RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000188376.9

SLC25A3-201, Transcript of solute carrier family 25 member 3, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A3, Length 1,909 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A3-201ENST00000188376 ADAMTS12P58397 1594 aa30.05■■■□□ 2.4
SLC25A3-201ENST00000188376 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.03■■■□□ 2.4
SLC25A3-201ENST00000188376 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
SLC25A3-201ENST00000188376 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.94■■■□□ 2.38
SLC25A3-201ENST00000188376 APLP2Q06481 763 aa29.88■■■□□ 2.37
SLC25A3-201ENST00000188376 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.85■■■□□ 2.37
SLC25A3-201ENST00000188376 P3H3Q8IVL6 736 aa29.84■■■□□ 2.37
SLC25A3-201ENST00000188376 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
SLC25A3-201ENST00000188376 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.79■■■□□ 2.36
SLC25A3-201ENST00000188376 GRIN2AQ12879 1464 aa29.77■■■□□ 2.36
SLC25A3-201ENST00000188376 IQGAP2Q13576 1575 aa29.74■■■□□ 2.35
SLC25A3-201ENST00000188376 SAMD9Q5K651 1589 aa29.74■■■□□ 2.35
SLC25A3-201ENST00000188376 SYNJ2O15056 1496 aa29.74■■■□□ 2.35
SLC25A3-201ENST00000188376 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
SLC25A3-201ENST00000188376 FBLN2P98095 1184 aa29.67■■■□□ 2.34
SLC25A3-201ENST00000188376 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
SLC25A3-201ENST00000188376 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.63■■■□□ 2.33
SLC25A3-201ENST00000188376 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
SLC25A3-201ENST00000188376 FMN1Q68DA7 1419 aa29.6■■■□□ 2.33
SLC25A3-201ENST00000188376 CEP170Q5SW79 1584 aa29.59■■■□□ 2.33
SLC25A3-201ENST00000188376 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.57■■■□□ 2.32
SLC25A3-201ENST00000188376 TIAM1Q13009 1591 aa29.56■■■□□ 2.32
SLC25A3-201ENST00000188376 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.56■■■□□ 2.32
SLC25A3-201ENST00000188376 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.55■■■□□ 2.32
SLC25A3-201ENST00000188376 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
SLC25A3-201ENST00000188376 MAP3K1Q13233 1512 aa29.54■■■□□ 2.32
SLC25A3-201ENST00000188376 NUP160Q12769 1436 aa29.51■■■□□ 2.31
SLC25A3-201ENST00000188376 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.49■■■□□ 2.31
SLC25A3-201ENST00000188376 HRCP23327 699 aa29.45■■■□□ 2.31
SLC25A3-201ENST00000188376 DISP1Q96F81 1524 aa29.44■■■□□ 2.3
SLC25A3-201ENST00000188376 KIAA0556O60303 1618 aa29.44■■■□□ 2.3
SLC25A3-201ENST00000188376 CHD1O14646 1710 aa29.43■■■□□ 2.3
SLC25A3-201ENST00000188376 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.42■■■□□ 2.3
SLC25A3-201ENST00000188376 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.38■■■□□ 2.29
SLC25A3-201ENST00000188376 JPH4Q96JJ6 628 aa29.34■■■□□ 2.29
SLC25A3-201ENST00000188376 HECW1Q76N89 1606 aa29.29■■■□□ 2.28
SLC25A3-201ENST00000188376 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.26■■■□□ 2.28
SLC25A3-201ENST00000188376 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
SLC25A3-201ENST00000188376 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
SLC25A3-201ENST00000188376 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.23■■■□□ 2.27
SLC25A3-201ENST00000188376 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.2■■■□□ 2.26
SLC25A3-201ENST00000188376 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
SLC25A3-201ENST00000188376 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.19■■■□□ 2.26
SLC25A3-201ENST00000188376 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.17■■■□□ 2.26
SLC25A3-201ENST00000188376 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.17■■■□□ 2.26
SLC25A3-201ENST00000188376 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
SLC25A3-201ENST00000188376 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
SLC25A3-201ENST00000188376 ARID3CA6NKF2 412 aa29.14■■■□□ 2.25
SLC25A3-201ENST00000188376 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.25
SLC25A3-201ENST00000188376 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.12■■■□□ 2.25
SLC25A3-201ENST00000188376 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
SLC25A3-201ENST00000188376 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.11■■■□□ 2.25
SLC25A3-201ENST00000188376 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.1■■■□□ 2.25
SLC25A3-201ENST00000188376 SHROOM2Q13796 1616 aa29.1■■■□□ 2.25
SLC25A3-201ENST00000188376 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
SLC25A3-201ENST00000188376 NCOA2Q15596 1464 aa29.04■■■□□ 2.24
SLC25A3-201ENST00000188376 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
SLC25A3-201ENST00000188376 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.03■■■□□ 2.24
SLC25A3-201ENST00000188376 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
SLC25A3-201ENST00000188376 ABCA8O94911 1581 aa28.99■■■□□ 2.23
SLC25A3-201ENST00000188376 ITGAEP38570 1179 aa28.98■■■□□ 2.23
SLC25A3-201ENST00000188376 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
SLC25A3-201ENST00000188376 PTPRGP23470 1445 aa28.97■■■□□ 2.23
SLC25A3-201ENST00000188376 ARHGEF11O15085 1522 aa28.96■■■□□ 2.23
SLC25A3-201ENST00000188376 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.95■■■□□ 2.23
SLC25A3-201ENST00000188376 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.95■■■□□ 2.22
SLC25A3-201ENST00000188376 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.93■■■□□ 2.22
SLC25A3-201ENST00000188376 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
SLC25A3-201ENST00000188376 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.87■■■□□ 2.21
SLC25A3-201ENST00000188376 ATP10BO94823 1461 aa28.83■■■□□ 2.21
SLC25A3-201ENST00000188376 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
SLC25A3-201ENST00000188376 UACAQ9BZF9 1416 aa28.8■■■□□ 2.2
SLC25A3-201ENST00000188376 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.8■■■□□ 2.2
SLC25A3-201ENST00000188376 KIF14Q15058 1648 aa28.73■■■□□ 2.19
SLC25A3-201ENST00000188376 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.73■■■□□ 2.19
SLC25A3-201ENST00000188376 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.73■■■□□ 2.19
SLC25A3-201ENST00000188376 MIA2Q96PC5 1412 aa28.72■■■□□ 2.19
SLC25A3-201ENST00000188376 OSCARQ8IYS5 282 aa28.71■■■□□ 2.19
SLC25A3-201ENST00000188376 ABCC2Q92887 1545 aa28.71■■■□□ 2.19
SLC25A3-201ENST00000188376 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
SLC25A3-201ENST00000188376 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.67■■■□□ 2.18
SLC25A3-201ENST00000188376 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.66■■■□□ 2.18
SLC25A3-201ENST00000188376 PTPRKQ15262 1439 aa28.65■■■□□ 2.18
SLC25A3-201ENST00000188376 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.62■■■□□ 2.17
SLC25A3-201ENST00000188376 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
SLC25A3-201ENST00000188376 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
SLC25A3-201ENST00000188376 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.58■■■□□ 2.17
SLC25A3-201ENST00000188376 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.56■■■□□ 2.16
SLC25A3-201ENST00000188376 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
SLC25A3-201ENST00000188376 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
SLC25A3-201ENST00000188376 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.54■■■□□ 2.16
SLC25A3-201ENST00000188376 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
SLC25A3-201ENST00000188376 HFM1A2PYH4 1435 aa28.51■■■□□ 2.15
SLC25A3-201ENST00000188376 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.5■■■□□ 2.15
SLC25A3-201ENST00000188376 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.49■■■□□ 2.15
SLC25A3-201ENST00000188376 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.49■■■□□ 2.15
SLC25A3-201ENST00000188376 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
SLC25A3-201ENST00000188376 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
SLC25A3-201ENST00000188376 DAPK1P53355 1430 aa28.46■■■□□ 2.15
SLC25A3-201ENST00000188376 NAIPQ13075 1403 aa28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms