RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312492.2

HOXC5-201, Transcript of homeobox C5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC5, Length 1,805 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5-201ENST00000312492 ADAMTS12P58397 1594 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXC5-201ENST00000312492 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXC5-201ENST00000312492 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.38■■□□□ 1.81
HOXC5-201ENST00000312492 APLP2Q06481 763 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXC5-201ENST00000312492 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXC5-201ENST00000312492 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
HOXC5-201ENST00000312492 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
HOXC5-201ENST00000312492 SAMD9Q5K651 1589 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXC5-201ENST00000312492 IQGAP2Q13576 1575 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXC5-201ENST00000312492 GRIN2AQ12879 1464 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXC5-201ENST00000312492 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXC5-201ENST00000312492 P3H3Q8IVL6 736 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXC5-201ENST00000312492 SYNJ2O15056 1496 aa26.19■■□□□ 1.78
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HOXC5-201ENST00000312492 MAP3K1Q13233 1512 aa26.12■■□□□ 1.77
HOXC5-201ENST00000312492 FMN1Q68DA7 1419 aa26.12■■□□□ 1.77
HOXC5-201ENST00000312492 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXC5-201ENST00000312492 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
HOXC5-201ENST00000312492 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.1■■□□□ 1.77
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HOXC5-201ENST00000312492 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXC5-201ENST00000312492 CEP170Q5SW79 1584 aa26.06■■□□□ 1.76
HOXC5-201ENST00000312492 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
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HOXC5-201ENST00000312492 FBLN2P98095 1184 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXC5-201ENST00000312492 NUP160Q12769 1436 aa25.99■■□□□ 1.75
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HOXC5-201ENST00000312492 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXC5-201ENST00000312492 CHD1O14646 1710 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXC5-201ENST00000312492 DISP1Q96F81 1524 aa25.92■■□□□ 1.74
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HOXC5-201ENST00000312492 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.82■■□□□ 1.72
HOXC5-201ENST00000312492 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXC5-201ENST00000312492 JPH4Q96JJ6 628 aa25.78■■□□□ 1.72
HOXC5-201ENST00000312492 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.74■■□□□ 1.71
HOXC5-201ENST00000312492 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.73■■□□□ 1.71
HOXC5-201ENST00000312492 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.73■■□□□ 1.71
HOXC5-201ENST00000312492 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
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HOXC5-201ENST00000312492 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.72■■□□□ 1.71
HOXC5-201ENST00000312492 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.69■■□□□ 1.7
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HOXC5-201ENST00000312492 SHROOM2Q13796 1616 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXC5-201ENST00000312492 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
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HOXC5-201ENST00000312492 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
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HOXC5-201ENST00000312492 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.53■■□□□ 1.68
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HOXC5-201ENST00000312492 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXC5-201ENST00000312492 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXC5-201ENST00000312492 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
HOXC5-201ENST00000312492 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXC5-201ENST00000312492 ATP10BO94823 1461 aa25.36■■□□□ 1.65
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HOXC5-201ENST00000312492 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
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HOXC5-201ENST00000312492 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.28■■□□□ 1.64
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HOXC5-201ENST00000312492 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXC5-201ENST00000312492 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.16■■□□□ 1.62
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HOXC5-201ENST00000312492 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
HOXC5-201ENST00000312492 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
HOXC5-201ENST00000312492 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
HOXC5-201ENST00000312492 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXC5-201ENST00000312492 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXC5-201ENST00000312492 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXC5-201ENST00000312492 DAPK1P53355 1430 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXC5-201ENST00000312492 AKNAQ7Z591 1439 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXC5-201ENST00000312492 NAIPQ13075 1403 aa25.08■■□□□ 1.61
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