RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216840.10

RABGGTA-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
RABGGTA-201ENST00000216840 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.44■■□□□ 1.82
RABGGTA-201ENST00000216840 GRIN2BQ13224 1484 aa26.44■■□□□ 1.82
RABGGTA-201ENST00000216840 ADAMTS12P58397 1594 aa26.43■■□□□ 1.82
RABGGTA-201ENST00000216840 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.42■■□□□ 1.82
RABGGTA-201ENST00000216840 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
RABGGTA-201ENST00000216840 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
RABGGTA-201ENST00000216840 P3H3Q8IVL6 736 aa26.34■■□□□ 1.81
RABGGTA-201ENST00000216840 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.34■■□□□ 1.81
RABGGTA-201ENST00000216840 SAMD9Q5K651 1589 aa26.32■■□□□ 1.8
RABGGTA-201ENST00000216840 MAP3K1Q13233 1512 aa26.32■■□□□ 1.8
RABGGTA-201ENST00000216840 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
RABGGTA-201ENST00000216840 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
RABGGTA-201ENST00000216840 TIAM1Q13009 1591 aa26.29■■□□□ 1.8
RABGGTA-201ENST00000216840 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.25■■□□□ 1.79
RABGGTA-201ENST00000216840 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.23■■□□□ 1.79
RABGGTA-201ENST00000216840 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.22■■□□□ 1.79
RABGGTA-201ENST00000216840 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.21■■□□□ 1.79
RABGGTA-201ENST00000216840 IQGAP2Q13576 1575 aa26.21■■□□□ 1.79
RABGGTA-201ENST00000216840 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
RABGGTA-201ENST00000216840 FMN1Q68DA7 1419 aa26.2■■□□□ 1.79
RABGGTA-201ENST00000216840 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
RABGGTA-201ENST00000216840 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.16■■□□□ 1.78
RABGGTA-201ENST00000216840 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
RABGGTA-201ENST00000216840 GRIN2AQ12879 1464 aa26.14■■□□□ 1.77
RABGGTA-201ENST00000216840 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
RABGGTA-201ENST00000216840 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
RABGGTA-201ENST00000216840 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
RABGGTA-201ENST00000216840 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.08■■□□□ 1.77
RABGGTA-201ENST00000216840 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.08■■□□□ 1.77
RABGGTA-201ENST00000216840 SYNJ2O15056 1496 aa26.07■■□□□ 1.76
RABGGTA-201ENST00000216840 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.05■■□□□ 1.76
RABGGTA-201ENST00000216840 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.02■■□□□ 1.76
RABGGTA-201ENST00000216840 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
RABGGTA-201ENST00000216840 CEP170Q5SW79 1584 aa25.99■■□□□ 1.75
RABGGTA-201ENST00000216840 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.96■■□□□ 1.75
RABGGTA-201ENST00000216840 KIAA0556O60303 1618 aa25.95■■□□□ 1.74
RABGGTA-201ENST00000216840 DISP1Q96F81 1524 aa25.94■■□□□ 1.74
RABGGTA-201ENST00000216840 NUP160Q12769 1436 aa25.92■■□□□ 1.74
RABGGTA-201ENST00000216840 HECW1Q76N89 1606 aa25.91■■□□□ 1.74
RABGGTA-201ENST00000216840 FBLN2P98095 1184 aa25.91■■□□□ 1.74
RABGGTA-201ENST00000216840 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.88■■□□□ 1.73
RABGGTA-201ENST00000216840 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.86■■□□□ 1.73
RABGGTA-201ENST00000216840 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.83■■□□□ 1.72
RABGGTA-201ENST00000216840 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
RABGGTA-201ENST00000216840 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
RABGGTA-201ENST00000216840 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.79■■□□□ 1.72
RABGGTA-201ENST00000216840 NCOA2Q15596 1464 aa25.76■■□□□ 1.71
RABGGTA-201ENST00000216840 ITGAEP38570 1179 aa25.76■■□□□ 1.71
RABGGTA-201ENST00000216840 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.75■■□□□ 1.71
RABGGTA-201ENST00000216840 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
RABGGTA-201ENST00000216840 JPH4Q96JJ6 628 aa25.75■■□□□ 1.71
RABGGTA-201ENST00000216840 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.74■■□□□ 1.71
RABGGTA-201ENST00000216840 CHD1O14646 1710 aa25.74■■□□□ 1.71
RABGGTA-201ENST00000216840 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
RABGGTA-201ENST00000216840 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.73■■□□□ 1.71
RABGGTA-201ENST00000216840 ARHGEF11O15085 1522 aa25.72■■□□□ 1.71
RABGGTA-201ENST00000216840 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.72■■□□□ 1.71
RABGGTA-201ENST00000216840 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
RABGGTA-201ENST00000216840 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.68■■□□□ 1.7
RABGGTA-201ENST00000216840 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
RABGGTA-201ENST00000216840 ARID3CA6NKF2 412 aa25.63■■□□□ 1.69
RABGGTA-201ENST00000216840 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.61■■□□□ 1.69
RABGGTA-201ENST00000216840 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.6■■□□□ 1.69
RABGGTA-201ENST00000216840 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.6■■□□□ 1.69
RABGGTA-201ENST00000216840 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.58■■□□□ 1.69
RABGGTA-201ENST00000216840 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.58■■□□□ 1.69
RABGGTA-201ENST00000216840 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
RABGGTA-201ENST00000216840 ABCA8O94911 1581 aa25.55■■□□□ 1.68
RABGGTA-201ENST00000216840 SHROOM2Q13796 1616 aa25.54■■□□□ 1.68
RABGGTA-201ENST00000216840 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
RABGGTA-201ENST00000216840 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
RABGGTA-201ENST00000216840 PTPRKQ15262 1439 aa25.49■■□□□ 1.67
RABGGTA-201ENST00000216840 MIA2Q96PC5 1412 aa25.48■■□□□ 1.67
RABGGTA-201ENST00000216840 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
RABGGTA-201ENST00000216840 PTPRGP23470 1445 aa25.43■■□□□ 1.66
RABGGTA-201ENST00000216840 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.43■■□□□ 1.66
RABGGTA-201ENST00000216840 HFM1A2PYH4 1435 aa25.4■■□□□ 1.66
RABGGTA-201ENST00000216840 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.4■■□□□ 1.66
RABGGTA-201ENST00000216840 ATP10BO94823 1461 aa25.39■■□□□ 1.66
RABGGTA-201ENST00000216840 MAPKBP1O60336 1514 aa25.39■■□□□ 1.65
RABGGTA-201ENST00000216840 KIF14Q15058 1648 aa25.37■■□□□ 1.65
RABGGTA-201ENST00000216840 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.36■■□□□ 1.65
RABGGTA-201ENST00000216840 NAIPQ13075 1403 aa25.34■■□□□ 1.65
RABGGTA-201ENST00000216840 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.34■■□□□ 1.65
RABGGTA-201ENST00000216840 UACAQ9BZF9 1416 aa25.3■■□□□ 1.64
RABGGTA-201ENST00000216840 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.29■■□□□ 1.64
RABGGTA-201ENST00000216840 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.29■■□□□ 1.64
RABGGTA-201ENST00000216840 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
RABGGTA-201ENST00000216840 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
RABGGTA-201ENST00000216840 AKNAQ7Z591 1439 aa25.27■■□□□ 1.64
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
RABGGTA-201ENST00000216840 DAPK1P53355 1430 aa25.25■■□□□ 1.63
RABGGTA-201ENST00000216840 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.24■■□□□ 1.63
RABGGTA-201ENST00000216840 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.24■■□□□ 1.63
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
RABGGTA-201ENST00000216840 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.23■■□□□ 1.63
RABGGTA-201ENST00000216840 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.22■■□□□ 1.63
RABGGTA-201ENST00000216840 ABCC5O15440 1437 aa25.22■■□□□ 1.63
RABGGTA-201ENST00000216840 ABCC2Q92887 1545 aa25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms