■■■□□ 2.06
HCLS1-201ENST00000314583 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.87■■■□□ 2.05
HCLS1-201ENST00000314583 CEP170Q5SW79 1584 aa27.86■■■□□ 2.05
HCLS1-201ENST00000314583 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
HCLS1-201ENST00000314583 NUP160Q12769 1436 aa27.81■■■□□ 2.04
HCLS1-201ENST00000314583 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.79■■■□□ 2.04
HCLS1-201ENST00000314583 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
HCLS1-201ENST00000314583 KIAA0556O60303 1618 aa27.78■■■□□ 2.04
HCLS1-201ENST00000314583 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.77■■■□□ 2.04
HCLS1-201ENST00000314583 DISP1Q96F81 1524 aa27.77■■■□□ 2.04
HCLS1-201ENST00000314583 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
HCLS1-201ENST00000314583 HECW1Q76N89 1606 aa27.68■■■□□ 2.02
HCLS1-201ENST00000314583 FBLN2P98095 1184 aa27.65■■■□□ 2.02
HCLS1-201ENST00000314583 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.64■■■□□ 2.02
HCLS1-201ENST00000314583 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.62■■■□□ 2.01
HCLS1-201ENST00000314583 CHD1O14646 1710 aa27.62■■■□□ 2.01
HCLS1-201ENST00000314583 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.57■■■□□ 2
HCLS1-201ENST00000314583 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
HCLS1-201ENST00000314583 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.54■■■□□ 2
HCLS1-201ENST00000314583 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.53■■■□□ 2
HCLS1-201ENST00000314583 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.53■■■□□ 2
HCLS1-201ENST00000314583 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.53■■■□□ 2
HCLS1-201ENST00000314583 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.53■■■□□ 2
HCLS1-201ENST00000314583 JPH4Q96JJ6 628 aa27.53■■■□□ 2
HCLS1-201ENST00000314583 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.52■■■□□ 2
HCLS1-201ENST00000314583 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
HCLS1-201ENST00000314583 ARHGEF11O15085 1522 aa27.48■■□□□ 1.99
HCLS1-201ENST00000314583 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
HCLS1-201ENST00000314583 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
HCLS1-201ENST00000314583 NCOA2Q15596 1464 aa27.46■■□□□ 1.99
HCLS1-201ENST00000314583 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.99
HCLS1-201ENST00000314583 SHROOM2Q13796 1616 aa27.43■■□□□ 1.98
HCLS1-201ENST00000314583 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.41■■□□□ 1.98
HCLS1-201ENST00000314583 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.38■■□□□ 1.97
HCLS1-201ENST00000314583 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.37■■□□□ 1.97
HCLS1-201ENST00000314583 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
HCLS1-201ENST00000314583 ABCA8O94911 1581 aa27.37■■□□□ 1.97
HCLS1-201ENST00000314583 ITGAEP38570 1179 aa27.36■■□□□ 1.97
HCLS1-201ENST00000314583 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
HCLS1-201ENST00000314583 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.35■■□□□ 1.97
HCLS1-201ENST00000314583 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.32■■□□□ 1.96
HCLS1-201ENST00000314583 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.32■■□□□ 1.96
HCLS1-201ENST00000314583 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.26■■□□□ 1.96
HCLS1-201ENST00000314583 ARID3CA6NKF2 412 aa27.25■■□□□ 1.95
HCLS1-201ENST00000314583 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
HCLS1-201ENST00000314583 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.21■■□□□ 1.95
HCLS1-201ENST00000314583 PTPRGP23470 1445 aa27.21■■□□□ 1.95
HCLS1-201ENST00000314583 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
HCLS1-201ENST00000314583 MIA2Q96PC5 1412 aa27.2■■□□□ 1.94
HCLS1-201ENST00000314583 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
HCLS1-201ENST00000314583 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.18■■□□□ 1.94
HCLS1-201ENST00000314583 ATP10BO94823 1461 aa27.16■■□□□ 1.94
HCLS1-201ENST00000314583 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
HCLS1-201ENST00000314583 MAPKBP1O60336 1514 aa27.14■■□□□ 1.93
HCLS1-201ENST00000314583 PTPRKQ15262 1439 aa27.13■■□□□ 1.93
HCLS1-201ENST00000314583 HFM1A2PYH4 1435 aa27.11■■□□□ 1.93
HCLS1-201ENST00000314583 KIF14Q15058 1648 aa27.1■■□□□ 1.93
HCLS1-201ENST00000314583 UACAQ9BZF9 1416 aa27.09■■□□□ 1.93
HCLS1-201ENST00000314583 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.06■■□□□ 1.92
HCLS1-201ENST00000314583 ABCC2Q92887 1545 aa27.04■■□□□ 1.92
HCLS1-201ENST00000314583 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
HCLS1-201ENST00000314583 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.04■■□□□ 1.92
HCLS1-201ENST00000314583 AKNAQ7Z591 1439 aa27.03■■□□□ 1.92
HCLS1-201ENST00000314583 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27■■□□□ 1.91
HCLS1-201ENST00000314583 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
HCLS1-201ENST00000314583 NAIPQ13075 1403 aa27■■□□□ 1.91
HCLS1-201ENST00000314583 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.98■■□□□ 1.91
HCLS1-201ENST00000314583 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
HCLS1-201ENST00000314583 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.96■■□□□ 1.91
HCLS1-201ENST00000314583 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.95■■□□□ 1.9
HCLS1-201ENST00000314583 DAPK1P53355 1430 aa26.92■■□□□ 1.9
HCLS1-201ENST00000314583 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.91■■□□□ 1.9
HCLS1-201ENST00000314583 ABCC5O15440 1437 aa26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms