RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000314583.7

HCLS1-201, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCLS1, Length 2,000 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-201ENST00000314583 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.95■■■■■ 4.15
HCLS1-201ENST00000314583 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.63■■■■□ 3.29
HCLS1-201ENST00000314583 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.48■■■■□ 3.11
HCLS1-201ENST00000314583 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.9■■■■□ 3.02
HCLS1-201ENST00000314583 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.55■■■□□ 2.96
HCLS1-201ENST00000314583 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.5■■■□□ 2.95
HCLS1-201ENST00000314583 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.39■■■□□ 2.94
HCLS1-201ENST00000314583 ABCC9O60706 1549 aa33.37■■■□□ 2.93
HCLS1-201ENST00000314583 NACADO15069 1562 aa33.08■■■□□ 2.89
HCLS1-201ENST00000314583 SCRIBQ14160 1630 aa32.76■■■□□ 2.83
HCLS1-201ENST00000314583 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.72■■■□□ 2.83
HCLS1-201ENST00000314583 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.42■■■□□ 2.78
HCLS1-201ENST00000314583 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.15■■■□□ 2.74
HCLS1-201ENST00000314583 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.86■■■□□ 2.69
HCLS1-201ENST00000314583 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.8■■■□□ 2.68
HCLS1-201ENST00000314583 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.8■■■□□ 2.68
HCLS1-201ENST00000314583 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.66■■■□□ 2.66
HCLS1-201ENST00000314583 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.59■■■□□ 2.65
HCLS1-201ENST00000314583 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.49■■■□□ 2.63
HCLS1-201ENST00000314583 SMARCA4P51532 1647 aa31.44■■■□□ 2.62
HCLS1-201ENST00000314583 WIZO95785 1651 aa31.42■■■□□ 2.62
HCLS1-201ENST00000314583 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.36■■■□□ 2.61
HCLS1-201ENST00000314583 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
HCLS1-201ENST00000314583 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.07■■■□□ 2.56
HCLS1-201ENST00000314583 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.84■■■□□ 2.53
HCLS1-201ENST00000314583 SMARCA2P51531 1590 aa30.83■■■□□ 2.53
HCLS1-201ENST00000314583 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.77■■■□□ 2.52
HCLS1-201ENST00000314583 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
HCLS1-201ENST00000314583 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
HCLS1-201ENST00000314583 HMGXB3Q12766 1538 aa30.53■■■□□ 2.48
HCLS1-201ENST00000314583 NCAPD3P42695 1498 aa30.53■■■□□ 2.48
HCLS1-201ENST00000314583 TRIM41Q8WV44 630 aa30.48■■■□□ 2.47
HCLS1-201ENST00000314583 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.25■■■□□ 2.43
HCLS1-201ENST00000314583 ABCC8Q09428 1581 aa30.2■■■□□ 2.43
HCLS1-201ENST00000314583 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.13■■■□□ 2.41
HCLS1-201ENST00000314583 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.95■■■□□ 2.39
HCLS1-201ENST00000314583 CFTRP13569 1480 aa29.92■■■□□ 2.38
HCLS1-201ENST00000314583 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
HCLS1-201ENST00000314583 SYNJ1O43426 1573 aa29.88■■■□□ 2.37
HCLS1-201ENST00000314583 PRDM2Q13029 1718 aa29.84■■■□□ 2.37
HCLS1-201ENST00000314583 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.73■■■□□ 2.35
HCLS1-201ENST00000314583 EEA1Q15075 1411 aa29.73■■■□□ 2.35
HCLS1-201ENST00000314583 TOP2BQ02880 1626 aa29.73■■■□□ 2.35
HCLS1-201ENST00000314583 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.73■■■□□ 2.35
HCLS1-201ENST00000314583 SOGA1O94964 1423 aa29.68■■■□□ 2.34
HCLS1-201ENST00000314583 CUX1P39880 1505 aa29.59■■■□□ 2.33
HCLS1-201ENST00000314583 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.57■■■□□ 2.32
HCLS1-201ENST00000314583 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.45■■■□□ 2.31
HCLS1-201ENST00000314583 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.44■■■□□ 2.3
HCLS1-201ENST00000314583 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.42■■■□□ 2.3
HCLS1-201ENST00000314583 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.42■■■□□ 2.3
HCLS1-201ENST00000314583 NESP48681 1621 aa29.41■■■□□ 2.3
HCLS1-201ENST00000314583 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.38■■■□□ 2.29
HCLS1-201ENST00000314583 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.38■■■□□ 2.29
HCLS1-201ENST00000314583 KIF21BO75037 1637 aa29.33■■■□□ 2.29
HCLS1-201ENST00000314583 GOLGA3Q08378 1498 aa29.33■■■□□ 2.29
HCLS1-201ENST00000314583 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.32■■■□□ 2.28
HCLS1-201ENST00000314583 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
HCLS1-201ENST00000314583 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.27■■■□□ 2.28
HCLS1-201ENST00000314583 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.24■■■□□ 2.27
HCLS1-201ENST00000314583 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.2■■■□□ 2.26
HCLS1-201ENST00000314583 CEP162Q5TB80 1403 aa29.2■■■□□ 2.26
HCLS1-201ENST00000314583 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.16■■■□□ 2.26
HCLS1-201ENST00000314583 KIF27Q86VH2 1401 aa29.15■■■□□ 2.26
HCLS1-201ENST00000314583 TOPBP1Q92547 1522 aa29.15■■■□□ 2.26
HCLS1-201ENST00000314583 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.09■■■□□ 2.25
HCLS1-201ENST00000314583 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
HCLS1-201ENST00000314583 PRXQ9BXM0 1461 aa29.09■■■□□ 2.25
HCLS1-201ENST00000314583 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
HCLS1-201ENST00000314583 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.07■■■□□ 2.24
HCLS1-201ENST00000314583 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.06■■■□□ 2.24
HCLS1-201ENST00000314583 HRCP23327 699 aa29.05■■■□□ 2.24
HCLS1-201ENST00000314583 CUX2O14529 1486 aa29.04■■■□□ 2.24
HCLS1-201ENST00000314583 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
HCLS1-201ENST00000314583 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.96■■■□□ 2.23
HCLS1-201ENST00000314583 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.92■■■□□ 2.22
HCLS1-201ENST00000314583 WDR97A6NE52 1622 aa28.91■■■□□ 2.22
HCLS1-201ENST00000314583 IGF1RP08069 1367 aa28.89■■■□□ 2.22
HCLS1-201ENST00000314583 CLIP1P30622 1438 aa28.84■■■□□ 2.21
HCLS1-201ENST00000314583 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.81■■■□□ 2.2
HCLS1-201ENST00000314583 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.74■■■□□ 2.19
HCLS1-201ENST00000314583 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
HCLS1-201ENST00000314583 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.73■■■□□ 2.19
HCLS1-201ENST00000314583 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.69■■■□□ 2.18
HCLS1-201ENST00000314583 CUL7Q14999 1698 aa28.68■■■□□ 2.18
HCLS1-201ENST00000314583 WDR62O43379 1518 aa28.68■■■□□ 2.18
HCLS1-201ENST00000314583 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
HCLS1-201ENST00000314583 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.6■■■□□ 2.17
HCLS1-201ENST00000314583 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
HCLS1-201ENST00000314583 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
HCLS1-201ENST00000314583 ERCC6Q03468 1493 aa28.55■■■□□ 2.16
HCLS1-201ENST00000314583 ARAP1Q96P48 1450 aa28.54■■■□□ 2.16
HCLS1-201ENST00000314583 IFT140Q96RY7 1462 aa28.5■■■□□ 2.15
HCLS1-201ENST00000314583 PBRM1Q86U86 1689 aa28.48■■■□□ 2.15
HCLS1-201ENST00000314583 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
HCLS1-201ENST00000314583 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.47■■■□□ 2.15
HCLS1-201ENST00000314583 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
HCLS1-201ENST00000314583 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.42■■■□□ 2.14
HCLS1-201ENST00000314583 APLP2Q06481 763 aa28.4■■■□□ 2.14
HCLS1-201ENST00000314583 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.37■■■□□ 2.13
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