RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295057.3

LRRTM1-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM1, Length 2,599 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM1-201ENST00000295057 APLP2Q06481 763 aa22.84■■□□□ 1.25
LRRTM1-201ENST00000295057 WDR62O43379 1518 aa22.83■■□□□ 1.25
LRRTM1-201ENST00000295057 WDR97A6NE52 1622 aa22.82■■□□□ 1.24
LRRTM1-201ENST00000295057 P3H3Q8IVL6 736 aa22.81■■□□□ 1.24
LRRTM1-201ENST00000295057 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
LRRTM1-201ENST00000295057 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.8■■□□□ 1.24
LRRTM1-201ENST00000295057 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
LRRTM1-201ENST00000295057 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
LRRTM1-201ENST00000295057 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.76■■□□□ 1.23
LRRTM1-201ENST00000295057 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.75■■□□□ 1.23
LRRTM1-201ENST00000295057 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
LRRTM1-201ENST00000295057 MIER1Q8N108 512 aa22.69■■□□□ 1.22
LRRTM1-201ENST00000295057 CUL7Q14999 1698 aa22.69■■□□□ 1.22
LRRTM1-201ENST00000295057 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
LRRTM1-201ENST00000295057 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
LRRTM1-201ENST00000295057 IFT140Q96RY7 1462 aa22.62■■□□□ 1.21
LRRTM1-201ENST00000295057 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.62■■□□□ 1.21
LRRTM1-201ENST00000295057 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
LRRTM1-201ENST00000295057 PBRM1Q86U86 1689 aa22.54■■□□□ 1.2
LRRTM1-201ENST00000295057 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.53■■□□□ 1.2
LRRTM1-201ENST00000295057 GRIN2BQ13224 1484 aa22.51■■□□□ 1.19
LRRTM1-201ENST00000295057 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.5■■□□□ 1.19
LRRTM1-201ENST00000295057 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
LRRTM1-201ENST00000295057 ADAMTS12P58397 1594 aa22.46■■□□□ 1.19
LRRTM1-201ENST00000295057 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.43■■□□□ 1.18
LRRTM1-201ENST00000295057 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.43■■□□□ 1.18
LRRTM1-201ENST00000295057 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
LRRTM1-201ENST00000295057 TIAM1Q13009 1591 aa22.41■■□□□ 1.18
LRRTM1-201ENST00000295057 FBLN2P98095 1184 aa22.38■■□□□ 1.17
LRRTM1-201ENST00000295057 ITGAEP38570 1179 aa22.37■■□□□ 1.17
LRRTM1-201ENST00000295057 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.36■■□□□ 1.17
LRRTM1-201ENST00000295057 SAMD9Q5K651 1589 aa22.35■■□□□ 1.17
LRRTM1-201ENST00000295057 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.35■■□□□ 1.17
LRRTM1-201ENST00000295057 FMN1Q68DA7 1419 aa22.32■■□□□ 1.16
LRRTM1-201ENST00000295057 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.32■■□□□ 1.16
LRRTM1-201ENST00000295057 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
LRRTM1-201ENST00000295057 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
LRRTM1-201ENST00000295057 MAP3K1Q13233 1512 aa22.3■■□□□ 1.16
LRRTM1-201ENST00000295057 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.3■■□□□ 1.16
LRRTM1-201ENST00000295057 IQGAP2Q13576 1575 aa22.3■■□□□ 1.16
LRRTM1-201ENST00000295057 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.3■■□□□ 1.16
LRRTM1-201ENST00000295057 ARID3CA6NKF2 412 aa22.29■■□□□ 1.16
LRRTM1-201ENST00000295057 GRIN2AQ12879 1464 aa22.28■■□□□ 1.16
LRRTM1-201ENST00000295057 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
LRRTM1-201ENST00000295057 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.25■■□□□ 1.15
LRRTM1-201ENST00000295057 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
LRRTM1-201ENST00000295057 BCL11AQ9H165 835 aa22.25■■□□□ 1.15
LRRTM1-201ENST00000295057 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
LRRTM1-201ENST00000295057 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.2■■□□□ 1.14
LRRTM1-201ENST00000295057 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.19■■□□□ 1.14
