RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263663.9

TAF1B-201, Transcript of TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TAF1B, Length 2,387 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1B-201ENST00000263663 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.15■■■■□ 3.38
TAF1B-201ENST00000263663 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.18■■■□□ 2.58
TAF1B-201ENST00000263663 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
TAF1B-201ENST00000263663 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.16■■■□□ 2.42
TAF1B-201ENST00000263663 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.9■■■□□ 2.38
TAF1B-201ENST00000263663 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.74■■■□□ 2.35
TAF1B-201ENST00000263663 ABCC9O60706 1549 aa29.23■■■□□ 2.27
TAF1B-201ENST00000263663 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
TAF1B-201ENST00000263663 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.14■■■□□ 2.26
TAF1B-201ENST00000263663 SCRIBQ14160 1630 aa28.98■■■□□ 2.23
TAF1B-201ENST00000263663 NACADO15069 1562 aa28.9■■■□□ 2.22
TAF1B-201ENST00000263663 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.57■■■□□ 2.16
TAF1B-201ENST00000263663 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
TAF1B-201ENST00000263663 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.21■■■□□ 2.11
TAF1B-201ENST00000263663 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.18■■■□□ 2.1
TAF1B-201ENST00000263663 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.16■■■□□ 2.1
TAF1B-201ENST00000263663 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.05■■■□□ 2.08
TAF1B-201ENST00000263663 WIZO95785 1651 aa27.89■■■□□ 2.06
TAF1B-201ENST00000263663 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
TAF1B-201ENST00000263663 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.81■■■□□ 2.04
TAF1B-201ENST00000263663 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.73■■■□□ 2.03
TAF1B-201ENST00000263663 SMARCA4P51532 1647 aa27.71■■■□□ 2.03
TAF1B-201ENST00000263663 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
TAF1B-201ENST00000263663 TRIM41Q8WV44 630 aa27.31■■□□□ 1.96
TAF1B-201ENST00000263663 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
TAF1B-201ENST00000263663 SMARCA2P51531 1590 aa27.29■■□□□ 1.96
TAF1B-201ENST00000263663 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.26■■□□□ 1.95
TAF1B-201ENST00000263663 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.25■■□□□ 1.95
TAF1B-201ENST00000263663 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.23■■□□□ 1.95
TAF1B-201ENST00000263663 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.1■■□□□ 1.93
TAF1B-201ENST00000263663 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
TAF1B-201ENST00000263663 ABCC8Q09428 1581 aa26.99■■□□□ 1.91
TAF1B-201ENST00000263663 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
TAF1B-201ENST00000263663 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.74■■□□□ 1.87
TAF1B-201ENST00000263663 HMGXB3Q12766 1538 aa26.71■■□□□ 1.87
TAF1B-201ENST00000263663 NCAPD3P42695 1498 aa26.7■■□□□ 1.86
TAF1B-201ENST00000263663 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.61■■□□□ 1.85
TAF1B-201ENST00000263663 SYNJ1O43426 1573 aa26.56■■□□□ 1.84
TAF1B-201ENST00000263663 SOGA1O94964 1423 aa26.56■■□□□ 1.84
TAF1B-201ENST00000263663 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.55■■□□□ 1.84
TAF1B-201ENST00000263663 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.47■■□□□ 1.83
TAF1B-201ENST00000263663 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.4■■□□□ 1.82
TAF1B-201ENST00000263663 EEA1Q15075 1411 aa26.38■■□□□ 1.81
TAF1B-201ENST00000263663 TOP2BQ02880 1626 aa26.31■■□□□ 1.8
TAF1B-201ENST00000263663 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.31■■□□□ 1.8
TAF1B-201ENST00000263663 CFTRP13569 1480 aa26.3■■□□□ 1.8
TAF1B-201ENST00000263663 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.26■■□□□ 1.79
TAF1B-201ENST00000263663 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
TAF1B-201ENST00000263663 PRDM2Q13029 1718 aa26.22■■□□□ 1.79
TAF1B-201ENST00000263663 CUX1P39880 1505 aa26.17■■□□□ 1.78
TAF1B-201ENST00000263663 GOLGA3Q08378 1498 aa26.15■■□□□ 1.78
TAF1B-201ENST00000263663 CEP162Q5TB80 1403 aa26.14■■□□□ 1.78
TAF1B-201ENST00000263663 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.14■■□□□ 1.78
TAF1B-201ENST00000263663 HRCP23327 699 aa26.13■■□□□ 1.77
TAF1B-201ENST00000263663 KIF21BO75037 1637 aa26.11■■□□□ 1.77
TAF1B-201ENST00000263663 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
TAF1B-201ENST00000263663 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.09■■□□□ 1.77
TAF1B-201ENST00000263663 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.08■■□□□ 1.77
TAF1B-201ENST00000263663 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
TAF1B-201ENST00000263663 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.97■■□□□ 1.75
TAF1B-201ENST00000263663 NESP48681 1621 aa25.87■■□□□ 1.73
TAF1B-201ENST00000263663 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.86■■□□□ 1.73
TAF1B-201ENST00000263663 KIF27Q86VH2 1401 aa25.84■■□□□ 1.73
TAF1B-201ENST00000263663 PRXQ9BXM0 1461 aa25.82■■□□□ 1.72
TAF1B-201ENST00000263663 CLIP1P30622 1438 aa25.8■■□□□ 1.72
TAF1B-201ENST00000263663 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.79■■□□□ 1.72
TAF1B-201ENST00000263663 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.79■■□□□ 1.72
TAF1B-201ENST00000263663 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.77■■□□□ 1.72
TAF1B-201ENST00000263663 CUX2O14529 1486 aa25.73■■□□□ 1.71
TAF1B-201ENST00000263663 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
TAF1B-201ENST00000263663 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.71■■□□□ 1.71
TAF1B-201ENST00000263663 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
TAF1B-201ENST00000263663 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.69■■□□□ 1.7
TAF1B-201ENST00000263663 TOPBP1Q92547 1522 aa25.64■■□□□ 1.7
TAF1B-201ENST00000263663 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.62■■□□□ 1.69
TAF1B-201ENST00000263663 IGF1RP08069 1367 aa25.59■■□□□ 1.69
TAF1B-201ENST00000263663 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
TAF1B-201ENST00000263663 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.57■■□□□ 1.68
TAF1B-201ENST00000263663 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
TAF1B-201ENST00000263663 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.53■■□□□ 1.68
TAF1B-201ENST00000263663 ARAP1Q96P48 1450 aa25.5■■□□□ 1.67
TAF1B-201ENST00000263663 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.5■■□□□ 1.67
TAF1B-201ENST00000263663 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.49■■□□□ 1.67
TAF1B-201ENST00000263663 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.47■■□□□ 1.67
TAF1B-201ENST00000263663 WDR97A6NE52 1622 aa25.42■■□□□ 1.66
TAF1B-201ENST00000263663 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.39■■□□□ 1.65
TAF1B-201ENST00000263663 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
TAF1B-201ENST00000263663 APLP2Q06481 763 aa25.36■■□□□ 1.65
TAF1B-201ENST00000263663 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
TAF1B-201ENST00000263663 CUL7Q14999 1698 aa25.3■■□□□ 1.64
TAF1B-201ENST00000263663 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.29■■□□□ 1.64
TAF1B-201ENST00000263663 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
TAF1B-201ENST00000263663 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
TAF1B-201ENST00000263663 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.2■■□□□ 1.63
TAF1B-201ENST00000263663 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
TAF1B-201ENST00000263663 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.18■■□□□ 1.62
TAF1B-201ENST00000263663 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
TAF1B-201ENST00000263663 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.17■■□□□ 1.62
TAF1B-201ENST00000263663 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
TAF1B-201ENST00000263663 P3H3Q8IVL6 736 aa25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 6 ms