RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299259.10

COPS2-201, Transcript of COP9 signalosome subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene COPS2, Length 2,036 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2-201ENST00000299259 PCGF6Q9BYE7 350 aa16.46■□□□□ 0.23
COPS2-201ENST00000299259 EFCAB5A4FU69 1503 aa16.43■□□□□ 0.22
COPS2-201ENST00000299259 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.42■□□□□ 0.22
COPS2-201ENST00000299259 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
COPS2-201ENST00000299259 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
COPS2-201ENST00000299259 SAMD9Q5K651 1589 aa16.37■□□□□ 0.21
COPS2-201ENST00000299259 IQGAP2Q13576 1575 aa16.36■□□□□ 0.21
COPS2-201ENST00000299259 GRIN2AQ12879 1464 aa16.34■□□□□ 0.21
COPS2-201ENST00000299259 SYNJ2O15056 1496 aa16.32■□□□□ 0.2
COPS2-201ENST00000299259 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
COPS2-201ENST00000299259 APLP2Q06481 763 aa16.3■□□□□ 0.2
COPS2-201ENST00000299259 FHOD3Q2V2M9 1422 aa16.3■□□□□ 0.2
COPS2-201ENST00000299259 CFAP43Q8NDM7 1665 aa16.28■□□□□ 0.2
COPS2-201ENST00000299259 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
COPS2-201ENST00000299259 CEP170Q5SW79 1584 aa16.25■□□□□ 0.19
COPS2-201ENST00000299259 TIAM1Q13009 1591 aa16.25■□□□□ 0.19
COPS2-201ENST00000299259 FYCO1Q9BQS8 1478 aa16.25■□□□□ 0.19
COPS2-201ENST00000299259 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa16.25■□□□□ 0.19
COPS2-201ENST00000299259 UGGT2Q9NYU1 1516 aa16.25■□□□□ 0.19
COPS2-201ENST00000299259 MAP3K1Q13233 1512 aa16.24■□□□□ 0.19
COPS2-201ENST00000299259 FMN1Q68DA7 1419 aa16.23■□□□□ 0.19
COPS2-201ENST00000299259 CHD1O14646 1710 aa16.22■□□□□ 0.19
COPS2-201ENST00000299259 P3H3Q8IVL6 736 aa16.22■□□□□ 0.19
COPS2-201ENST00000299259 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa16.2■□□□□ 0.18
COPS2-201ENST00000299259 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
COPS2-201ENST00000299259 NUP160Q12769 1436 aa16.2■□□□□ 0.18
COPS2-201ENST00000299259 KIAA0556O60303 1618 aa16.19■□□□□ 0.18
COPS2-201ENST00000299259 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa16.18■□□□□ 0.18
COPS2-201ENST00000299259 FBLN2P98095 1184 aa16.14■□□□□ 0.17
COPS2-201ENST00000299259 DISP1Q96F81 1524 aa16.14■□□□□ 0.17
COPS2-201ENST00000299259 HECW1Q76N89 1606 aa16.13■□□□□ 0.17
COPS2-201ENST00000299259 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa16.13■□□□□ 0.17
COPS2-201ENST00000299259 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
COPS2-201ENST00000299259 CCDC18Q5T9S5 1454 aa16.07■□□□□ 0.16
COPS2-201ENST00000299259 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
COPS2-201ENST00000299259 HRCP23327 699 aa16.06■□□□□ 0.16
COPS2-201ENST00000299259 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa16.05■□□□□ 0.16
COPS2-201ENST00000299259 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa16.04■□□□□ 0.16
COPS2-201ENST00000299259 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
COPS2-201ENST00000299259 SHROOM2Q13796 1616 aa16.03■□□□□ 0.16
COPS2-201ENST00000299259 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa16.02■□□□□ 0.16
COPS2-201ENST00000299259 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
COPS2-201ENST00000299259 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
COPS2-201ENST00000299259 JPH4Q96JJ6 628 aa15.99■□□□□ 0.15
COPS2-201ENST00000299259 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
COPS2-201ENST00000299259 MTUS2Q5JR59 1369 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS2-201ENST00000299259 CCNB3Q8WWL7 1395 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS2-201ENST00000299259 CLASP1Q7Z460 1538 aa15.97■□□□□ 0.15
COPS2-201ENST00000299259 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
COPS2-201ENST00000299259 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa15.96■□□□□ 0.15
COPS2-201ENST00000299259 PHLDB1Q86UU1 1377 aa15.95■□□□□ 0.14
COPS2-201ENST00000299259 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
COPS2-201ENST00000299259 ABCA8O94911 1581 aa15.93■□□□□ 0.14
COPS2-201ENST00000299259 PLB1Q6P1J6 1458 aa15.92■□□□□ 0.14
COPS2-201ENST00000299259 NCOA2Q15596 1464 aa15.91■□□□□ 0.14
COPS2-201ENST00000299259 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
COPS2-201ENST00000299259 ARHGEF11O15085 1522 aa15.9■□□□□ 0.14
COPS2-201ENST00000299259 FGD6Q6ZV73 1430 aa15.86■□□□□ 0.13
COPS2-201ENST00000299259 ERCC6L2Q5T890 1561 aa15.86■□□□□ 0.13
COPS2-201ENST00000299259 MYOM3Q5VTT5 1437 aa15.86■□□□□ 0.13
COPS2-201ENST00000299259 ADCY10Q96PN6 1610 aa15.85■□□□□ 0.13
COPS2-201ENST00000299259 ARID3CA6NKF2 412 aa15.84■□□□□ 0.13
COPS2-201ENST00000299259 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
COPS2-201ENST00000299259 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
COPS2-201ENST00000299259 PTPRGP23470 1445 aa15.84■□□□□ 0.13
COPS2-201ENST00000299259 PTPN23Q9H3S7 1636 aa15.83■□□□□ 0.12
COPS2-201ENST00000299259 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP15.83■□□□□ 0.12
COPS2-201ENST00000299259 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
COPS2-201ENST00000299259 ITSN2Q9NZM3 1697 aa15.8■□□□□ 0.12
COPS2-201ENST00000299259 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
COPS2-201ENST00000299259 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
COPS2-201ENST00000299259 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
COPS2-201ENST00000299259 KIF14Q15058 1648 aa15.78■□□□□ 0.12
COPS2-201ENST00000299259 ABCC2Q92887 1545 aa15.77■□□□□ 0.12
COPS2-201ENST00000299259 UACAQ9BZF9 1416 aa15.77■□□□□ 0.11
COPS2-201ENST00000299259 ATP10BO94823 1461 aa15.76■□□□□ 0.11
COPS2-201ENST00000299259 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
COPS2-201ENST00000299259 ITGAEP38570 1179 aa15.75■□□□□ 0.11
COPS2-201ENST00000299259 MIA2Q96PC5 1412 aa15.75■□□□□ 0.11
COPS2-201ENST00000299259 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa15.72■□□□□ 0.11
COPS2-201ENST00000299259 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
COPS2-201ENST00000299259 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa15.7■□□□□ 0.1
COPS2-201ENST00000299259 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
COPS2-201ENST00000299259 SETD5Q9C0A6 1442 aa15.67■□□□□ 0.1
COPS2-201ENST00000299259 GCC2Q8IWJ2 1684 aa15.67■□□□□ 0.1
COPS2-201ENST00000299259 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa15.67■□□□□ 0.1
COPS2-201ENST00000299259 PLEKHD1A6NEE1 506 aa15.67■□□□□ 0.1
COPS2-201ENST00000299259 ABCC10Q5T3U5 1492 aa15.66■□□□□ 0.1
COPS2-201ENST00000299259 OSCARQ8IYS5 282 aa15.65■□□□□ 0.1
COPS2-201ENST00000299259 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
COPS2-201ENST00000299259 PTPRKQ15262 1439 aa15.64■□□□□ 0.09
COPS2-201ENST00000299259 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
COPS2-201ENST00000299259 PREX2Q70Z35 1606 aa15.64■□□□□ 0.09
COPS2-201ENST00000299259 KDM5BQ9UGL1 1544 aa15.64■□□□□ 0.09
COPS2-201ENST00000299259 CROCC2H7BZ55 1655 aa15.64■□□□□ 0.09
COPS2-201ENST00000299259 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa15.64■□□□□ 0.09
COPS2-201ENST00000299259 HFM1A2PYH4 1435 aa15.63■□□□□ 0.09
COPS2-201ENST00000299259 MYO5CQ9NQX4 1742 aa15.61■□□□□ 0.09
COPS2-201ENST00000299259 TTC37Q6PGP7 1564 aa15.61■□□□□ 0.09
COPS2-201ENST00000299259 AKNAQ7Z591 1439 aa15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.9 ms