LRRTM1-201ENST00000295057 SYNJ2O15056 1496 aa22.19■■□□□ 1.14
LRRTM1-201ENST00000295057 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.17■■□□□ 1.14
LRRTM1-201ENST00000295057 CEP170Q5SW79 1584 aa22.16■■□□□ 1.14
LRRTM1-201ENST00000295057 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.15■■□□□ 1.14
LRRTM1-201ENST00000295057 DISP1Q96F81 1524 aa22.15■■□□□ 1.14
LRRTM1-201ENST00000295057 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.13■■□□□ 1.13
LRRTM1-201ENST00000295057 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.12■■□□□ 1.13
LRRTM1-201ENST00000295057 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.09■■□□□ 1.13
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LRRTM1-201ENST00000295057 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.08■■□□□ 1.13
LRRTM1-201ENST00000295057 KIAA0556O60303 1618 aa22.08■■□□□ 1.12
LRRTM1-201ENST00000295057 JPH4Q96JJ6 628 aa22.07■■□□□ 1.12
LRRTM1-201ENST00000295057 NUP160Q12769 1436 aa22.04■■□□□ 1.12
LRRTM1-201ENST00000295057 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
LRRTM1-201ENST00000295057 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
LRRTM1-201ENST00000295057 NCOA2Q15596 1464 aa22.04■■□□□ 1.12
LRRTM1-201ENST00000295057 HECW1Q76N89 1606 aa22.01■■□□□ 1.11
LRRTM1-201ENST00000295057 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.01■■□□□ 1.11
LRRTM1-201ENST00000295057 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22■■□□□ 1.11
LRRTM1-201ENST00000295057 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.98■■□□□ 1.11
LRRTM1-201ENST00000295057 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.97■■□□□ 1.11
LRRTM1-201ENST00000295057 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.96■■□□□ 1.11
LRRTM1-201ENST00000295057 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
LRRTM1-201ENST00000295057 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.93■■□□□ 1.1
LRRTM1-201ENST00000295057 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
LRRTM1-201ENST00000295057 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.92■■□□□ 1.1
LRRTM1-201ENST00000295057 PTPRKQ15262 1439 aa21.92■■□□□ 1.1
LRRTM1-201ENST00000295057 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.9■■□□□ 1.1
LRRTM1-201ENST00000295057 KCNH8Q96L42 1107 aa21.9■■□□□ 1.1
LRRTM1-201ENST00000295057 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.9■■□□□ 1.1
LRRTM1-201ENST00000295057 ARHGEF11O15085 1522 aa21.88■■□□□ 1.09
LRRTM1-201ENST00000295057 CHD1O14646 1710 aa21.87■■□□□ 1.09
LRRTM1-201ENST00000295057 BCANQ96GW7 911 aa21.87■■□□□ 1.09
LRRTM1-201ENST00000295057 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
LRRTM1-201ENST00000295057 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.09
LRRTM1-201ENST00000295057 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.85■■□□□ 1.09
LRRTM1-201ENST00000295057 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.81■■□□□ 1.08
LRRTM1-201ENST00000295057 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
LRRTM1-201ENST00000295057 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
LRRTM1-201ENST00000295057 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.78■■□□□ 1.08
LRRTM1-201ENST00000295057 MAPKBP1O60336 1514 aa21.76■■□□□ 1.07
LRRTM1-201ENST00000295057 PTPRGP23470 1445 aa21.75■■□□□ 1.07
LRRTM1-201ENST00000295057 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.74■■□□□ 1.07
LRRTM1-201ENST00000295057 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.73■■□□□ 1.07
LRRTM1-201ENST00000295057 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.73■■□□□ 1.07
LRRTM1-201ENST00000295057 FKBP8Q14318 412 aa21.72■■□□□ 1.07
LRRTM1-201ENST00000295057 ABCA8O94911 1581 aa21.72■■□□□ 1.07
LRRTM1-201ENST00000295057 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
LRRTM1-201ENST00000295057 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
LRRTM1-201ENST00000295057 ATP10BO94823 1461 aa21.71■■□□□ 1.07
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