RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.42■■■■■ 4.22
HOXD8-201ENST00000313173 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.39■■■■■ 4.22
HOXD8-201ENST00000313173 GRIN2BQ13224 1484 aa41.38■■■■■ 4.21
HOXD8-201ENST00000313173 ADAMTS12P58397 1594 aa41.32■■■■■ 4.21
HOXD8-201ENST00000313173 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.32■■■■■ 4.2
HOXD8-201ENST00000313173 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.31■■■■■ 4.2
HOXD8-201ENST00000313173 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.16■■■■■ 4.18
HOXD8-201ENST00000313173 SAMD9Q5K651 1589 aa41.09■■■■■ 4.17
HOXD8-201ENST00000313173 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.07■■■■■ 4.17
HOXD8-201ENST00000313173 MAP3K1Q13233 1512 aa41.07■■■■■ 4.16
HOXD8-201ENST00000313173 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.05■■■■■ 4.16
HOXD8-201ENST00000313173 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
HOXD8-201ENST00000313173 P3H3Q8IVL6 736 aa41.01■■■■■ 4.16
HOXD8-201ENST00000313173 TIAM1Q13009 1591 aa41■■■■■ 4.15
HOXD8-201ENST00000313173 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP40.99■■■■■ 4.15
HOXD8-201ENST00000313173 IQGAP2Q13576 1575 aa40.95■■■■■ 4.15
HOXD8-201ENST00000313173 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.94■■■■■ 4.14
HOXD8-201ENST00000313173 FMN1Q68DA7 1419 aa40.92■■■■■ 4.14
HOXD8-201ENST00000313173 SYNJ2O15056 1496 aa40.91■■■■■ 4.14
HOXD8-201ENST00000313173 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.91■■■■■ 4.14
HOXD8-201ENST00000313173 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.9■■■■■ 4.14
HOXD8-201ENST00000313173 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.89■■■■■ 4.14
HOXD8-201ENST00000313173 GRIN2AQ12879 1464 aa40.88■■■■■ 4.13
HOXD8-201ENST00000313173 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP40.86■■■■■ 4.13
HOXD8-201ENST00000313173 FBLN2P98095 1184 aa40.84■■■■■ 4.13
HOXD8-201ENST00000313173 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa40.78■■■■■ 4.12
HOXD8-201ENST00000313173 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.77■■■■■ 4.12
HOXD8-201ENST00000313173 UGGT2Q9NYU1 1516 aa40.76■■■■■ 4.12
HOXD8-201ENST00000313173 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP40.71■■■■■ 4.11
HOXD8-201ENST00000313173 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
HOXD8-201ENST00000313173 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.63■■■■■ 4.1
HOXD8-201ENST00000313173 CEP170Q5SW79 1584 aa40.63■■■■■ 4.09
HOXD8-201ENST00000313173 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.6■■■■■ 4.09
HOXD8-201ENST00000313173 NUP160Q12769 1436 aa40.59■■■■■ 4.09
HOXD8-201ENST00000313173 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.56■■■■■ 4.08
HOXD8-201ENST00000313173 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP40.55■■■■■ 4.08
HOXD8-201ENST00000313173 CHD1O14646 1710 aa40.55■■■■■ 4.08
HOXD8-201ENST00000313173 KIAA0556O60303 1618 aa40.54■■■■■ 4.08
HOXD8-201ENST00000313173 CCNB3Q8WWL7 1395 aa40.53■■■■■ 4.08
HOXD8-201ENST00000313173 DISP1Q96F81 1524 aa40.51■■■■■ 4.08
HOXD8-201ENST00000313173 HECW1Q76N89 1606 aa40.47■■■■■ 4.07
HOXD8-201ENST00000313173 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.43■■■■■ 4.06
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.43■■■■■ 4.06
HOXD8-201ENST00000313173 MTUS2Q5JR59 1369 aa40.34■■■■■ 4.05
HOXD8-201ENST00000313173 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa40.32■■■■■ 4.05
HOXD8-201ENST00000313173 JPH4Q96JJ6 628 aa40.32■■■■■ 4.05
HOXD8-201ENST00000313173 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.29■■■■■ 4.04
HOXD8-201ENST00000313173 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
HOXD8-201ENST00000313173 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.23■■■■■ 4.03
HOXD8-201ENST00000313173 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.21■■■■■ 4.03
HOXD8-201ENST00000313173 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.2■■■■■ 4.03
HOXD8-201ENST00000313173 NCOA2Q15596 1464 aa40.17■■■■■ 4.02
HOXD8-201ENST00000313173 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.16■■■■■ 4.02
HOXD8-201ENST00000313173 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.15■■■■■ 4.02
HOXD8-201ENST00000313173 ARHGEF11O15085 1522 aa40.13■■■■■ 4.01
HOXD8-201ENST00000313173 FGD6Q6ZV73 1430 aa40.12■■■■■ 4.01
HOXD8-201ENST00000313173 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.12■■■■■ 4.01
HOXD8-201ENST00000313173 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.09■■■■■ 4.01
HOXD8-201ENST00000313173 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.07■■■■■ 4.01
HOXD8-201ENST00000313173 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP40.06■■■■■ 4
HOXD8-201ENST00000313173 MYOM3Q5VTT5 1437 aa40.06■■■■■ 4
HOXD8-201ENST00000313173 SHROOM2Q13796 1616 aa40.05■■■■■ 4
HOXD8-201ENST00000313173 ITGAEP38570 1179 aa40.04■■■■■ 4
HOXD8-201ENST00000313173 PLB1Q6P1J6 1458 aa39.98■■■■□ 3.99
HOXD8-201ENST00000313173 ARID3CA6NKF2 412 aa39.93■■■■□ 3.98
HOXD8-201ENST00000313173 OSCARQ8IYS5 282 aa39.92■■■■□ 3.98
HOXD8-201ENST00000313173 ABCA8O94911 1581 aa39.91■■■■□ 3.98
HOXD8-201ENST00000313173 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP39.9■■■■□ 3.98
HOXD8-201ENST00000313173 PTPN23Q9H3S7 1636 aa39.88■■■■□ 3.97
HOXD8-201ENST00000313173 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.86■■■■□ 3.97
HOXD8-201ENST00000313173 SETD5Q9C0A6 1442 aa39.85■■■■□ 3.97
HOXD8-201ENST00000313173 CLSPNQ9HAW4 1339 aa39.85■■■■□ 3.97
HOXD8-201ENST00000313173 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa39.83■■■■□ 3.97
HOXD8-201ENST00000313173 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.83■■■■□ 3.97
HOXD8-201ENST00000313173 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP39.82■■■■□ 3.96
HOXD8-201ENST00000313173 PTPRGP23470 1445 aa39.79■■■■□ 3.96
HOXD8-201ENST00000313173 MIA2Q96PC5 1412 aa39.78■■■■□ 3.96
HOXD8-201ENST00000313173 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.76■■■■□ 3.96
HOXD8-201ENST00000313173 ADCY10Q96PN6 1610 aa39.71■■■■□ 3.95
HOXD8-201ENST00000313173 PTPRKQ15262 1439 aa39.68■■■■□ 3.94
HOXD8-201ENST00000313173 ATP10BO94823 1461 aa39.65■■■■□ 3.94
HOXD8-201ENST00000313173 HFM1A2PYH4 1435 aa39.6■■■■□ 3.93
HOXD8-201ENST00000313173 KIF14Q15058 1648 aa39.58■■■■□ 3.93
HOXD8-201ENST00000313173 ITSN2Q9NZM3 1697 aa39.57■■■■□ 3.92
HOXD8-201ENST00000313173 UACAQ9BZF9 1416 aa39.55■■■■□ 3.92
HOXD8-201ENST00000313173 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.49■■■■□ 3.91
HOXD8-201ENST00000313173 MAPKBP1O60336 1514 aa39.49■■■■□ 3.91
HOXD8-201ENST00000313173 NAIPQ13075 1403 aa39.47■■■■□ 3.91
HOXD8-201ENST00000313173 AKNAQ7Z591 1439 aa39.46■■■■□ 3.91
HOXD8-201ENST00000313173 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP39.46■■■■□ 3.91
HOXD8-201ENST00000313173 ABCC2Q92887 1545 aa39.44■■■■□ 3.9
HOXD8-201ENST00000313173 GCC2Q8IWJ2 1684 aa39.43■■■■□ 3.9
HOXD8-201ENST00000313173 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP39.43■■■■□ 3.9
HOXD8-201ENST00000313173 ABCC10Q5T3U5 1492 aa39.41■■■■□ 3.9
HOXD8-201ENST00000313173 DAPK1P53355 1430 aa39.37■■■■□ 3.89
HOXD8-201ENST00000313173 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa39.36■■■■□ 3.89
HOXD8-201ENST00000313173 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa39.35■■■■□ 3.89
HOXD8-201ENST00000313173 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP39.34■■■■□ 3.89
HOXD8-201ENST00000313173 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa39.32■■■■□ 3.89
HOXD8-201ENST00000313173 ABCC5O15440 1437 aa39.32■■■■□ 3.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms