RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
VGF-201ENST00000249330 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.51■■■□□ 2.47
VGF-201ENST00000249330 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
VGF-201ENST00000249330 IFT140Q96RY7 1462 aa30.48■■■□□ 2.47
VGF-201ENST00000249330 APLP2Q06481 763 aa30.41■■■□□ 2.46
VGF-201ENST00000249330 NEUROD1Q13562 356 aa30.4■■■□□ 2.46
VGF-201ENST00000249330 P3H3Q8IVL6 736 aa30.4■■■□□ 2.46
VGF-201ENST00000249330 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
VGF-201ENST00000249330 PBRM1Q86U86 1689 aa30.38■■■□□ 2.45
VGF-201ENST00000249330 GRIN2BQ13224 1484 aa30.34■■■□□ 2.45
VGF-201ENST00000249330 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
VGF-201ENST00000249330 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.29■■■□□ 2.44
VGF-201ENST00000249330 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.28■■■□□ 2.44
VGF-201ENST00000249330 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
VGF-201ENST00000249330 ADAMTS12P58397 1594 aa30.24■■■□□ 2.43
VGF-201ENST00000249330 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
VGF-201ENST00000249330 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.21■■■□□ 2.43
VGF-201ENST00000249330 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.2■■■□□ 2.42
VGF-201ENST00000249330 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa30.18■■■□□ 2.42
VGF-201ENST00000249330 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
VGF-201ENST00000249330 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.1■■■□□ 2.41
VGF-201ENST00000249330 FBLN2P98095 1184 aa30.07■■■□□ 2.4
VGF-201ENST00000249330 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
VGF-201ENST00000249330 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
VGF-201ENST00000249330 GRIN2AQ12879 1464 aa30.01■■■□□ 2.39
VGF-201ENST00000249330 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
VGF-201ENST00000249330 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
VGF-201ENST00000249330 SAMD9Q5K651 1589 aa30■■■□□ 2.39
VGF-201ENST00000249330 MYT1Q01538 1121 aa29.99■■■□□ 2.39
VGF-201ENST00000249330 IQGAP2Q13576 1575 aa29.99■■■□□ 2.39
VGF-201ENST00000249330 SYNJ2O15056 1496 aa29.95■■■□□ 2.38
VGF-201ENST00000249330 FMN1Q68DA7 1419 aa29.93■■■□□ 2.38
VGF-201ENST00000249330 TIAM1Q13009 1591 aa29.93■■■□□ 2.38
VGF-201ENST00000249330 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
VGF-201ENST00000249330 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.91■■■□□ 2.38
VGF-201ENST00000249330 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.9■■■□□ 2.38
VGF-201ENST00000249330 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.87■■■□□ 2.37
VGF-201ENST00000249330 MAP3K1Q13233 1512 aa29.86■■■□□ 2.37
VGF-201ENST00000249330 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.84■■■□□ 2.37
VGF-201ENST00000249330 CEP170Q5SW79 1584 aa29.83■■■□□ 2.37
VGF-201ENST00000249330 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.81■■■□□ 2.36
VGF-201ENST00000249330 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.76■■■□□ 2.35
VGF-201ENST00000249330 DISP1Q96F81 1524 aa29.75■■■□□ 2.35
VGF-201ENST00000249330 NUP160Q12769 1436 aa29.74■■■□□ 2.35
VGF-201ENST00000249330 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
VGF-201ENST00000249330 JPH4Q96JJ6 628 aa29.7■■■□□ 2.35
VGF-201ENST00000249330 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
VGF-201ENST00000249330 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.7■■■□□ 2.34
VGF-201ENST00000249330 ARID3CA6NKF2 412 aa29.69■■■□□ 2.34
VGF-201ENST00000249330 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.69■■■□□ 2.34
VGF-201ENST00000249330 KIAA0556O60303 1618 aa29.68■■■□□ 2.34
VGF-201ENST00000249330 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.66■■■□□ 2.34
VGF-201ENST00000249330 MIER1Q8N108 512 aa29.63■■■□□ 2.33
VGF-201ENST00000249330 ITGAEP38570 1179 aa29.62■■■□□ 2.33
VGF-201ENST00000249330 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.62■■■□□ 2.33
VGF-201ENST00000249330 CHD1O14646 1710 aa29.56■■■□□ 2.32
VGF-201ENST00000249330 HECW1Q76N89 1606 aa29.54■■■□□ 2.32
VGF-201ENST00000249330 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
VGF-201ENST00000249330 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
VGF-201ENST00000249330 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
VGF-201ENST00000249330 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.51■■■□□ 2.32
VGF-201ENST00000249330 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.51■■■□□ 2.31
VGF-201ENST00000249330 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.5■■■□□ 2.31
VGF-201ENST00000249330 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.46■■■□□ 2.31
VGF-201ENST00000249330 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
VGF-201ENST00000249330 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
VGF-201ENST00000249330 NCOA2Q15596 1464 aa29.43■■■□□ 2.3
VGF-201ENST00000249330 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.42■■■□□ 2.3
VGF-201ENST00000249330 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.41■■■□□ 2.3
VGF-201ENST00000249330 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.36■■■□□ 2.29
VGF-201ENST00000249330 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
VGF-201ENST00000249330 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.31■■■□□ 2.28
VGF-201ENST00000249330 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.31■■■□□ 2.28
VGF-201ENST00000249330 ARHGEF11O15085 1522 aa29.28■■■□□ 2.28
VGF-201ENST00000249330 PTPRGP23470 1445 aa29.28■■■□□ 2.28
VGF-201ENST00000249330 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
VGF-201ENST00000249330 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.24■■■□□ 2.27
VGF-201ENST00000249330 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.23■■■□□ 2.27
VGF-201ENST00000249330 SHROOM2Q13796 1616 aa29.22■■■□□ 2.27
VGF-201ENST00000249330 ABCA8O94911 1581 aa29.22■■■□□ 2.27
VGF-201ENST00000249330 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.27
VGF-201ENST00000249330 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.2■■■□□ 2.27
VGF-201ENST00000249330 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.16■■■□□ 2.26
VGF-201ENST00000249330 PTPRKQ15262 1439 aa29.16■■■□□ 2.26
VGF-201ENST00000249330 ATP10BO94823 1461 aa29.16■■■□□ 2.26
VGF-201ENST00000249330 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.15■■■□□ 2.26
VGF-201ENST00000249330 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.15■■■□□ 2.26
VGF-201ENST00000249330 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
VGF-201ENST00000249330 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.1■■■□□ 2.25
VGF-201ENST00000249330 UACAQ9BZF9 1416 aa29.07■■■□□ 2.24
VGF-201ENST00000249330 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
VGF-201ENST00000249330 MIA2Q96PC5 1412 aa29.05■■■□□ 2.24
VGF-201ENST00000249330 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.05■■■□□ 2.24
VGF-201ENST00000249330 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
VGF-201ENST00000249330 KIF14Q15058 1648 aa29.04■■■□□ 2.24
VGF-201ENST00000249330 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
VGF-201ENST00000249330 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.97■■■□□ 2.23
VGF-201ENST00000249330 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
VGF-201ENST00000249330 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
VGF-201ENST00000249330 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
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