RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263663.9

TAF1B-201, Transcript of TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TAF1B, Length 2,387 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1B-201ENST00000263663 PBRM1Q86U86 1689 aa25.07■■□□□ 1.6
TAF1B-201ENST00000263663 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.04■■□□□ 1.6
TAF1B-201ENST00000263663 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
TAF1B-201ENST00000263663 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.03■■□□□ 1.6
TAF1B-201ENST00000263663 TIAM1Q13009 1591 aa25.02■■□□□ 1.6
TAF1B-201ENST00000263663 WDR62O43379 1518 aa25.02■■□□□ 1.6
TAF1B-201ENST00000263663 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.01■■□□□ 1.59
TAF1B-201ENST00000263663 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.99■■□□□ 1.59
TAF1B-201ENST00000263663 MAP3K1Q13233 1512 aa24.96■■□□□ 1.59
TAF1B-201ENST00000263663 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.94■■□□□ 1.58
TAF1B-201ENST00000263663 ERCC6Q03468 1493 aa24.93■■□□□ 1.58
TAF1B-201ENST00000263663 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
TAF1B-201ENST00000263663 ADAMTS12P58397 1594 aa24.93■■□□□ 1.58
TAF1B-201ENST00000263663 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
TAF1B-201ENST00000263663 IFT140Q96RY7 1462 aa24.91■■□□□ 1.58
TAF1B-201ENST00000263663 SAMD9Q5K651 1589 aa24.91■■□□□ 1.58
TAF1B-201ENST00000263663 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.89■■□□□ 1.58
TAF1B-201ENST00000263663 GRIN2BQ13224 1484 aa24.88■■□□□ 1.57
TAF1B-201ENST00000263663 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.88■■□□□ 1.57
TAF1B-201ENST00000263663 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
TAF1B-201ENST00000263663 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
TAF1B-201ENST00000263663 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.85■■□□□ 1.57
TAF1B-201ENST00000263663 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.84■■□□□ 1.57
TAF1B-201ENST00000263663 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.82■■□□□ 1.56
TAF1B-201ENST00000263663 FMN1Q68DA7 1419 aa24.82■■□□□ 1.56
TAF1B-201ENST00000263663 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
TAF1B-201ENST00000263663 IQGAP2Q13576 1575 aa24.77■■□□□ 1.56
TAF1B-201ENST00000263663 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.77■■□□□ 1.56
TAF1B-201ENST00000263663 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.77■■□□□ 1.56
TAF1B-201ENST00000263663 ITGAEP38570 1179 aa24.69■■□□□ 1.54
TAF1B-201ENST00000263663 GRIN2AQ12879 1464 aa24.63■■□□□ 1.53
TAF1B-201ENST00000263663 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
TAF1B-201ENST00000263663 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.6■■□□□ 1.53
TAF1B-201ENST00000263663 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
TAF1B-201ENST00000263663 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.58■■□□□ 1.53
TAF1B-201ENST00000263663 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.57■■□□□ 1.52
TAF1B-201ENST00000263663 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
TAF1B-201ENST00000263663 HECW1Q76N89 1606 aa24.54■■□□□ 1.52
TAF1B-201ENST00000263663 KIAA0556O60303 1618 aa24.52■■□□□ 1.52
TAF1B-201ENST00000263663 SYNJ2O15056 1496 aa24.52■■□□□ 1.52
TAF1B-201ENST00000263663 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.52■■□□□ 1.52
TAF1B-201ENST00000263663 DISP1Q96F81 1524 aa24.52■■□□□ 1.52
TAF1B-201ENST00000263663 CEP170Q5SW79 1584 aa24.51■■□□□ 1.51
TAF1B-201ENST00000263663 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.51■■□□□ 1.51
TAF1B-201ENST00000263663 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.5■■□□□ 1.51
TAF1B-201ENST00000263663 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.49■■□□□ 1.51
TAF1B-201ENST00000263663 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.49■■□□□ 1.51
TAF1B-201ENST00000263663 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
TAF1B-201ENST00000263663 NCOA2Q15596 1464 aa24.48■■□□□ 1.51
TAF1B-201ENST00000263663 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
TAF1B-201ENST00000263663 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
TAF1B-201ENST00000263663 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
TAF1B-201ENST00000263663 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.46■■□□□ 1.51
TAF1B-201ENST00000263663 FBLN2P98095 1184 aa24.45■■□□□ 1.51
TAF1B-201ENST00000263663 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.43■■□□□ 1.5
TAF1B-201ENST00000263663 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.42■■□□□ 1.5
TAF1B-201ENST00000263663 ARID3CA6NKF2 412 aa24.42■■□□□ 1.5
TAF1B-201ENST00000263663 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.41■■□□□ 1.5
TAF1B-201ENST00000263663 ARHGEF11O15085 1522 aa24.39■■□□□ 1.5
TAF1B-201ENST00000263663 NUP160Q12769 1436 aa24.38■■□□□ 1.49
TAF1B-201ENST00000263663 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.35■■□□□ 1.49
TAF1B-201ENST00000263663 MAPKBP1O60336 1514 aa24.34■■□□□ 1.49
TAF1B-201ENST00000263663 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
TAF1B-201ENST00000263663 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
TAF1B-201ENST00000263663 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.33■■□□□ 1.49
TAF1B-201ENST00000263663 PTPRKQ15262 1439 aa24.31■■□□□ 1.48
TAF1B-201ENST00000263663 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
TAF1B-201ENST00000263663 JPH4Q96JJ6 628 aa24.26■■□□□ 1.47
TAF1B-201ENST00000263663 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.25■■□□□ 1.47
TAF1B-201ENST00000263663 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.22■■□□□ 1.47
TAF1B-201ENST00000263663 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
TAF1B-201ENST00000263663 CHD1O14646 1710 aa24.21■■□□□ 1.47
TAF1B-201ENST00000263663 HFM1A2PYH4 1435 aa24.2■■□□□ 1.47
TAF1B-201ENST00000263663 NAIPQ13075 1403 aa24.16■■□□□ 1.46
TAF1B-201ENST00000263663 MIA2Q96PC5 1412 aa24.15■■□□□ 1.46
TAF1B-201ENST00000263663 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
TAF1B-201ENST00000263663 ABCA8O94911 1581 aa24.09■■□□□ 1.45
TAF1B-201ENST00000263663 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
TAF1B-201ENST00000263663 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
TAF1B-201ENST00000263663 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.09■■□□□ 1.45
TAF1B-201ENST00000263663 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.09■■□□□ 1.45
TAF1B-201ENST00000263663 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.09■■□□□ 1.45
TAF1B-201ENST00000263663 KIF14Q15058 1648 aa24.08■■□□□ 1.44
TAF1B-201ENST00000263663 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.06■■□□□ 1.44
TAF1B-201ENST00000263663 UACAQ9BZF9 1416 aa24.05■■□□□ 1.44
TAF1B-201ENST00000263663 NEUROD1Q13562 356 aa24.04■■□□□ 1.44
TAF1B-201ENST00000263663 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.04■■□□□ 1.44
TAF1B-201ENST00000263663 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
TAF1B-201ENST00000263663 KDM6BO15054 1643 aa24.02■■□□□ 1.44
TAF1B-201ENST00000263663 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
TAF1B-201ENST00000263663 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24■■□□□ 1.43
TAF1B-201ENST00000263663 AKNAQ7Z591 1439 aa24■■□□□ 1.43
TAF1B-201ENST00000263663 DAPK1P53355 1430 aa23.99■■□□□ 1.43
TAF1B-201ENST00000263663 ATP10BO94823 1461 aa23.99■■□□□ 1.43
TAF1B-201ENST00000263663 SHROOM2Q13796 1616 aa23.98■■□□□ 1.43
TAF1B-201ENST00000263663 PTPRGP23470 1445 aa23.96■■□□□ 1.43
TAF1B-201ENST00000263663 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
TAF1B-201ENST00000263663 ABCC5O15440 1437 aa23.95■■□□□ 1.43
TAF1B-201ENST00000263663 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.95■■□□□ 1.42
TAF1B-201ENST00000263663 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms