RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP32.37■■■□□ 2.77
PITX1-201ENST00000265340 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa32.37■■■□□ 2.77
PITX1-201ENST00000265340 WDR97A6NE52 1622 aa32.36■■■□□ 2.77
PITX1-201ENST00000265340 IFT140Q96RY7 1462 aa32.36■■■□□ 2.77
PITX1-201ENST00000265340 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.34■■■□□ 2.77
PITX1-201ENST00000265340 CLIP1P30622 1438 aa32.32■■■□□ 2.76
PITX1-201ENST00000265340 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.31■■■□□ 2.76
PITX1-201ENST00000265340 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.31■■■□□ 2.761e-12■■■■□ 22
PITX1-201ENST00000265340 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP32.25■■■□□ 2.75
PITX1-201ENST00000265340 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.25■■■□□ 2.75
PITX1-201ENST00000265340 IGF1RP08069 1367 aa32.24■■■□□ 2.75
PITX1-201ENST00000265340 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.22■■■□□ 2.75
PITX1-201ENST00000265340 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.22■■■□□ 2.75
PITX1-201ENST00000265340 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
PITX1-201ENST00000265340 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.74
PITX1-201ENST00000265340 VPS8Q8N3P4 1428 aa32.08■■■□□ 2.73
PITX1-201ENST00000265340 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.07■■■□□ 2.72
PITX1-201ENST00000265340 MIER1Q8N108 512 aa32.07■■■□□ 2.72
PITX1-201ENST00000265340 PBRM1Q86U86 1689 aa32.06■■■□□ 2.72
PITX1-201ENST00000265340 GRIN2BQ13224 1484 aa32.04■■■□□ 2.72
PITX1-201ENST00000265340 ARAP1Q96P48 1450 aa31.96■■■□□ 2.71
PITX1-201ENST00000265340 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.95■■■□□ 2.71
PITX1-201ENST00000265340 CUL7Q14999 1698 aa31.93■■■□□ 2.7
PITX1-201ENST00000265340 ADAMTS12P58397 1594 aa31.86■■■□□ 2.69
PITX1-201ENST00000265340 FBLN2P98095 1184 aa31.86■■■□□ 2.69
PITX1-201ENST00000265340 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.84■■■□□ 2.69
PITX1-201ENST00000265340 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.84■■■□□ 2.69
PITX1-201ENST00000265340 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.79■■■□□ 2.68
PITX1-201ENST00000265340 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.77■■■□□ 2.68
PITX1-201ENST00000265340 SYNJ2O15056 1496 aa31.7■■■□□ 2.67
PITX1-201ENST00000265340 GRIN2AQ12879 1464 aa31.66■■■□□ 2.66
PITX1-201ENST00000265340 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP31.59■■■□□ 2.65
PITX1-201ENST00000265340 CHD1O14646 1710 aa31.56■■■□□ 2.64
PITX1-201ENST00000265340 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.54■■■□□ 2.64
PITX1-201ENST00000265340 CEP170Q5SW79 1584 aa31.5■■■□□ 2.63
PITX1-201ENST00000265340 P3H3Q8IVL6 736 aa31.49■■■□□ 2.63
PITX1-201ENST00000265340 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP31.48■■■□□ 2.63
PITX1-201ENST00000265340 MYT1LQ9UL68 1186 aa31.47■■■□□ 2.63
PITX1-201ENST00000265340 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP31.44■■■□□ 2.62
PITX1-201ENST00000265340 NUP160Q12769 1436 aa31.42■■■□□ 2.62
PITX1-201ENST00000265340 FHOD3Q2V2M9 1422 aa31.41■■■□□ 2.62
PITX1-201ENST00000265340 IQGAP2Q13576 1575 aa31.4■■■□□ 2.62
PITX1-201ENST00000265340 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP31.39■■■□□ 2.62
PITX1-201ENST00000265340 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.39■■■□□ 2.61
PITX1-201ENST00000265340 EFCAB5A4FU69 1503 aa31.35■■■□□ 2.61
PITX1-201ENST00000265340 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP31.32■■■□□ 2.6
PITX1-201ENST00000265340 TIAM1Q13009 1591 aa31.32■■■□□ 2.6
PITX1-201ENST00000265340 MSH5O43196 834 aa31.29■■■□□ 2.6
PITX1-201ENST00000265340 MAP3K1Q13233 1512 aa31.28■■■□□ 2.6
PITX1-201ENST00000265340 JPH4Q96JJ6 628 aa31.27■■■□□ 2.6
PITX1-201ENST00000265340 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
PITX1-201ENST00000265340 SAMD9Q5K651 1589 aa31.22■■■□□ 2.59
PITX1-201ENST00000265340 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.59
PITX1-201ENST00000265340 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.2■■■□□ 2.58
PITX1-201ENST00000265340 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.19■■■□□ 2.58
PITX1-201ENST00000265340 OSCARQ8IYS5 282 aa31.17■■■□□ 2.58
PITX1-201ENST00000265340 CFAP43Q8NDM7 1665 aa31.17■■■□□ 2.58
PITX1-201ENST00000265340 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.17■■■□□ 2.58
PITX1-201ENST00000265340 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.16■■■□□ 2.58
PITX1-201ENST00000265340 ERICH6BQ5W0A0 696 aa31.15■■■□□ 2.58
PITX1-201ENST00000265340 DISP1Q96F81 1524 aa31.14■■■□□ 2.58
PITX1-201ENST00000265340 FANCIQ9NVI1 1328 aa31.14■■■□□ 2.57
PITX1-201ENST00000265340 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.13■■■□□ 2.57
PITX1-201ENST00000265340 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa31.13■■■□□ 2.57
PITX1-201ENST00000265340 FMN1Q68DA7 1419 aa31.12■■■□□ 2.57
PITX1-201ENST00000265340 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.1■■■□□ 2.57
PITX1-201ENST00000265340 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
PITX1-201ENST00000265340 DEKP35659 375 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
PITX1-201ENST00000265340 KIAA0556O60303 1618 aa31.08■■■□□ 2.57
PITX1-201ENST00000265340 BCANQ96GW7 911 aa31.06■■■□□ 2.56
PITX1-201ENST00000265340 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.05■■■□□ 2.56
PITX1-201ENST00000265340 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.02■■■□□ 2.56
PITX1-201ENST00000265340 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.02■■■□□ 2.56
PITX1-201ENST00000265340 SHROOM2Q13796 1616 aa31.01■■■□□ 2.56
PITX1-201ENST00000265340 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.99■■■□□ 2.55
PITX1-201ENST00000265340 FKBP8Q14318 412 aa30.99■■■□□ 2.55
PITX1-201ENST00000265340 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP30.96■■■□□ 2.55
PITX1-201ENST00000265340 ITGAEP38570 1179 aa30.94■■■□□ 2.54
PITX1-201ENST00000265340 ARID3CA6NKF2 412 aa30.89■■■□□ 2.54
PITX1-201ENST00000265340 PTPRGP23470 1445 aa30.83■■■□□ 2.53
PITX1-201ENST00000265340 PLB1Q6P1J6 1458 aa30.83■■■□□ 2.53
PITX1-201ENST00000265340 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.82■■■□□ 2.52
PITX1-201ENST00000265340 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
PITX1-201ENST00000265340 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
PITX1-201ENST00000265340 NEFLP07196 543 aa30.77■■■□□ 2.52
PITX1-201ENST00000265340 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.74■■■□□ 2.51
PITX1-201ENST00000265340 HECW1Q76N89 1606 aa30.72■■■□□ 2.51
PITX1-201ENST00000265340 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.72■■■□□ 2.51
PITX1-201ENST00000265340 NCOA2Q15596 1464 aa30.7■■■□□ 2.5
PITX1-201ENST00000265340 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.69■■■□□ 2.5
PITX1-201ENST00000265340 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.69■■■□□ 2.5
PITX1-201ENST00000265340 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.69■■■□□ 2.5
PITX1-201ENST00000265340 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa30.68■■■□□ 2.5
PITX1-201ENST00000265340 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.68■■■□□ 2.5
PITX1-201ENST00000265340 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
PITX1-201ENST00000265340 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
PITX1-201ENST00000265340 CCDC136Q96JN2 1154 aa30.66■■■□□ 2.5
PITX1-201ENST00000265340 ABCA8O94911 1581 aa30.65■■■□□ 2.5
PITX1-201ENST00000265340 ARHGEF11O15085 1522 aa30.64■■■□□ 2.5
PITX1-201ENST00000265340 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms