RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000202834.11

TMEM230-201, Transcript of transmembrane protein 230, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM230, Length 1,472 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM230-201ENST00000202834 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.73■■■□□ 2.99
TMEM230-201ENST00000202834 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.54■■■□□ 2.32
TMEM230-201ENST00000202834 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
TMEM230-201ENST00000202834 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28■■■□□ 2.07
TMEM230-201ENST00000202834 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.78■■■□□ 2.04
TMEM230-201ENST00000202834 ABCC9O60706 1549 aa27.69■■■□□ 2.02
TMEM230-201ENST00000202834 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.69■■■□□ 2.02
TMEM230-201ENST00000202834 NACADO15069 1562 aa27.49■■□□□ 1.99
TMEM230-201ENST00000202834 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.37■■□□□ 1.97
TMEM230-201ENST00000202834 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.25■■□□□ 1.95
TMEM230-201ENST00000202834 SCRIBQ14160 1630 aa27■■□□□ 1.91
TMEM230-201ENST00000202834 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.56■■□□□ 1.84
TMEM230-201ENST00000202834 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
TMEM230-201ENST00000202834 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.23■■□□□ 1.79
TMEM230-201ENST00000202834 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
TMEM230-201ENST00000202834 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
TMEM230-201ENST00000202834 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.05■■□□□ 1.76
TMEM230-201ENST00000202834 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.05■■□□□ 1.76
TMEM230-201ENST00000202834 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.97■■□□□ 1.75
TMEM230-201ENST00000202834 SMARCA4P51532 1647 aa25.94■■□□□ 1.74
TMEM230-201ENST00000202834 WIZO95785 1651 aa25.77■■□□□ 1.72
TMEM230-201ENST00000202834 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.65■■□□□ 1.7
TMEM230-201ENST00000202834 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
TMEM230-201ENST00000202834 SMARCA2P51531 1590 aa25.59■■□□□ 1.69
TMEM230-201ENST00000202834 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
TMEM230-201ENST00000202834 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.47■■□□□ 1.67
TMEM230-201ENST00000202834 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
TMEM230-201ENST00000202834 HMGXB3Q12766 1538 aa25.32■■□□□ 1.64
TMEM230-201ENST00000202834 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.3■■□□□ 1.64
TMEM230-201ENST00000202834 NCAPD3P42695 1498 aa25.29■■□□□ 1.64
TMEM230-201ENST00000202834 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.27■■□□□ 1.64
TMEM230-201ENST00000202834 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.11■■□□□ 1.61
TMEM230-201ENST00000202834 TRIM41Q8WV44 630 aa24.96■■□□□ 1.59
TMEM230-201ENST00000202834 PRDM2Q13029 1718 aa24.73■■□□□ 1.55
TMEM230-201ENST00000202834 CFTRP13569 1480 aa24.72■■□□□ 1.55
TMEM230-201ENST00000202834 ABCC8Q09428 1581 aa24.69■■□□□ 1.54
TMEM230-201ENST00000202834 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.66■■□□□ 1.54
TMEM230-201ENST00000202834 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.64■■□□□ 1.53
TMEM230-201ENST00000202834 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.5■■□□□ 1.51
TMEM230-201ENST00000202834 EEA1Q15075 1411 aa24.47■■□□□ 1.51
TMEM230-201ENST00000202834 SYNJ1O43426 1573 aa24.47■■□□□ 1.51
TMEM230-201ENST00000202834 TOP2BQ02880 1626 aa24.47■■□□□ 1.51
TMEM230-201ENST00000202834 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.46■■□□□ 1.51
TMEM230-201ENST00000202834 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.36■■□□□ 1.49
TMEM230-201ENST00000202834 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
TMEM230-201ENST00000202834 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.32■■□□□ 1.48
TMEM230-201ENST00000202834 CUX1P39880 1505 aa24.3■■□□□ 1.48
TMEM230-201ENST00000202834 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.26■■□□□ 1.47
TMEM230-201ENST00000202834 NESP48681 1621 aa24.25■■□□□ 1.47
TMEM230-201ENST00000202834 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.23■■□□□ 1.47
TMEM230-201ENST00000202834 SOGA1O94964 1423 aa24.22■■□□□ 1.47
TMEM230-201ENST00000202834 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.2■■□□□ 1.46
TMEM230-201ENST00000202834 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.19■■□□□ 1.46
TMEM230-201ENST00000202834 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.18■■□□□ 1.46
TMEM230-201ENST00000202834 KIF27Q86VH2 1401 aa24.1■■□□□ 1.45
TMEM230-201ENST00000202834 TOPBP1Q92547 1522 aa24.09■■□□□ 1.45
TMEM230-201ENST00000202834 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.08■■□□□ 1.45
TMEM230-201ENST00000202834 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.07■■□□□ 1.44
TMEM230-201ENST00000202834 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.07■■□□□ 1.44
TMEM230-201ENST00000202834 KIF21BO75037 1637 aa24.06■■□□□ 1.44
TMEM230-201ENST00000202834 GOLGA3Q08378 1498 aa24.04■■□□□ 1.44
TMEM230-201ENST00000202834 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
TMEM230-201ENST00000202834 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.96■■□□□ 1.43
TMEM230-201ENST00000202834 CUX2O14529 1486 aa23.95■■□□□ 1.42
TMEM230-201ENST00000202834 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
TMEM230-201ENST00000202834 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.94■■□□□ 1.42
TMEM230-201ENST00000202834 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.92■■□□□ 1.42
TMEM230-201ENST00000202834 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.91■■□□□ 1.42
TMEM230-201ENST00000202834 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.91■■□□□ 1.42
TMEM230-201ENST00000202834 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
TMEM230-201ENST00000202834 ERCC6Q03468 1493 aa23.89■■□□□ 1.41
TMEM230-201ENST00000202834 PRXQ9BXM0 1461 aa23.84■■□□□ 1.41
TMEM230-201ENST00000202834 WDR97A6NE52 1622 aa23.81■■□□□ 1.4
TMEM230-201ENST00000202834 WDR62O43379 1518 aa23.81■■□□□ 1.4
TMEM230-201ENST00000202834 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.8■■□□□ 1.4
TMEM230-201ENST00000202834 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.78■■□□□ 1.4
TMEM230-201ENST00000202834 CEP162Q5TB80 1403 aa23.77■■□□□ 1.4
TMEM230-201ENST00000202834 IGF1RP08069 1367 aa23.75■■□□□ 1.39
TMEM230-201ENST00000202834 CUL7Q14999 1698 aa23.74■■□□□ 1.39
TMEM230-201ENST00000202834 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.39
TMEM230-201ENST00000202834 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.7■■□□□ 1.38
TMEM230-201ENST00000202834 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.7■■□□□ 1.38
TMEM230-201ENST00000202834 IFT140Q96RY7 1462 aa23.69■■□□□ 1.38
TMEM230-201ENST00000202834 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
TMEM230-201ENST00000202834 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.67■■□□□ 1.38
TMEM230-201ENST00000202834 CLIP1P30622 1438 aa23.61■■□□□ 1.37
TMEM230-201ENST00000202834 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
TMEM230-201ENST00000202834 PBRM1Q86U86 1689 aa23.56■■□□□ 1.36
TMEM230-201ENST00000202834 GRIN2BQ13224 1484 aa23.51■■□□□ 1.35
TMEM230-201ENST00000202834 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.45■■□□□ 1.34
TMEM230-201ENST00000202834 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.44■■□□□ 1.34
TMEM230-201ENST00000202834 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.34
TMEM230-201ENST00000202834 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.42■■□□□ 1.34
TMEM230-201ENST00000202834 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
TMEM230-201ENST00000202834 ADAMTS12P58397 1594 aa23.4■■□□□ 1.34
TMEM230-201ENST00000202834 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
TMEM230-201ENST00000202834 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
TMEM230-201ENST00000202834 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
TMEM230-201ENST00000202834 APLP2Q06481 763 aa23.35■■□□□ 1.33
TMEM230-201ENST00000202834 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10 ms