RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000202834.11

TMEM230-201, Transcript of transmembrane protein 230, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM230, Length 1,472 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM230-201ENST00000202834 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
TMEM230-201ENST00000202834 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.3■■□□□ 1.32
TMEM230-201ENST00000202834 ARAP1Q96P48 1450 aa23.29■■□□□ 1.32
TMEM230-201ENST00000202834 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.28■■□□□ 1.32
TMEM230-201ENST00000202834 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.26■■□□□ 1.31
TMEM230-201ENST00000202834 SYNJ2O15056 1496 aa23.21■■□□□ 1.31
TMEM230-201ENST00000202834 GRIN2AQ12879 1464 aa23.19■■□□□ 1.3
TMEM230-201ENST00000202834 IQGAP2Q13576 1575 aa23.18■■□□□ 1.3
TMEM230-201ENST00000202834 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
TMEM230-201ENST00000202834 SAMD9Q5K651 1589 aa23.14■■□□□ 1.3
TMEM230-201ENST00000202834 FMN1Q68DA7 1419 aa23.13■■□□□ 1.29
TMEM230-201ENST00000202834 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.12■■□□□ 1.29
TMEM230-201ENST00000202834 MAP3K1Q13233 1512 aa23.08■■□□□ 1.29
TMEM230-201ENST00000202834 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
TMEM230-201ENST00000202834 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.05■■□□□ 1.28
TMEM230-201ENST00000202834 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.05■■□□□ 1.28
TMEM230-201ENST00000202834 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.05■■□□□ 1.28
TMEM230-201ENST00000202834 FBLN2P98095 1184 aa23.02■■□□□ 1.28
TMEM230-201ENST00000202834 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.01■■□□□ 1.27
TMEM230-201ENST00000202834 P3H3Q8IVL6 736 aa23■■□□□ 1.27
TMEM230-201ENST00000202834 NUP160Q12769 1436 aa23■■□□□ 1.27
TMEM230-201ENST00000202834 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
TMEM230-201ENST00000202834 CEP170Q5SW79 1584 aa22.97■■□□□ 1.27
TMEM230-201ENST00000202834 TIAM1Q13009 1591 aa22.97■■□□□ 1.27
TMEM230-201ENST00000202834 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.95■■□□□ 1.26
TMEM230-201ENST00000202834 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
TMEM230-201ENST00000202834 KIAA0556O60303 1618 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM230-201ENST00000202834 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM230-201ENST00000202834 CHD1O14646 1710 aa22.9■■□□□ 1.26
TMEM230-201ENST00000202834 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
TMEM230-201ENST00000202834 HECW1Q76N89 1606 aa22.87■■□□□ 1.25
TMEM230-201ENST00000202834 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.86■■□□□ 1.25
TMEM230-201ENST00000202834 DISP1Q96F81 1524 aa22.84■■□□□ 1.25
TMEM230-201ENST00000202834 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.84■■□□□ 1.25
TMEM230-201ENST00000202834 JPH4Q96JJ6 628 aa22.82■■□□□ 1.24
TMEM230-201ENST00000202834 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
TMEM230-201ENST00000202834 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.73■■□□□ 1.23
TMEM230-201ENST00000202834 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.73■■□□□ 1.23
TMEM230-201ENST00000202834 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.71■■□□□ 1.23
TMEM230-201ENST00000202834 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
TMEM230-201ENST00000202834 SHROOM2Q13796 1616 aa22.69■■□□□ 1.22
TMEM230-201ENST00000202834 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
TMEM230-201ENST00000202834 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.68■■□□□ 1.22
TMEM230-201ENST00000202834 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
TMEM230-201ENST00000202834 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
TMEM230-201ENST00000202834 HRCP23327 699 aa22.66■■□□□ 1.22
TMEM230-201ENST00000202834 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
TMEM230-201ENST00000202834 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.65■■□□□ 1.22
TMEM230-201ENST00000202834 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
TMEM230-201ENST00000202834 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.63■■□□□ 1.21
TMEM230-201ENST00000202834 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
TMEM230-201ENST00000202834 PTPRGP23470 1445 aa22.58■■□□□ 1.21
TMEM230-201ENST00000202834 ABCA8O94911 1581 aa22.56■■□□□ 1.2
TMEM230-201ENST00000202834 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.2
TMEM230-201ENST00000202834 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
TMEM230-201ENST00000202834 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.55■■□□□ 1.2
TMEM230-201ENST00000202834 NCOA2Q15596 1464 aa22.54■■□□□ 1.2
TMEM230-201ENST00000202834 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.54■■□□□ 1.2
TMEM230-201ENST00000202834 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
TMEM230-201ENST00000202834 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
TMEM230-201ENST00000202834 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.5■■□□□ 1.19
TMEM230-201ENST00000202834 ARHGEF11O15085 1522 aa22.48■■□□□ 1.19
TMEM230-201ENST00000202834 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.48■■□□□ 1.19
TMEM230-201ENST00000202834 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.46■■□□□ 1.19
TMEM230-201ENST00000202834 UACAQ9BZF9 1416 aa22.46■■□□□ 1.19
TMEM230-201ENST00000202834 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
TMEM230-201ENST00000202834 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
TMEM230-201ENST00000202834 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
TMEM230-201ENST00000202834 OSCARQ8IYS5 282 aa22.44■■□□□ 1.18
TMEM230-201ENST00000202834 MIA2Q96PC5 1412 aa22.42■■□□□ 1.18
TMEM230-201ENST00000202834 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.42■■□□□ 1.18
TMEM230-201ENST00000202834 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.41■■□□□ 1.18
TMEM230-201ENST00000202834 ARID3CA6NKF2 412 aa22.41■■□□□ 1.18
TMEM230-201ENST00000202834 ABCC2Q92887 1545 aa22.4■■□□□ 1.18
TMEM230-201ENST00000202834 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.38■■□□□ 1.17
TMEM230-201ENST00000202834 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.38■■□□□ 1.17
TMEM230-201ENST00000202834 ATP10BO94823 1461 aa22.38■■□□□ 1.17
TMEM230-201ENST00000202834 KIF14Q15058 1648 aa22.37■■□□□ 1.17
TMEM230-201ENST00000202834 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.36■■□□□ 1.17
TMEM230-201ENST00000202834 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.35■■□□□ 1.17
TMEM230-201ENST00000202834 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
TMEM230-201ENST00000202834 ITGAEP38570 1179 aa22.33■■□□□ 1.16
TMEM230-201ENST00000202834 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.26■■□□□ 1.15
TMEM230-201ENST00000202834 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.25■■□□□ 1.15
TMEM230-201ENST00000202834 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.23■■□□□ 1.15
TMEM230-201ENST00000202834 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
TMEM230-201ENST00000202834 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
TMEM230-201ENST00000202834 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
TMEM230-201ENST00000202834 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
TMEM230-201ENST00000202834 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.18■■□□□ 1.14
TMEM230-201ENST00000202834 AKNAQ7Z591 1439 aa22.17■■□□□ 1.14
TMEM230-201ENST00000202834 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.17■■□□□ 1.14
TMEM230-201ENST00000202834 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.17■■□□□ 1.14
TMEM230-201ENST00000202834 HFM1A2PYH4 1435 aa22.16■■□□□ 1.14
TMEM230-201ENST00000202834 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TMEM230-201ENST00000202834 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.14■■□□□ 1.13
TMEM230-201ENST00000202834 PREX2Q70Z35 1606 aa22.11■■□□□ 1.13
TMEM230-201ENST00000202834 DAPK1P53355 1430 aa22.1■■□□□ 1.13
TMEM230-201ENST00000202834 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
TMEM230-201ENST00000202834 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.5 ms