RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215794.7

USP18-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP18, Length 2,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18-201ENST00000215794 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
USP18-201ENST00000215794 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
USP18-201ENST00000215794 CLIP1P30622 1438 aa28.14■■■□□ 2.1
USP18-201ENST00000215794 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
USP18-201ENST00000215794 SYNJ2O15056 1496 aa28.08■■■□□ 2.09
USP18-201ENST00000215794 GRIN2AQ12879 1464 aa28.05■■■□□ 2.08
USP18-201ENST00000215794 CHD1O14646 1710 aa28.02■■■□□ 2.08
USP18-201ENST00000215794 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.96■■■□□ 2.07
USP18-201ENST00000215794 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.94■■■□□ 2.06
USP18-201ENST00000215794 CEP170Q5SW79 1584 aa27.93■■■□□ 2.06
USP18-201ENST00000215794 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
USP18-201ENST00000215794 NUP160Q12769 1436 aa27.83■■■□□ 2.05
USP18-201ENST00000215794 ARAP1Q96P48 1450 aa27.81■■■□□ 2.04
USP18-201ENST00000215794 P3H3Q8IVL6 736 aa27.8■■■□□ 2.04
USP18-201ENST00000215794 IQGAP2Q13576 1575 aa27.8■■■□□ 2.04
USP18-201ENST00000215794 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
USP18-201ENST00000215794 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.77■■■□□ 2.04
USP18-201ENST00000215794 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.74■■■□□ 2.03
USP18-201ENST00000215794 APLP2Q06481 763 aa27.7■■■□□ 2.03
USP18-201ENST00000215794 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.66■■■□□ 2.02
USP18-201ENST00000215794 JPH4Q96JJ6 628 aa27.65■■■□□ 2.02
USP18-201ENST00000215794 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
USP18-201ENST00000215794 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.62■■■□□ 2.01
USP18-201ENST00000215794 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.61■■■□□ 2.01
USP18-201ENST00000215794 SAMD9Q5K651 1589 aa27.61■■■□□ 2.01
USP18-201ENST00000215794 OSCARQ8IYS5 282 aa27.61■■■□□ 2.01
USP18-201ENST00000215794 DISP1Q96F81 1524 aa27.59■■■□□ 2.01
USP18-201ENST00000215794 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.57■■■□□ 2
USP18-201ENST00000215794 KIAA0556O60303 1618 aa27.54■■■□□ 2
USP18-201ENST00000215794 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.54■■■□□ 2
USP18-201ENST00000215794 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
USP18-201ENST00000215794 SHROOM2Q13796 1616 aa27.51■■□□□ 1.99
USP18-201ENST00000215794 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
USP18-201ENST00000215794 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
USP18-201ENST00000215794 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.43■■□□□ 1.98
USP18-201ENST00000215794 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
USP18-201ENST00000215794 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
USP18-201ENST00000215794 ARID3CA6NKF2 412 aa27.35■■□□□ 1.97
USP18-201ENST00000215794 FMN1Q68DA7 1419 aa27.34■■□□□ 1.97
USP18-201ENST00000215794 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.3■■□□□ 1.96
USP18-201ENST00000215794 PTPRGP23470 1445 aa27.28■■□□□ 1.96
USP18-201ENST00000215794 TIAM1Q13009 1591 aa27.27■■□□□ 1.96
USP18-201ENST00000215794 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.26■■□□□ 1.95
USP18-201ENST00000215794 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.23■■□□□ 1.95
USP18-201ENST00000215794 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.22■■□□□ 1.95
USP18-201ENST00000215794 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
USP18-201ENST00000215794 MAP3K1Q13233 1512 aa27.21■■□□□ 1.95
USP18-201ENST00000215794 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.2■■□□□ 1.94
USP18-201ENST00000215794 ARHGEF11O15085 1522 aa27.19■■□□□ 1.94
USP18-201ENST00000215794 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
USP18-201ENST00000215794 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
USP18-201ENST00000215794 ABCA8O94911 1581 aa27.15■■□□□ 1.94
USP18-201ENST00000215794 HECW1Q76N89 1606 aa27.15■■□□□ 1.94
USP18-201ENST00000215794 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.15■■□□□ 1.94
USP18-201ENST00000215794 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.14■■□□□ 1.94
USP18-201ENST00000215794 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.12■■□□□ 1.93
USP18-201ENST00000215794 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.12■■□□□ 1.93
USP18-201ENST00000215794 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.12■■□□□ 1.93
USP18-201ENST00000215794 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.12■■□□□ 1.93
USP18-201ENST00000215794 UACAQ9BZF9 1416 aa27.1■■□□□ 1.93
USP18-201ENST00000215794 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
USP18-201ENST00000215794 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.03■■□□□ 1.92
USP18-201ENST00000215794 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.03■■□□□ 1.92
USP18-201ENST00000215794 ABCC2Q92887 1545 aa27.02■■□□□ 1.92
USP18-201ENST00000215794 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.01■■□□□ 1.91
USP18-201ENST00000215794 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.01■■□□□ 1.91
USP18-201ENST00000215794 ATP10BO94823 1461 aa27■■□□□ 1.91
USP18-201ENST00000215794 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27■■□□□ 1.91
USP18-201ENST00000215794 ITGAEP38570 1179 aa26.99■■□□□ 1.91
USP18-201ENST00000215794 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.94■■□□□ 1.9
USP18-201ENST00000215794 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
USP18-201ENST00000215794 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.91■■□□□ 1.9
USP18-201ENST00000215794 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
USP18-201ENST00000215794 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.85■■□□□ 1.89
USP18-201ENST00000215794 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
USP18-201ENST00000215794 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.84■■□□□ 1.89
USP18-201ENST00000215794 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.81■■□□□ 1.88
USP18-201ENST00000215794 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
USP18-201ENST00000215794 KIF14Q15058 1648 aa26.8■■□□□ 1.88
USP18-201ENST00000215794 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
USP18-201ENST00000215794 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.78■■□□□ 1.88
USP18-201ENST00000215794 NCOA2Q15596 1464 aa26.78■■□□□ 1.88
USP18-201ENST00000215794 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.77■■□□□ 1.88
USP18-201ENST00000215794 KCNH8Q96L42 1107 aa26.77■■□□□ 1.88
USP18-201ENST00000215794 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
USP18-201ENST00000215794 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
USP18-201ENST00000215794 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.74■■□□□ 1.87
USP18-201ENST00000215794 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
USP18-201ENST00000215794 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.74■■□□□ 1.87
USP18-201ENST00000215794 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.71■■□□□ 1.87
USP18-201ENST00000215794 ASXL2Q76L83 1435 aa26.7■■□□□ 1.87
USP18-201ENST00000215794 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.7■■□□□ 1.87
USP18-201ENST00000215794 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.66■■□□□ 1.86
USP18-201ENST00000215794 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.65■■□□□ 1.86
USP18-201ENST00000215794 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.62■■□□□ 1.85
USP18-201ENST00000215794 MAPKBP1O60336 1514 aa26.61■■□□□ 1.85
USP18-201ENST00000215794 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.6■■□□□ 1.85
USP18-201ENST00000215794 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.6■■□□□ 1.85
USP18-201ENST00000215794 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.6■■□□□ 1.85
USP18-201ENST00000215794 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.2 ms