RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297239.10

SYTL3-201, Transcript of synaptotagmin like 3, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYTL3, Length 2,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3-201ENST00000297239 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
SYTL3-201ENST00000297239 P3H3Q8IVL6 736 aa27.39■■□□□ 1.98
SYTL3-201ENST00000297239 IFT140Q96RY7 1462 aa27.39■■□□□ 1.97
SYTL3-201ENST00000297239 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
SYTL3-201ENST00000297239 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.31■■□□□ 1.96
SYTL3-201ENST00000297239 ADAMTS12P58397 1594 aa27.3■■□□□ 1.96
SYTL3-201ENST00000297239 GRIN2BQ13224 1484 aa27.29■■□□□ 1.96
SYTL3-201ENST00000297239 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.27■■□□□ 1.96
SYTL3-201ENST00000297239 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
SYTL3-201ENST00000297239 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
SYTL3-201ENST00000297239 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.25■■□□□ 1.95
SYTL3-201ENST00000297239 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
SYTL3-201ENST00000297239 TIAM1Q13009 1591 aa27.17■■□□□ 1.94
SYTL3-201ENST00000297239 SAMD9Q5K651 1589 aa27.17■■□□□ 1.94
SYTL3-201ENST00000297239 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.17■■□□□ 1.94
SYTL3-201ENST00000297239 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
SYTL3-201ENST00000297239 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
SYTL3-201ENST00000297239 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
SYTL3-201ENST00000297239 MAP3K1Q13233 1512 aa27.09■■□□□ 1.93
SYTL3-201ENST00000297239 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
SYTL3-201ENST00000297239 IQGAP2Q13576 1575 aa27.08■■□□□ 1.93
SYTL3-201ENST00000297239 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.07■■□□□ 1.92
SYTL3-201ENST00000297239 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.07■■□□□ 1.92
SYTL3-201ENST00000297239 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.06■■□□□ 1.92
SYTL3-201ENST00000297239 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.05■■□□□ 1.92
SYTL3-201ENST00000297239 FMN1Q68DA7 1419 aa27.03■■□□□ 1.92
SYTL3-201ENST00000297239 GRIN2AQ12879 1464 aa27.02■■□□□ 1.92
SYTL3-201ENST00000297239 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
SYTL3-201ENST00000297239 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
SYTL3-201ENST00000297239 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.98■■□□□ 1.91
SYTL3-201ENST00000297239 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
SYTL3-201ENST00000297239 SYNJ2O15056 1496 aa26.93■■□□□ 1.9
SYTL3-201ENST00000297239 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.92■■□□□ 1.9
SYTL3-201ENST00000297239 FBLN2P98095 1184 aa26.92■■□□□ 1.9
SYTL3-201ENST00000297239 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.91■■□□□ 1.9
SYTL3-201ENST00000297239 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.91■■□□□ 1.9
SYTL3-201ENST00000297239 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
SYTL3-201ENST00000297239 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.91■■□□□ 1.9
SYTL3-201ENST00000297239 CEP170Q5SW79 1584 aa26.9■■□□□ 1.9
SYTL3-201ENST00000297239 DISP1Q96F81 1524 aa26.84■■□□□ 1.89
SYTL3-201ENST00000297239 KIAA0556O60303 1618 aa26.81■■□□□ 1.88
SYTL3-201ENST00000297239 ITGAEP38570 1179 aa26.81■■□□□ 1.88
SYTL3-201ENST00000297239 MYT1Q01538 1121 aa26.81■■□□□ 1.88
SYTL3-201ENST00000297239 NUP160Q12769 1436 aa26.77■■□□□ 1.88
SYTL3-201ENST00000297239 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.75■■□□□ 1.87
SYTL3-201ENST00000297239 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.74■■□□□ 1.87
SYTL3-201ENST00000297239 HECW1Q76N89 1606 aa26.74■■□□□ 1.87
SYTL3-201ENST00000297239 ARID3CA6NKF2 412 aa26.73■■□□□ 1.87
SYTL3-201ENST00000297239 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
SYTL3-201ENST00000297239 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
SYTL3-201ENST00000297239 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
SYTL3-201ENST00000297239 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.67■■□□□ 1.86
SYTL3-201ENST00000297239 NCOA2Q15596 1464 aa26.65■■□□□ 1.86
SYTL3-201ENST00000297239 JPH4Q96JJ6 628 aa26.65■■□□□ 1.86
SYTL3-201ENST00000297239 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.65■■□□□ 1.86
SYTL3-201ENST00000297239 CHD1O14646 1710 aa26.63■■□□□ 1.85
SYTL3-201ENST00000297239 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
SYTL3-201ENST00000297239 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.61■■□□□ 1.85
SYTL3-201ENST00000297239 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.59■■□□□ 1.85
SYTL3-201ENST00000297239 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
SYTL3-201ENST00000297239 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
SYTL3-201ENST00000297239 ARHGEF11O15085 1522 aa26.55■■□□□ 1.84
SYTL3-201ENST00000297239 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.55■■□□□ 1.84
SYTL3-201ENST00000297239 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.54■■□□□ 1.84
SYTL3-201ENST00000297239 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.53■■□□□ 1.84
SYTL3-201ENST00000297239 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.52■■□□□ 1.84
SYTL3-201ENST00000297239 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.5■■□□□ 1.83
SYTL3-201ENST00000297239 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.46■■□□□ 1.83
SYTL3-201ENST00000297239 PTPRKQ15262 1439 aa26.45■■□□□ 1.82
SYTL3-201ENST00000297239 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
SYTL3-201ENST00000297239 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.44■■□□□ 1.82
SYTL3-201ENST00000297239 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
SYTL3-201ENST00000297239 ABCA8O94911 1581 aa26.38■■□□□ 1.81
SYTL3-201ENST00000297239 SHROOM2Q13796 1616 aa26.34■■□□□ 1.81
SYTL3-201ENST00000297239 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.34■■□□□ 1.81
SYTL3-201ENST00000297239 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
SYTL3-201ENST00000297239 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.33■■□□□ 1.81
SYTL3-201ENST00000297239 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
SYTL3-201ENST00000297239 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
SYTL3-201ENST00000297239 MAPKBP1O60336 1514 aa26.3■■□□□ 1.8
SYTL3-201ENST00000297239 PTPRGP23470 1445 aa26.3■■□□□ 1.8
SYTL3-201ENST00000297239 KIF14Q15058 1648 aa26.29■■□□□ 1.8
SYTL3-201ENST00000297239 MIA2Q96PC5 1412 aa26.28■■□□□ 1.8
SYTL3-201ENST00000297239 ATP10BO94823 1461 aa26.27■■□□□ 1.8
SYTL3-201ENST00000297239 HFM1A2PYH4 1435 aa26.25■■□□□ 1.79
SYTL3-201ENST00000297239 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.23■■□□□ 1.79
SYTL3-201ENST00000297239 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
SYTL3-201ENST00000297239 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.23■■□□□ 1.79
SYTL3-201ENST00000297239 NEUROD1Q13562 356 aa26.22■■□□□ 1.79
SYTL3-201ENST00000297239 NAIPQ13075 1403 aa26.22■■□□□ 1.79
SYTL3-201ENST00000297239 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.21■■□□□ 1.79
SYTL3-201ENST00000297239 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.18■■□□□ 1.78
SYTL3-201ENST00000297239 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
SYTL3-201ENST00000297239 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.15■■□□□ 1.78
SYTL3-201ENST00000297239 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
SYTL3-201ENST00000297239 UACAQ9BZF9 1416 aa26.14■■□□□ 1.77
SYTL3-201ENST00000297239 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.12■■□□□ 1.77
SYTL3-201ENST00000297239 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
SYTL3-201ENST00000297239 DAPK1P53355 1430 aa26.11■■□□□ 1.77
SYTL3-201ENST00000297239 KDM6BO15054 1643 aa26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.5 ms