RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215794.7

USP18-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP18, Length 2,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18-201ENST00000215794 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.47■■■■■ 4.07
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USP18-201ENST00000215794 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.31■■■□□ 2.92
USP18-201ENST00000215794 NACADO15069 1562 aa33.13■■■□□ 2.89
USP18-201ENST00000215794 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.07■■■□□ 2.89
USP18-201ENST00000215794 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33■■■□□ 2.87
USP18-201ENST00000215794 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.92■■■□□ 2.86
USP18-201ENST00000215794 SCRIBQ14160 1630 aa32.73■■■□□ 2.83
USP18-201ENST00000215794 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.44■■■□□ 2.78
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USP18-201ENST00000215794 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.1■■■□□ 2.73
USP18-201ENST00000215794 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.94■■■□□ 2.7
USP18-201ENST00000215794 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.61■■■□□ 2.65
USP18-201ENST00000215794 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.33■■■□□ 2.61
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USP18-201ENST00000215794 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.24■■■□□ 2.59
USP18-201ENST00000215794 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
USP18-201ENST00000215794 WIZO95785 1651 aa31.08■■■□□ 2.57
USP18-201ENST00000215794 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.87■■■□□ 2.53
USP18-201ENST00000215794 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.85■■■□□ 2.53
USP18-201ENST00000215794 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.83■■■□□ 2.53
USP18-201ENST00000215794 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.78■■■□□ 2.52
USP18-201ENST00000215794 SMARCA2P51531 1590 aa30.75■■■□□ 2.51
USP18-201ENST00000215794 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.68■■■□□ 2.5
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USP18-201ENST00000215794 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.37■■■□□ 2.45
USP18-201ENST00000215794 NESP48681 1621 aa29.88■■■□□ 2.37
USP18-201ENST00000215794 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.84■■■□□ 2.37
USP18-201ENST00000215794 TRIM41Q8WV44 630 aa29.84■■■□□ 2.37
USP18-201ENST00000215794 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.83■■■□□ 2.37
USP18-201ENST00000215794 CFTRP13569 1480 aa29.82■■■□□ 2.36
USP18-201ENST00000215794 ABCC8Q09428 1581 aa29.67■■■□□ 2.34
USP18-201ENST00000215794 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.65■■■□□ 2.34
USP18-201ENST00000215794 PRDM2Q13029 1718 aa29.61■■■□□ 2.33
USP18-201ENST00000215794 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.54■■■□□ 2.32
USP18-201ENST00000215794 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
USP18-201ENST00000215794 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.47■■■□□ 2.31
USP18-201ENST00000215794 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.44■■■□□ 2.3
USP18-201ENST00000215794 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.41■■■□□ 2.3
USP18-201ENST00000215794 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.38■■■□□ 2.29
USP18-201ENST00000215794 SYNJ1O43426 1573 aa29.38■■■□□ 2.29
USP18-201ENST00000215794 ERCC6Q03468 1493 aa29.31■■■□□ 2.28
USP18-201ENST00000215794 CUX1P39880 1505 aa29.31■■■□□ 2.28
USP18-201ENST00000215794 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.25■■■□□ 2.27
USP18-201ENST00000215794 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
USP18-201ENST00000215794 TOP2BQ02880 1626 aa29.2■■■□□ 2.27
USP18-201ENST00000215794 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.18■■■□□ 2.26
USP18-201ENST00000215794 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.16■■■□□ 2.26
USP18-201ENST00000215794 TOPBP1Q92547 1522 aa29.16■■■□□ 2.26
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USP18-201ENST00000215794 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.13■■■□□ 2.25
USP18-201ENST00000215794 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.07■■■□□ 2.24
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USP18-201ENST00000215794 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.97■■■□□ 2.23
USP18-201ENST00000215794 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.93■■■□□ 2.22
USP18-201ENST00000215794 CUX2O14529 1486 aa28.85■■■□□ 2.21
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USP18-201ENST00000215794 EEA1Q15075 1411 aa28.75■■■□□ 2.19
USP18-201ENST00000215794 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
USP18-201ENST00000215794 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.72■■■□□ 2.19
USP18-201ENST00000215794 WDR97A6NE52 1622 aa28.71■■■□□ 2.19
USP18-201ENST00000215794 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.7■■■□□ 2.19
USP18-201ENST00000215794 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
USP18-201ENST00000215794 KIF27Q86VH2 1401 aa28.67■■■□□ 2.18
USP18-201ENST00000215794 IFT140Q96RY7 1462 aa28.66■■■□□ 2.18
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USP18-201ENST00000215794 CEP162Q5TB80 1403 aa28.55■■■□□ 2.16
USP18-201ENST00000215794 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.55■■■□□ 2.16
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USP18-201ENST00000215794 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.35■■■□□ 2.13
USP18-201ENST00000215794 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.32■■■□□ 2.12
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USP18-201ENST00000215794 ADAMTS12P58397 1594 aa28.24■■■□□ 2.11
USP18-201ENST00000215794 FBLN2P98095 1184 aa28.2■■■□□ 2.1
USP18-201ENST00000215794 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.18■■■□□ 2.1
USP18-201ENST00000215794 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
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